RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 NEMP1O14524 444 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 TGM5O43548 720 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 EYA4O95677 639 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 CYP17A1P05093 508 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 LSSP48449 732 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 IL2P60568 153 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 CAP1Q01518 475 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 RTP5Q14D33 572 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 SKIDA1Q1XH10 827 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 PHF19Q5T6S3 580 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 EFHBQ8N7U6 833 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 GBP4Q96PP9 640 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 DLL4Q9NR61 685 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 TOMM22Q9NS69 142 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 GOLGA6L22H0YM25 854 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 ZEB2O60315 1214 aa5.45□□□□□ -1.54
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RABGGTB-202ENST00000370826 MC4RP32245 332 aa5.45□□□□□ -1.54
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RABGGTB-202ENST00000370826 FNTBP49356 437 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
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RABGGTB-202ENST00000370826 OCRLQ01968 901 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 VWA3BQ502W6 1294 aa5.45□□□□□ -1.54
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RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 C16orf92Q96LL3 132 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 ZSWIM3Q96MP5 696 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 CLIC6Q96NY7 704 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 TTC1Q99614 292 aa5.45□□□□□ -1.54
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RABGGTB-202ENST00000370826 IFT22Q9H7X7 185 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 EMC7Q9NPA0 242 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 ASB1Q9Y576 335 aa5.45□□□□□ -1.54
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RABGGTB-202ENST00000370826 FFAR3O14843 346 aa5.44□□□□□ -1.54
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RABGGTB-202ENST00000370826 IL18BPO95998 194 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 CPEP16870 476 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 GLRBP48167 497 aa5.44□□□□□ -1.54
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RABGGTB-202ENST00000370826 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 PRR31Q5SQ13 230 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 PASD1Q8IV76 773 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 HIPK4Q8NE63 616 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
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RABGGTB-202ENST00000370826 AMNQ9BXJ7 453 aa5.44□□□□□ -1.54
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RABGGTB-202ENST00000370826 CROTQ9UKG9 612 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 BRINP1O60477 761 aa5.43□□□□□ -1.54
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RABGGTB-202ENST00000370826 PTPROQ16827 1216 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 VMACQ2NL98 169 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 CIAPIN1Q6FI81 312 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 TTLL7Q6ZT98 887 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 C11orf74Q86VG3 221 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP5.43□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM151BQ8IW70 566 aa5.43□□□□□ -1.54
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RABGGTB-202ENST00000370826 WRNIP1Q96S55 665 aa5.43□□□□□ -1.54
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RABGGTB-202ENST00000370826 PCDH12Q9NPG4 1184 aa5.43□□□□□ -1.54
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RABGGTB-202ENST00000370826 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa5.43□□□□□ -1.54
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RABGGTB-202ENST00000370826 SH3D21A4FU49 640 aa5.42□□□□□ -1.54
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RABGGTB-202ENST00000370826 ECE1P42892 770 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 PHC1P78364 1004 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 LRRC32Q14392 662 aa5.42□□□□□ -1.54
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RABGGTB-202ENST00000370826 TERF2Q15554 542 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 GPR158Q5T848 1215 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGGTB-202ENST00000370826 LRSAM1Q6UWE0 723 aa5.42□□□□□ -1.54
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