RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427110.6

PTPRC-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 264 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-208ENST00000427110 BORAQ6PGQ7 559 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 HHIPL2Q6UWX4 724 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 GGNQ86UU5 652 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 FAM124AQ86V42 546 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 LRRTM3Q86VH5 581 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 KBTBD2Q8IY47 623 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 GSTCDQ8NEC7 633 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 LOXL4Q96JB6 756 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 C8orf49Q96NF6 230 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP3.45□□□□□ -1.86
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PTPRC-208ENST00000427110 HSPBP1Q9NZL4 362 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 NUB1Q9Y5A7 615 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 ATP23Q9Y6H3 246 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 B4E1Z4 1266 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 SCDO00767 359 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 WNT9AO14904 365 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 LAMTOR5O43504 91 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 B4GALT4O60513 344 aa3.44□□□□□ -1.86
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PTPRC-208ENST00000427110 KNG1P01042 644 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
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PTPRC-208ENST00000427110 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
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PTPRC-208ENST00000427110 MASP1P48740 699 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 NFATC3Q12968 1075 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 CRY1Q16526 586 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 CFAP100Q494V2 611 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 FAM47CQ5HY64 1035 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 PIK3R6Q5UE93 754 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 EP400NLQ6ZTU2 488 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 C16orf59Q7L2K0 433 aa3.44□□□□□ -1.86
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PTPRC-208ENST00000427110 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 WRNIP1Q96S55 665 aa3.44□□□□□ -1.86
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PTPRC-208ENST00000427110 SAMD15Q9P1V8 674 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa3.44□□□□□ -1.86
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PTPRC-208ENST00000427110 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa3.43□□□□□ -1.86
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PTPRC-208ENST00000427110 C9orf118A6NHY6 69 aa3.43□□□□□ -1.86
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PTPRC-208ENST00000427110 FIGNQ5HY92 759 aa3.43□□□□□ -1.86
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PTPRC-208ENST00000427110 PKN3Q6P5Z2 889 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 LRSAM1Q6UWE0 723 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 Q6ZUG5 572 aa3.43□□□□□ -1.86
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PTPRC-208ENST00000427110 CHAC2Q8WUX2 184 aa3.43□□□□□ -1.86
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PTPRC-208ENST00000427110 INSRRP14616 1297 aa3.42□□□□□ -1.86
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PTPRC-208ENST00000427110 SOX5P35711 763 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 RRADP55042 308 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 IL13RA1P78552 427 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 ICAM4Q14773 271 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 PTPROQ16827 1216 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
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