RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391173.1

RNU6-400P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 400, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-400P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-400P-201ENST00000391173 CARSP49589 748 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-400P-201ENST00000391173 LIG3P49916 1009 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-400P-201ENST00000391173 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-400P-201ENST00000391173 CDC42EP1Q00587 391 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-400P-201ENST00000391173 IL9RQ01113 521 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-400P-201ENST00000391173 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-400P-201ENST00000391173 POU5F1BQ06416 359 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-400P-201ENST00000391173 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-400P-201ENST00000391173 LMAN2Q12907 356 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-400P-201ENST00000391173 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
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RNU6-400P-201ENST00000391173 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-400P-201ENST00000391173 ZNF718Q3SXZ3 478 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-400P-201ENST00000391173 GRIPAP1Q4V328 841 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-400P-201ENST00000391173 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-400P-201ENST00000391173 FHL5Q5TD97 284 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-400P-201ENST00000391173 METRNLQ641Q3 311 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-400P-201ENST00000391173 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-400P-201ENST00000391173 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-400P-201ENST00000391173 LYPD8Q6UX82 237 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-400P-201ENST00000391173 BRD3OSQ6XYD6 125 aa-0.89□□□□□ -2.55
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RNU6-400P-201ENST00000391173 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-400P-201ENST00000391173 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-400P-201ENST00000391173 PTF1AQ7RTS3 328 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-400P-201ENST00000391173 GPR155Q7Z3F1 870 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-400P-201ENST00000391173 THAP5Q7Z6K1 395 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-400P-201ENST00000391173 TMEM135Q86UB9 458 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-400P-201ENST00000391173 MFSD4AQ8N468 514 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-400P-201ENST00000391173 SUPT20HQ8NEM7 779 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-400P-201ENST00000391173 PRR7Q8TB68 274 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-400P-201ENST00000391173 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-400P-201ENST00000391173 SSH3Q8TE77 659 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-400P-201ENST00000391173 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-400P-201ENST00000391173 GLG1Q92896 1179 aa-0.89□□□□□ -2.55
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RNU6-400P-201ENST00000391173 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-400P-201ENST00000391173 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
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RNU6-400P-201ENST00000391173 PLA2G12BQ9BX93 195 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-400P-201ENST00000391173 WDR11Q9BZH6 1224 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-400P-201ENST00000391173 SERHL2Q9H4I8 314 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-400P-201ENST00000391173 SEC61A2Q9H9S3 476 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-400P-201ENST00000391173 ETNK1Q9HBU6 452 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-400P-201ENST00000391173 MYOZ2Q9NPC6 264 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-400P-201ENST00000391173 ZNF586Q9NXT0 402 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-400P-201ENST00000391173 TRPS1Q9UHF7 1281 aa-0.89□□□□□ -2.55
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RNU6-400P-201ENST00000391173 GIT1Q9Y2X7 761 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-400P-201ENST00000391173 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-400P-201ENST00000391173 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-400P-201ENST00000391173 PALLDQ8WX93 1383 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-400P-201ENST00000391173 SEC16AO15027 2179 aa-0.89□□□□□ -2.55
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RNU6-400P-201ENST00000391173 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
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RNU6-400P-201ENST00000391173 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa-0.9□□□□□ -2.55
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RNU6-400P-201ENST00000391173 USP14P54578 494 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-400P-201ENST00000391173 EPHA5P54756 1037 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-400P-201ENST00000391173 NRLP54845 237 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-400P-201ENST00000391173 NPEPPSP55786 919 aa-0.9□□□□□ -2.55
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RNU6-400P-201ENST00000391173 LINC00315P59091 139 aa-0.9□□□□□ -2.55
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RNU6-400P-201ENST00000391173 PIP4K2BP78356 416 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-400P-201ENST00000391173 NDPQ00604 133 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-400P-201ENST00000391173 EGR3Q06889 387 aa-0.9□□□□□ -2.55
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RNU6-400P-201ENST00000391173 LLGL1Q15334 1064 aa-0.9□□□□□ -2.55
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RNU6-400P-201ENST00000391173 DCST1Q5T197 706 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-400P-201ENST00000391173 RSPH4AQ5TD94 716 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-400P-201ENST00000391173 RNF20Q5VTR2 975 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-400P-201ENST00000391173 LIPKQ5VXJ0 399 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-400P-201ENST00000391173 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-400P-201ENST00000391173 PIP4P1Q86T03 277 aa-0.9□□□□□ -2.55
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