RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379359.3

RGCC-201, Transcript of regulator of cell cycle, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RGCC, Length 960 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGCC-201ENST00000379359 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
RGCC-201ENST00000379359 SPRED2Q7Z698 418 aa22.68■■□□□ 1.22
RGCC-201ENST00000379359 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
RGCC-201ENST00000379359 PTPRSQ13332 1948 aa22.68■■□□□ 1.22
RGCC-201ENST00000379359 LINC01553A4QN01 128 aa22.67■■□□□ 1.22
RGCC-201ENST00000379359 DHX15O43143 795 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
RGCC-201ENST00000379359 HBP1O60381 514 aa22.67■■□□□ 1.22
RGCC-201ENST00000379359 PSAPP07602 524 aa22.67■■□□□ 1.22
RGCC-201ENST00000379359 MGAT3Q09327 533 aa22.67■■□□□ 1.22
RGCC-201ENST00000379359 MTHFD1LQ6UB35 978 aa22.67■■□□□ 1.22
RGCC-201ENST00000379359 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
RGCC-201ENST00000379359 BLIDQ8IZY5 108 aa22.67■■□□□ 1.22
RGCC-201ENST00000379359 TBCKQ8TEA7 893 aa22.67■■□□□ 1.22
RGCC-201ENST00000379359 ATP8B4Q8TF62 1192 aa22.67■■□□□ 1.22
RGCC-201ENST00000379359 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa22.67■■□□□ 1.22
RGCC-201ENST00000379359 TRPV2Q9Y5S1 764 aa22.67■■□□□ 1.22
RGCC-201ENST00000379359 MTCH2Q9Y6C9 303 aa22.67■■□□□ 1.22
RGCC-201ENST00000379359 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa22.66■■□□□ 1.22
RGCC-201ENST00000379359 CIITAP33076 1130 aa22.66■■□□□ 1.22
RGCC-201ENST00000379359 USP11P51784 963 aa22.66■■□□□ 1.22
RGCC-201ENST00000379359 ANAPC15P60006 121 aa22.66■■□□□ 1.22
RGCC-201ENST00000379359 GRB10Q13322 594 aa22.66■■□□□ 1.22
RGCC-201ENST00000379359 ANKRD1Q15327 319 aa22.66■■□□□ 1.22
RGCC-201ENST00000379359 FBXO47Q5MNV8 452 aa22.66■■□□□ 1.22
RGCC-201ENST00000379359 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa22.66■■□□□ 1.22
RGCC-201ENST00000379359 IL27Q8NEV9 243 aa22.66■■□□□ 1.22
RGCC-201ENST00000379359 GDPD5Q8WTR4 605 aa22.66■■□□□ 1.22
RGCC-201ENST00000379359 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
RGCC-201ENST00000379359 TOP1MTQ969P6 601 aa22.66■■□□□ 1.22
RGCC-201ENST00000379359 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa22.66■■□□□ 1.22
RGCC-201ENST00000379359 MICAL3Q7RTP6 2002 aa22.65■■□□□ 1.22
RGCC-201ENST00000379359 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa22.65■■□□□ 1.22
RGCC-201ENST00000379359 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
RGCC-201ENST00000379359 XBP1P17861 261 aa22.65■■□□□ 1.22
RGCC-201ENST00000379359 KLRC1P26715 233 aa22.65■■□□□ 1.22
RGCC-201ENST00000379359 SCRN1Q12765 414 aa22.65■■□□□ 1.22
RGCC-201ENST00000379359 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
RGCC-201ENST00000379359 TJAP1Q5JTD0 557 aa22.65■■□□□ 1.22
RGCC-201ENST00000379359 ZNF484Q5JVG2 852 aa22.65■■□□□ 1.22
RGCC-201ENST00000379359 KRT40Q6A162 431 aa22.65■■□□□ 1.22
RGCC-201ENST00000379359 AIFM3Q96NN9 605 aa22.65■■□□□ 1.22
RGCC-201ENST00000379359 GABBR1Q9UBS5 961 aa22.65■■□□□ 1.22
RGCC-201ENST00000379359 GINS2Q9Y248 185 aa22.65■■□□□ 1.22
RGCC-201ENST00000379359 CUL9Q8IWT3 2517 aa22.65■■□□□ 1.22
RGCC-201ENST00000379359 WDR64B1ANS9 1081 aa22.64■■□□□ 1.21
RGCC-201ENST00000379359 CHMP2AO43633 222 aa22.64■■□□□ 1.21
RGCC-201ENST00000379359 GAS7O60861 476 aa22.64■■□□□ 1.21
RGCC-201ENST00000379359 CD52P31358 61 aa22.64■■□□□ 1.21
RGCC-201ENST00000379359 ERVK-21P61565 698 aa22.64■■□□□ 1.21
RGCC-201ENST00000379359 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
RGCC-201ENST00000379359 GALNT17Q6IS24 598 aa22.64■■□□□ 1.21
RGCC-201ENST00000379359 NME8Q8N427 588 aa22.64■■□□□ 1.21
RGCC-201ENST00000379359 FBXO22Q8NEZ5 403 aa22.64■■□□□ 1.21
RGCC-201ENST00000379359 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
RGCC-201ENST00000379359 TEKT3Q9BXF9 490 aa22.64■■□□□ 1.21
RGCC-201ENST00000379359 TPCN1Q9ULQ1 816 aa22.64■■□□□ 1.21
RGCC-201ENST00000379359 COL1A2P08123 1366 aa22.63■■□□□ 1.21
RGCC-201ENST00000379359 MSH4O15457 936 aa22.63■■□□□ 1.21
RGCC-201ENST00000379359 AK2P54819 239 aa22.63■■□□□ 1.21
RGCC-201ENST00000379359 PAK2Q13177 524 aa22.63■■□□□ 1.21
RGCC-201ENST00000379359 LRCH2Q5VUJ6 765 aa22.63■■□□□ 1.21
RGCC-201ENST00000379359 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
RGCC-201ENST00000379359 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
RGCC-201ENST00000379359 KCNJ14Q9UNX9 436 aa22.63■■□□□ 1.21
RGCC-201ENST00000379359 PFKFB2O60825 505 aa22.62■■□□□ 1.21
RGCC-201ENST00000379359 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
RGCC-201ENST00000379359 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
RGCC-201ENST00000379359 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP22.62■■□□□ 1.21
RGCC-201ENST00000379359 KRT25Q7Z3Z0 450 aa22.62■■□□□ 1.21
RGCC-201ENST00000379359 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
RGCC-201ENST00000379359 METTL13Q8N6R0 699 aa22.62■■□□□ 1.21
RGCC-201ENST00000379359 DAGLBQ8NCG7 672 aa22.62■■□□□ 1.21
RGCC-201ENST00000379359 LENG9Q96B70 501 aa22.62■■□□□ 1.21
RGCC-201ENST00000379359 FAM167AQ96KS9 214 aa22.62■■□□□ 1.21
RGCC-201ENST00000379359 C17orf80Q9BSJ5 609 aa22.62■■□□□ 1.21
RGCC-201ENST00000379359 SUGCTQ9HAC7 445 aa22.62■■□□□ 1.21
RGCC-201ENST00000379359 DISC1Q9NRI5 854 aa22.62■■□□□ 1.21
RGCC-201ENST00000379359 CEP131Q9UPN4 1083 aa22.62■■□□□ 1.21
RGCC-201ENST00000379359 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
RGCC-201ENST00000379359 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa22.61■■□□□ 1.21
RGCC-201ENST00000379359 ENPP3O14638 875 aa22.61■■□□□ 1.21
RGCC-201ENST00000379359 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
RGCC-201ENST00000379359 IL17RAQ96F46 866 aa22.61■■□□□ 1.21
RGCC-201ENST00000379359 SAMD11Q96NU1 681 aa22.61■■□□□ 1.21
RGCC-201ENST00000379359 RIT2Q99578 217 aa22.61■■□□□ 1.21
RGCC-201ENST00000379359 FTHL17Q9BXU8 183 aa22.61■■□□□ 1.21
RGCC-201ENST00000379359 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
RGCC-201ENST00000379359 TDP2O95551 362 aa22.6■■□□□ 1.21
RGCC-201ENST00000379359 ATP4AP20648 1035 aa22.6■■□□□ 1.21
RGCC-201ENST00000379359 JAK3P52333 1124 aa22.6■■□□□ 1.21
RGCC-201ENST00000379359 FIBCD1Q8N539 461 aa22.6■■□□□ 1.21
RGCC-201ENST00000379359 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
RGCC-201ENST00000379359 WASF1Q92558 559 aa22.6■■□□□ 1.21
RGCC-201ENST00000379359 GJA10Q969M2 543 aa22.6■■□□□ 1.21
RGCC-201ENST00000379359 ASB2Q96Q27 587 aa22.6■■□□□ 1.21
RGCC-201ENST00000379359 PPP1R16BQ96T49 567 aa22.6■■□□□ 1.21
RGCC-201ENST00000379359 NRBP2Q9NSY0 501 aa22.6■■□□□ 1.21
RGCC-201ENST00000379359 PADI3Q9ULW8 664 aa22.6■■□□□ 1.21
RGCC-201ENST00000379359 SQORQ9Y6N5 450 aa22.6■■□□□ 1.21
RGCC-201ENST00000379359 STK36Q9NRP7 1315 aa22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms