RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415046.6

PTPRK-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 1,029 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-209ENST00000415046 CLIC6Q96NY7 704 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-209ENST00000415046 WRNIP1Q96S55 665 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-209ENST00000415046 TMEM209Q96SK2 561 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-209ENST00000415046 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-209ENST00000415046 SMOC1Q9H4F8 434 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-209ENST00000415046 ST7Q9NRC1 585 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-209ENST00000415046 IFT172Q9UG01 1749 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-209ENST00000415046 NEURL4Q96JN8 1562 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-209ENST00000415046 TRPM2O94759 1503 aa6.35□□□□□ -1.39
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PTPRK-209ENST00000415046 MSCO60682 206 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-209ENST00000415046 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-209ENST00000415046 TTLL11Q8NHH1 800 aa6.35□□□□□ -1.39
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PTPRK-209ENST00000415046 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-209ENST00000415046 SAMD11Q96NU1 681 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-209ENST00000415046 PHF20Q9BVI0 1012 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-209ENST00000415046 ASH2LQ9UBL3 628 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-209ENST00000415046 MYRFQ9Y2G1 1151 aa6.35□□□□□ -1.39
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PTPRK-209ENST00000415046 STRCP1A6NGW2 1772 aa6.34□□□□□ -1.39
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PTPRK-209ENST00000415046 CYP7B1O75881 506 aa6.34□□□□□ -1.39
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PTPRK-209ENST00000415046 USP53Q70EK8 1073 aa6.34□□□□□ -1.39
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PTPRK-209ENST00000415046 GPR20Q99678 358 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRK-209ENST00000415046 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
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PTPRK-209ENST00000415046 WASF3Q9UPY6 502 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRK-209ENST00000415046 IQCA1LA6NCM1 817 aa6.33□□□□□ -1.4
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PTPRK-209ENST00000415046 INSRRP14616 1297 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRK-209ENST00000415046 IL13P35225 146 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRK-209ENST00000415046 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRK-209ENST00000415046 PKN3Q6P5Z2 889 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRK-209ENST00000415046 PLEKHH3Q7Z736 793 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRK-209ENST00000415046 TRIM48Q8IWZ4 208 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRK-209ENST00000415046 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRK-209ENST00000415046 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa6.33□□□□□ -1.4
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PTPRK-209ENST00000415046 JAM3Q9BX67 310 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRK-209ENST00000415046 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRK-209ENST00000415046 L2HGDHQ9H9P8 463 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRK-209ENST00000415046 ARHGEF4Q9NR80 690 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRK-209ENST00000415046 PLA2R1Q13018 1463 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRK-209ENST00000415046 LAMTOR5O43504 91 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-209ENST00000415046 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-209ENST00000415046 SURF1Q15526 300 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-209ENST00000415046 CPZQ66K79 652 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-209ENST00000415046 TMC5Q6UXY8 1006 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-209ENST00000415046 PROSER1Q86XN7 944 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-209ENST00000415046 DCAF4Q8WV16 495 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-209ENST00000415046 OSBP2Q969R2 916 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-209ENST00000415046 LOXL4Q96JB6 756 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-209ENST00000415046 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-209ENST00000415046 TMEM168Q9H0V1 697 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-209ENST00000415046 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-209ENST00000415046 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-209ENST00000415046 SLIT1O75093 1534 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-209ENST00000415046 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-209ENST00000415046 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-209ENST00000415046 GRK2P25098 689 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-209ENST00000415046 GRK3P35626 688 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-209ENST00000415046 IDI1Q13907 227 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-209ENST00000415046 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-209ENST00000415046 NTRK3Q16288 839 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-209ENST00000415046 KIZQ2M2Z5 673 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-209ENST00000415046 LBX2Q6XYB7 198 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-209ENST00000415046 OTOP3Q7RTS5 596 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-209ENST00000415046 C8orf49Q96NF6 230 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-209ENST00000415046 MPHOSPH9Q99550 1183 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-209ENST00000415046 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-209ENST00000415046 CROTQ9UKG9 612 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-209ENST00000415046 PTPRTO14522 1441 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-209ENST00000415046 ZNF536O15090 1300 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-209ENST00000415046 ARHGAP23Q9P227 1491 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-209ENST00000415046 SLC27A2O14975 620 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-209ENST00000415046 PRODHO43272 600 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-209ENST00000415046 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-209ENST00000415046 COL6A1P12109 1028 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-209ENST00000415046 ZNF20P17024 532 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-209ENST00000415046 RAB33AQ14088 237 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-209ENST00000415046 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-209ENST00000415046 STYK1Q6J9G0 422 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-209ENST00000415046 GLB1LQ6UWU2 654 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-209ENST00000415046 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-209ENST00000415046 KLHL36Q8N4N3 616 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-209ENST00000415046 DTX3Q8N9I9 347 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-209ENST00000415046 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-209ENST00000415046 DLL4Q9NR61 685 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-209ENST00000415046 IGSF5Q9NSI5 407 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-209ENST00000415046 RBPJLQ9UBG7 517 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-209ENST00000415046 FTSJ1Q9UET6 329 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-209ENST00000415046 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-209ENST00000415046 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-209ENST00000415046 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
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