RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393537.4

ANKRD39-201, Transcript of ankyrin repeat domain 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD39, Length 976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39-201ENST00000393537 PRDM12Q9H4Q4 367 aa22.9■■□□□ 1.26
ANKRD39-201ENST00000393537 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa22.9■■□□□ 1.26
ANKRD39-201ENST00000393537 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa22.89■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 HBP1O60381 514 aa22.89■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 CYP3A7P24462 503 aa22.89■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 LRCH2Q5VUJ6 765 aa22.89■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 CKAP2LQ8IYA6 745 aa22.89■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 OXER1Q8TDS5 423 aa22.89■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 RIT2Q99578 217 aa22.89■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 ZBED2Q9BTP6 218 aa22.89■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa22.89■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 WDR64B1ANS9 1081 aa22.88■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 TLL1O43897 1013 aa22.88■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 JAK2O60674 1132 aa22.88■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 ATP4AP20648 1035 aa22.88■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 MGAT3Q09327 533 aa22.88■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 MOXD1Q6UVY6 613 aa22.88■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP22.88■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 MBOAT7Q96N66 472 aa22.88■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 TEKT3Q9BXF9 490 aa22.88■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 DISC1Q9NRI5 854 aa22.88■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 GABBR1Q9UBS5 961 aa22.88■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 CDY2AQ9Y6F7 541 aa22.88■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa22.87■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 CHMP2AO43633 222 aa22.87■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 GHRP10912 638 aa22.87■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 ST3GAL1Q11201 340 aa22.87■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 LETM2Q2VYF4 491 aa22.87■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 MTHFD1LQ6UB35 978 aa22.87■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC17A8Q8NDX2 589 aa22.87■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 KIF2CQ99661 725 aa22.87■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa22.87■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 EVPLQ92817 2033 aa22.87■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 COL1A2P08123 1366 aa22.87■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 AMHP03971 560 aa22.86■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 KLRC1P26715 233 aa22.86■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 TMEM62Q0P6H9 643 aa22.86■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF484Q5JVG2 852 aa22.86■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM117BQ6P1L5 589 aa22.86■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa22.86■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 NEK8Q86SG6 692 aa22.86■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 APBB2Q92870 758 aa22.86■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 UNC45AQ9H3U1 944 aa22.86■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa22.85■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa22.85■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 LCHNA4D1U4 455 aa22.85■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 PSMD10O75832 226 aa22.85■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 ARHGEF15O94989 841 aa22.85■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 GJB5O95377 273 aa22.85■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 KRT2P35908 639 aa22.85■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 JAK3P52333 1124 aa22.85■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 FOSBP53539 338 aa22.85■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 LPIN1Q14693 890 aa22.85■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 IER5Q5VY09 327 aa22.85■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 MYOCDQ8IZQ8 938 aa22.85■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 ETNPPLQ8TBG4 499 aa22.85■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 ZBTB42B2RXF5 422 aa22.84■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 M0QZ92 97 aa22.84■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC37A4O43826 429 aa22.84■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 SFNP31947 248 aa22.84■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 TAP1Q03518 808 aa22.84■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 NR5A1Q13285 461 aa22.84■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 FBXO47Q5MNV8 452 aa22.84■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 RAD9AQ99638 391 aa22.84■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 CERS4Q9HA82 394 aa22.84■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 BRMS1Q9HCU9 246 aa22.84■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 TRPV2Q9Y5S1 764 aa22.84■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM205CA6NFA0 338 aa22.83■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 ADGRE1Q14246 886 aa22.83■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 MIER3Q7Z3K6 550 aa22.83■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC83Q8IWF9 413 aa22.83■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM167AQ96KS9 214 aa22.83■■□□□ 1.25
ANKRD39-201ENST00000393537 COL6A3P12111 3177 aa22.82■■□□□ 1.24
ANKRD39-201ENST00000393537 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF862O60290 1169 aa22.82■■□□□ 1.24
ANKRD39-201ENST00000393537 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
ANKRD39-201ENST00000393537 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
ANKRD39-201ENST00000393537 RBM25P49756 843 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
ANKRD39-201ENST00000393537 TRIM29Q14134 588 aa22.82■■□□□ 1.24
ANKRD39-201ENST00000393537 UGCGQ16739 394 aa22.82■■□□□ 1.24
ANKRD39-201ENST00000393537 PPP4R3AQ6IN85 833 aa22.82■■□□□ 1.24
ANKRD39-201ENST00000393537 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa22.82■■□□□ 1.24
ANKRD39-201ENST00000393537 NME8Q8N427 588 aa22.82■■□□□ 1.24
ANKRD39-201ENST00000393537 RDM1Q8NG50 284 aa22.82■■□□□ 1.24
ANKRD39-201ENST00000393537 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
ANKRD39-201ENST00000393537 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
ANKRD39-201ENST00000393537 C22orf31O95567 290 aa22.81■■□□□ 1.24
ANKRD39-201ENST00000393537 MMP1P03956 469 aa22.81■■□□□ 1.24
ANKRD39-201ENST00000393537 OATP04181 439 aa22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.4 ms