RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403441.1

PRAME-204, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-204ENST00000403441 TMTC3Q6ZXV5 915 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-204ENST00000403441 MICU3Q86XE3 530 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-204ENST00000403441 TEX2Q8IWB9 1127 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-204ENST00000403441 CCDC82Q8N4S0 544 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-204ENST00000403441 IGFLR1Q9H665 355 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-204ENST00000403441 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
PRAME-204ENST00000403441 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
PRAME-204ENST00000403441 KCNH7Q9NS40 1196 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-204ENST00000403441 CD207Q9UJ71 328 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-204ENST00000403441 PLAGL2Q9UPG8 496 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-204ENST00000403441 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-204ENST00000403441 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
PRAME-204ENST00000403441 MBTPS2O43462 519 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 TBX10O75333 385 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 REC8O95072 547 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 SCG2P13521 617 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 IRS1P35568 1242 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 NDUFV1P49821 464 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 ACTR2P61160 394 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 TMEM62Q0P6H9 643 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 KRT32Q14532 448 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 FBXL16Q8N461 479 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 FANCBQ8NB91 859 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 LINC01599Q8WXQ3 324 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 ZBTB10Q96DT7 871 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 NEK1Q96PY6 1258 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 MXRA8Q9BRK3 442 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 LRFN2Q9ULH4 789 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 PADI3Q9ULW8 664 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 NFASCO94856 1347 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 FOSP01100 380 aaPredicted RBP14.07□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 SLC26A2P50443 739 aa14.07□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 STAT5BP51692 787 aa14.07□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 ADCY7P51828 1080 aa14.07□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 NAPAP54920 295 aa14.07□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 KRT76Q01546 638 aa14.07□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP14.07□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 PLCB4Q15147 1175 aa14.07□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 PPP1R18Q6NYC8 613 aa14.07□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP14.07□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 NME8Q8N427 588 aa14.07□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa14.07□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 PCYT2Q99447 389 aa14.07□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 KCNH6Q9H252 994 aa14.07□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP14.07□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 SNX14Q9Y5W7 946 aa14.07□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa14.06□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 STXBP3O00186 592 aa14.06□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 LINC01565O15544 149 aa14.06□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 ITGB1P05556 798 aa14.06□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP14.06□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 ADAM15Q13444 863 aa14.06□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 CEP55Q53EZ4 464 aa14.06□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 WWC2Q6AWC2 1192 aa14.06□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 CRIPAKQ8N1N5 446 aa14.06□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 KLHL23Q8NBE8 558 aa14.06□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 LRRC2Q9BYS8 371 aa14.06□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 AGXT2Q9BYV1 514 aa14.06□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 RIC8AQ9NPQ8 531 aa14.06□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa14.06□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 NID2Q14112 1375 aa14.06□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 C5orf42Q9H799 3197 aa14.06□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 hCG_1984214I3L0E3 225 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 BACH1O14867 736 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP14.05□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 DNAJB1P25685 340 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 CAMK1Q14012 370 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP14.05□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 ODR4Q5SWX8 454 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 FAM160B1Q5W0V3 765 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 MTHFD1LQ6UB35 978 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP14.05□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 RNF135Q8IUD6 432 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 EFHBQ8N7U6 833 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP14.05□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 CYP2W1Q8TAV3 490 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 SPPL3Q8TCT6 385 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 POF1BQ8WVV4 589 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 MFSD14AQ96MC6 490 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 GLT8D2Q9H1C3 349 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 MUTYHQ9UIF7 546 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 GINS2Q9Y248 185 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 KIAA1671Q9BY89 1806 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa14.05□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 FSD2A1L4K1 749 aa14.04□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 DENND3A2RUS2 1198 aa14.04□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 EYA4O95677 639 aa14.04□□□□□ -0.16
PRAME-204ENST00000403441 ARP10275 920 aa14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.2 ms