RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411651.6

SUMO3-204, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SUMO3, Length 1,921 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3-204ENST00000411651 RSPH10B2B2RC85 870 aa22.21■■□□□ 1.15
SUMO3-204ENST00000411651 C19orf81C9J6K1 198 aa22.21■■□□□ 1.15
SUMO3-204ENST00000411651 DHX15O43143 795 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SUMO3-204ENST00000411651 GCNT3O95395 438 aa22.21■■□□□ 1.15
SUMO3-204ENST00000411651 RSPH10BP0C881 870 aa22.21■■□□□ 1.15
SUMO3-204ENST00000411651 MAPTP10636 758 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SUMO3-204ENST00000411651 ALAS1P13196 640 aa22.21■■□□□ 1.15
SUMO3-204ENST00000411651 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SUMO3-204ENST00000411651 ZNF280CQ8ND82 737 aa22.21■■□□□ 1.15
SUMO3-204ENST00000411651 PIGOQ8TEQ8 1089 aa22.21■■□□□ 1.15
SUMO3-204ENST00000411651 TMEM174Q8WUU8 243 aa22.21■■□□□ 1.15
SUMO3-204ENST00000411651 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa22.21■■□□□ 1.15
SUMO3-204ENST00000411651 FBXL5Q9UKA1 691 aa22.21■■□□□ 1.15
SUMO3-204ENST00000411651 MYO6Q9UM54 1294 aa22.21■■□□□ 1.15
SUMO3-204ENST00000411651 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SUMO3-204ENST00000411651 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa22.2■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 USO1O60763 962 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 NOL4O94818 638 aa22.2■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 NR3C1P04150 777 aa22.2■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 KCNH2Q12809 1159 aa22.2■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 KIF5AQ12840 1032 aa22.2■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 ALCAMQ13740 583 aa22.2■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 RRAGAQ7L523 313 aa22.2■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 GOLGA5Q8TBA6 731 aa22.2■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 FIZ1Q96SL8 496 aa22.2■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 TIPINQ9BVW5 301 aa22.2■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 GUCA1BQ9UMX6 200 aa22.2■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 VWA5AO00534 786 aa22.19■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 ABL1P00519 1130 aa22.19■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 EPB41P11171 864 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 EPS15P42566 896 aa22.19■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 KIF11P52732 1056 aa22.19■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 RASSF7Q02833 373 aa22.19■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 MYBPC2Q14324 1141 aa22.19■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 MIER3Q7Z3K6 550 aa22.19■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 PICK1Q9NRD5 415 aa22.19■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa22.19■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 GJA3Q9Y6H8 435 aa22.19■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 AFPP02771 609 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 PTPRAP18433 802 aa22.19■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 RPS6P62753 249 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa22.19■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 ZNF720Q7Z2F6 126 aa22.19■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 MYCT1Q8N699 235 aa22.19■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 RDM1Q8NG50 284 aa22.19■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 POTEB2H3BUK9 544 aa22.18■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 ATP2A1O14983 1001 aa22.18■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 PJA2O43164 708 aa22.18■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 SERPING1P05155 500 aa22.18■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 CHMP4BP1P59074 171 aa22.18■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 MTMR1Q13613 665 aa22.18■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 PGM5Q15124 567 aa22.18■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 MUM1L1Q5H9M0 696 aa22.18■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 CPXCR1Q8N123 301 aa22.18■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 STRA6Q9BX79 667 aa22.18■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 AIPL1Q9NZN9 384 aa22.18■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa22.18■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 MYPNQ86TC9 1320 aa22.18■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa22.18■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 ARHGEF35A5YM69 484 aa22.18■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 MAFGO15525 162 aa22.18■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 TGFB1I1O43294 461 aa22.18■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 SPP2Q13103 211 aa22.18■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 SFMBT2Q5VUG0 894 aa22.18■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 HGSNATQ68CP4 663 aa22.18■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa22.18■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 IL31RAQ8NI17 732 aa22.18■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 TRERF1Q96PN7 1200 aa22.18■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 GANQ9H2C0 597 aa22.18■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 DEF6Q9H4E7 631 aa22.18■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 OGFRQ9NZT2 677 aa22.18■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa22.18■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 ZNF263O14978 683 aa22.17■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 SFNP31947 248 aa22.17■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 RNF207Q6ZRF8 634 aa22.17■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 SLC9A9Q8IVB4 645 aa22.17■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 FAM178BQ8IXR5 827 aa22.17■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 REPS2Q8NFH8 660 aa22.17■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 TRIM58Q8NG06 486 aa22.17■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 PDCD2LQ9BRP1 358 aa22.17■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SUMO3-204ENST00000411651 PXMP2Q9NR77 195 aa22.17■■□□□ 1.14
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