RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427658.1

AFG3L1P-208, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, human

TSL 2

Gene AFG3L1P, Length 2,758 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		11.38	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CTNNAL1	Q9UBT7	734 aa		11.38	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		11.38	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NUP98	P52948	1817 aa		11.38	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	C4B	P0C0L5	1744 aa		11.37	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658		F8VZ95	297 aa		11.37	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PDE6C	P51160	858 aa		11.37	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	11.37	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		11.37	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HIC2	Q96JB3	615 aa		11.37	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SPATA16	Q9BXB7	569 aa		11.37	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NSRP1	Q9H0G5	558 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		11.37	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		11.37	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	11.37	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		11.37	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		11.37	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SCN7A	Q01118	1682 aa		11.37	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		11.37	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		11.37	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658		H7C1D1	291 aa		11.37	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ATP9A	O75110	1047 aa		11.37	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SUPT3H	O75486	399 aa		11.37	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SIK1	P57059	783 aa		11.37	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CDK17	Q00537	523 aa		11.37	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DDX27	Q96GQ7	796 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	AGAP3	Q96P47	875 aa		11.37	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RAB3IP	Q96QF0	476 aa	Predicted RBP	11.37	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		11.37	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		11.37	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		11.37	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NMRK1	Q9NWW6	199 aa		11.37	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		11.37	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	INTU	Q9ULD6	942 aa		11.37	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		11.37	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	UTRN	P46939	3433 aa		11.36	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		11.36	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NVL	O15381	856 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SUN1	O94901	812 aa		11.36	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TJP3	O95049	919 aa		11.36	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SRGN	P10124	158 aa		11.36	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCNB1	P14635	433 aa		11.36	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DNM2	P50570	870 aa		11.36	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	11.36	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NLRP5	P59047	1200 aa		11.36	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TNNI3K	Q59H18	835 aa		11.36	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		11.36	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TMC3	Q7Z5M5	1100 aa		11.36	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		11.36	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GATA6	Q92908	595 aa		11.36	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KCNN1	Q92952	543 aa		11.36	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	BRD8	Q9H0E9	1235 aa		11.36	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		11.36	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		11.36	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		11.36	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		11.36	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		11.36	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		11.36	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	STARD3NL	O95772	234 aa		11.36	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ETS2	P15036	469 aa		11.36	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RASA1	P20936	1047 aa		11.36	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MAGEA1	P43355	309 aa		11.36	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KIF11	P52732	1056 aa		11.36	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TNNC1	P63316	161 aa		11.36	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KSR2	Q6VAB6	950 aa		11.36	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCDC125	Q86Z20	511 aa		11.36	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FAM13C	Q8NE31	585 aa		11.36	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		11.36	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LZIC	Q8WZA0	190 aa		11.36	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NOX5	Q96PH1	765 aa		11.36	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HAPLN3	Q96S86	360 aa		11.36	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RMND1	Q9NWS8	449 aa		11.36	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		11.36	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FTCD	O95954	541 aa		11.35	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PRCP	P42785	496 aa		11.35	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TFCP2	Q12800	502 aa		11.35	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		11.35	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		11.35	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		11.35	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		11.35	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	USP38	Q8NB14	1042 aa		11.35	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TTC8	Q8TAM2	541 aa		11.35	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		11.35	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		11.35	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PACSIN2	Q9UNF0	486 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		11.35	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	C4A	P0C0L4	1744 aa		11.35	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TLDC2	A0PJX2	215 aa		11.35	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		11.35	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658	UNC5C	O95185	931 aa		11.35	□□□□□ -0.59

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