RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392919.4

GNPTAB-202, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 760 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-202ENST00000392919 SEPT1Q8WYJ6 367 aa30.71■■■□□ 2.51
GNPTAB-202ENST00000392919 CERS4Q9HA82 394 aa30.71■■■□□ 2.51
GNPTAB-202ENST00000392919 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP30.7■■■□□ 2.51
GNPTAB-202ENST00000392919 IGFBP4P22692 258 aa30.7■■■□□ 2.51
GNPTAB-202ENST00000392919 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP30.7■■■□□ 2.51
GNPTAB-202ENST00000392919 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP30.7■■■□□ 2.51
GNPTAB-202ENST00000392919 TBC1D22BQ9NU19 505 aa30.7■■■□□ 2.51
GNPTAB-202ENST00000392919 FOXD4L1Q9NU39 408 aa30.7■■■□□ 2.51
GNPTAB-202ENST00000392919 A0A0C4DFX4 3053 aa30.69■■■□□ 2.5
GNPTAB-202ENST00000392919 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP30.69■■■□□ 2.5
GNPTAB-202ENST00000392919 RFXAPO00287 272 aa30.69■■■□□ 2.5
GNPTAB-202ENST00000392919 WNT7AO00755 349 aa30.69■■■□□ 2.5
GNPTAB-202ENST00000392919 LGR5O75473 907 aa30.69■■■□□ 2.5
GNPTAB-202ENST00000392919 CCNE2O96020 404 aa30.69■■■□□ 2.5
GNPTAB-202ENST00000392919 CTSHP09668 335 aa30.69■■■□□ 2.5
GNPTAB-202ENST00000392919 SPRED2Q7Z698 418 aa30.69■■■□□ 2.5
GNPTAB-202ENST00000392919 NOSTRINQ8IVI9 506 aa30.69■■■□□ 2.5
GNPTAB-202ENST00000392919 ETNPPLQ8TBG4 499 aa30.69■■■□□ 2.5
GNPTAB-202ENST00000392919 SLC5A5Q92911 643 aa30.69■■■□□ 2.5
GNPTAB-202ENST00000392919 GJA10Q969M2 543 aa30.69■■■□□ 2.5
GNPTAB-202ENST00000392919 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP30.69■■■□□ 2.5
GNPTAB-202ENST00000392919 PRDM6Q9NQX0 595 aa30.69■■■□□ 2.5
GNPTAB-202ENST00000392919 H3BQV1 296 aa30.68■■■□□ 2.5
GNPTAB-202ENST00000392919 MARK3P27448 753 aa30.68■■■□□ 2.5
GNPTAB-202ENST00000392919 ACTR2P61160 394 aa30.68■■■□□ 2.5
GNPTAB-202ENST00000392919 DBF4BQ8NFT6 615 aa30.68■■■□□ 2.5
GNPTAB-202ENST00000392919 PCYT2Q99447 389 aa30.68■■■□□ 2.5
GNPTAB-202ENST00000392919 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP30.68■■■□□ 2.5
GNPTAB-202ENST00000392919 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa30.67■■■□□ 2.5
GNPTAB-202ENST00000392919 LCHNA4D1U4 455 aa30.67■■■□□ 2.5
GNPTAB-202ENST00000392919 GNAT1P11488 350 aa30.67■■■□□ 2.5
GNPTAB-202ENST00000392919 TAP1Q03518 808 aa30.67■■■□□ 2.5
GNPTAB-202ENST00000392919 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP30.67■■■□□ 2.5
GNPTAB-202ENST00000392919 IKBKEQ14164 716 aa30.67■■■□□ 2.5
GNPTAB-202ENST00000392919 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP30.67■■■□□ 2.5
GNPTAB-202ENST00000392919 CHD7Q9P2D1 2997 aa30.67■■■□□ 2.5
GNPTAB-202ENST00000392919 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa30.66■■■□□ 2.5
GNPTAB-202ENST00000392919 EPOPA6NHQ4 379 aa30.66■■■□□ 2.5
GNPTAB-202ENST00000392919 TLL1O43897 1013 aa30.66■■■□□ 2.5
GNPTAB-202ENST00000392919 ATG7O95352 703 aa30.66■■■□□ 2.5
GNPTAB-202ENST00000392919 GLG1Q92896 1179 aa30.66■■■□□ 2.5
GNPTAB-202ENST00000392919 RIT2Q99578 217 aa30.66■■■□□ 2.5
GNPTAB-202ENST00000392919 KCNMB3Q9NPA1 279 aa30.66■■■□□ 2.5
GNPTAB-202ENST00000392919 EMSYQ7Z589 1322 aa30.66■■■□□ 2.5
GNPTAB-202ENST00000392919 NRCAMQ92823 1304 aa30.66■■■□□ 2.5
GNPTAB-202ENST00000392919 KAT6AQ92794 2004 aa30.65■■■□□ 2.5
GNPTAB-202ENST00000392919 PSMD10O75832 226 aa30.65■■■□□ 2.5
GNPTAB-202ENST00000392919 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP30.65■■■□□ 2.5
GNPTAB-202ENST00000392919 RUFY4Q6ZNE9 571 aa30.65■■■□□ 2.5
GNPTAB-202ENST00000392919 POTEDQ86YR6 584 aa30.65■■■□□ 2.5
GNPTAB-202ENST00000392919 ERAP1Q9NZ08 941 aa30.65■■■□□ 2.5
GNPTAB-202ENST00000392919 PPFIA1Q13136 1202 aa30.64■■■□□ 2.5
GNPTAB-202ENST00000392919 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP30.64■■■□□ 2.5
GNPTAB-202ENST00000392919 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa30.64■■■□□ 2.5
GNPTAB-202ENST00000392919 LRCH2Q5VUJ6 765 aa30.64■■■□□ 2.5
GNPTAB-202ENST00000392919 MCTP1Q6DN14 999 aa30.64■■■□□ 2.5
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP30.64■■■□□ 2.5
GNPTAB-202ENST00000392919 ABHD15Q6UXT9 468 aa30.64■■■□□ 2.5
GNPTAB-202ENST00000392919 ZBED2Q9BTP6 218 aa30.64■■■□□ 2.5
GNPTAB-202ENST00000392919 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa30.64■■■□□ 2.5
GNPTAB-202ENST00000392919 GAS7O60861 476 aa30.63■■■□□ 2.49
GNPTAB-202ENST00000392919 ATP2B1P20020 1258 aa30.63■■■□□ 2.49
GNPTAB-202ENST00000392919 KRT76Q01546 638 aa30.63■■■□□ 2.49
GNPTAB-202ENST00000392919 GRIK4Q16099 956 aa30.63■■■□□ 2.49
GNPTAB-202ENST00000392919 FAM117BQ6P1L5 589 aa30.63■■■□□ 2.49
GNPTAB-202ENST00000392919 HAS1Q92839 578 aa30.63■■■□□ 2.49
GNPTAB-202ENST00000392919 ZBTB10Q96DT7 871 aa30.63■■■□□ 2.49
GNPTAB-202ENST00000392919 TEKT3Q9BXF9 490 aa30.63■■■□□ 2.49
GNPTAB-202ENST00000392919 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa30.62■■■□□ 2.49
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GNPTAB-202ENST00000392919 GJB5O95377 273 aa30.62■■■□□ 2.49
GNPTAB-202ENST00000392919 PDCP20941 246 aa30.62■■■□□ 2.49
GNPTAB-202ENST00000392919 MARCH8Q5T0T0 291 aa30.62■■■□□ 2.49
GNPTAB-202ENST00000392919 B3GNT9Q6UX72 402 aa30.62■■■□□ 2.49
GNPTAB-202ENST00000392919 ARNTL2Q8WYA1 636 aa30.62■■■□□ 2.49
GNPTAB-202ENST00000392919 FAM20AQ96MK3 541 aa30.62■■■□□ 2.49
GNPTAB-202ENST00000392919 UNC45AQ9H3U1 944 aa30.62■■■□□ 2.49
GNPTAB-202ENST00000392919 CUL9Q8IWT3 2517 aa30.62■■■□□ 2.49
GNPTAB-202ENST00000392919 MICAL3Q7RTP6 2002 aa30.61■■■□□ 2.49
GNPTAB-202ENST00000392919 TBX3O15119 743 aa30.61■■■□□ 2.49
GNPTAB-202ENST00000392919 EFCAB14O75071 495 aa30.61■■■□□ 2.49
GNPTAB-202ENST00000392919 SYT1P21579 422 aa30.61■■■□□ 2.49
GNPTAB-202ENST00000392919 CHRNA1P02708 482 aa30.6■■■□□ 2.49
GNPTAB-202ENST00000392919 TRAPPC10P48553 1259 aa30.6■■■□□ 2.49
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GNPTAB-202ENST00000392919 FAM26DQ5JW98 314 aa30.6■■■□□ 2.49
GNPTAB-202ENST00000392919 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP30.6■■■□□ 2.49
GNPTAB-202ENST00000392919 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa30.6■■■□□ 2.49
GNPTAB-202ENST00000392919 SIP14410 1827 aa30.59■■■□□ 2.49
GNPTAB-202ENST00000392919 NEMFO60524 1076 aa30.59■■■□□ 2.49
GNPTAB-202ENST00000392919 INSRRP14616 1297 aa30.59■■■□□ 2.49
GNPTAB-202ENST00000392919 IGBP1P78318 339 aa30.59■■■□□ 2.49
GNPTAB-202ENST00000392919 TTC38Q5R3I4 469 aa30.59■■■□□ 2.49
GNPTAB-202ENST00000392919 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa30.59■■■□□ 2.49
GNPTAB-202ENST00000392919 MICALL1Q8N3F8 863 aa30.59■■■□□ 2.49
GNPTAB-202ENST00000392919 TMEM60Q9H2L4 133 aa30.59■■■□□ 2.49
GNPTAB-202ENST00000392919 TUBE1Q9UJT0 475 aa30.59■■■□□ 2.49
GNPTAB-202ENST00000392919 VAV3Q9UKW4 847 aa30.59■■■□□ 2.49
GNPTAB-202ENST00000392919 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
GNPTAB-202ENST00000392919 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP30.58■■■□□ 2.49
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