RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 ZMYND12Q9H0C1 365 aa11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 WDR91A4D1P6 747 aa11.84□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 PHKG2P15735 406 aa11.84□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 DR1Q01658 176 aa11.84□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 ADCY2Q08462 1091 aa11.84□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 APOL6Q9BWW8 343 aa11.84□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 DCCP43146 1447 aa11.84□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 CFLARO15519 480 aa11.84□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 ATP1A3P13637 1013 aa11.84□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 CUL1Q13616 776 aa11.84□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF804BA4D1E1 1349 aa11.84□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 MAPK13O15264 365 aa11.84□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 LCA5Q86VQ0 697 aa11.84□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 SPICE1Q8N0Z3 855 aa11.84□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 C7orf31Q8N865 590 aa11.84□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 PYROXD1Q8WU10 500 aa11.84□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 CEP170P1Q96L14 293 aa11.84□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 TTC1Q99614 292 aa11.84□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 THAP9Q9H5L6 903 aa11.84□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa11.84□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 NVLO15381 856 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 TTI1O43156 1089 aa11.83□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC7A5Q01650 507 aa11.83□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 SEPT2Q15019 361 aa11.83□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 ATG16L1Q676U5 607 aa11.83□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 CENPUQ71F23 418 aa11.83□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 NCAPG2Q86XI2 1143 aa11.83□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 LRRC4Q9HBW1 653 aa11.83□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 FIS1Q9Y3D6 152 aa11.83□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa11.83□□□□□ -0.51
EFTUD2-202ENST00000426333 CIAO1O76071 339 aa11.83□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 OCRLQ01968 901 aa11.83□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 LRRC63Q05C16 580 aa11.83□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 PSMD2Q13200 908 aa11.83□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 DOK7Q18PE1 504 aa11.83□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 TRIML2Q8N7C3 387 aa11.83□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP11.83□□□□□ -0.525e-11■■■■■ 94.1
EFTUD2-202ENST00000426333 PCIF1Q9H4Z3 704 aa11.83□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 PARVGQ9HBI0 331 aa11.83□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 SERPINB13Q9UIV8 391 aa11.83□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 NFU1Q9UMS0 254 aa11.83□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 KRT37O76014 449 aa11.83□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 TTLL1O95922 423 aa11.83□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP11.83□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 GDAP1Q8TB36 358 aa11.83□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 VPS39Q96JC1 886 aa11.83□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 PITPNM3Q9BZ71 974 aa11.83□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 KANSL2Q9H9L4 492 aa11.83□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 ADAM21Q9UKJ8 722 aa11.83□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 ACSL3O95573 720 aa11.83□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 KCTD2Q14681 263 aa11.83□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa11.82□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 hCG_1984214I3L0E3 225 aa11.82□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 CHUKO15111 745 aa11.82□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 MED7O43513 233 aa11.82□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 PRPSAP2O60256 369 aa11.82□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 ZBED1O96006 694 aa11.82□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 KRT10P13645 584 aa11.82□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 RWDD2BP57060 319 aa11.82□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 UBXN2AP68543 259 aa11.82□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 DEUP1Q05D60 604 aa11.82□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 RHOT2Q8IXI1 618 aa11.82□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 MAML1Q92585 1016 aa11.82□□□□□ -0.52
EFTUD2-202ENST00000426333 CDHR1Q96JP9 859 aa11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms