RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368202.4

PTPRK-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 526 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-201ENST00000368202 CCDC65Q8IXS2 484 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 TRIML1Q8N9V2 468 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 FAM167AQ96KS9 214 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 GPR20Q99678 358 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 C7orf25Q9BPX7 421 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 NRBP2Q9NSY0 501 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 ANKEF1Q9NU02 776 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 EXOC1Q9NV70 894 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 ANO10Q9NW15 660 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 DACH1Q9UI36 760 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 TSKSQ9UJT2 592 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 TRIM17Q9Y577 477 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 A0A087WWV3 80 aa13.56□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 HMGCRP04035 888 aa13.56□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 RPN1P04843 607 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 SLC12A3P55017 1021 aa13.56□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 NLRP12P59046 1061 aa13.56□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 PRKCEQ02156 737 aa13.56□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 ARHGAP1Q07960 439 aa13.56□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 UGCGQ16739 394 aa13.56□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 HSDL1Q3SXM5 330 aa13.56□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 XKR3Q5GH77 459 aa13.56□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 ISM2Q6H9L7 571 aa13.56□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 TLK2Q86UE8 772 aa13.56□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 PPTC7Q8NI37 304 aa13.56□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 PXYLP1Q8TE99 480 aa13.56□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 AFAP1L1Q8TED9 768 aa13.56□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 DDX12PQ92771 950 aa13.56□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 TRIM9Q9C026 710 aa13.56□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 SPC25Q9HBM1 224 aa13.56□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 KCND2Q9NZV8 630 aa13.56□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 TUBE1Q9UJT0 475 aa13.56□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 Q9Y3F1 56 aa13.56□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 EMSYQ7Z589 1322 aa13.56□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa13.56□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 TBCAO75347 108 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 OATP04181 439 aa13.55□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 CYP11B2P19099 503 aa13.55□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 CASP1P29466 404 aa13.55□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 CPT1AP50416 773 aa13.55□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 SLC26A2P50443 739 aa13.55□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 DGKDQ16760 1214 aa13.55□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 SLAIN1Q8ND83 568 aa13.55□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 AFG1LQ8WV93 481 aa13.55□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 CEP170P1Q96L14 293 aa13.55□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 ZHX3Q9H4I2 956 aa13.55□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 PANK4Q9NVE7 773 aa13.55□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 WBP1LQ9NX94 342 aa13.55□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 MAN1B1Q9UKM7 699 aa13.55□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 PCNTO95613 3336 aa13.55□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 MYMKA6NI61 221 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 PPFIA4O75335 1185 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 LGR5O75473 907 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 CYBAP13498 195 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 ELNP15502 786 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 STIM1Q13586 685 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 KCNB1Q14721 858 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 MTERF2Q49AM1 385 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 KMT5BQ4FZB7 885 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 NT5DC1Q5TFE4 455 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 PLA2G4FQ68DD2 849 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 CNNM4Q6P4Q7 775 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 PADI6Q6TGC4 694 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 UNC13DQ70J99 1090 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 LRRC15Q8TF66 581 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 MTRQ99707 1265 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 TIPINQ9BVW5 301 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 ERAP1Q9NZ08 941 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 MYH11P35749 1972 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 ZBTB39O15060 712 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 SEPT4O43236 478 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 ZEB2O60315 1214 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 USO1O60763 962 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 FAM13AO94988 1023 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 CAVIN2O95810 425 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 LGALS2P05162 132 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 MMP3P08254 477 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 RARBP10826 455 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 MARK3P27448 753 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 GRK4P32298 578 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 PPP1R2P41236 205 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRK-201ENST00000368202 SARSP49591 514 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.8 ms