RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 RELTQ969Z4 430 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 NUDT11Q96G61 164 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 WNK4Q96J92 1243 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 PLAAQ9Y263 795 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 DUSP10Q9Y6W6 482 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 PTPDC1A2A3K4 754 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 RASSF10A6NK89 507 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 CBX4O00257 560 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRAF5O00463 557 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 SYN1P17600 705 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 SDHAP31040 664 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 KIF11P52732 1056 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 NFATC3Q12968 1075 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 CATSPEREQ5SY80 951 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 PLEKHH3Q7Z736 793 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 LRRTM3Q86VH5 581 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 NIM1KQ8IY84 436 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 CXorf38Q8TB03 319 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 MBD6Q96DN6 1003 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 GBP4Q96PP9 640 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 BDH2Q9BUT1 245 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 PCIF1Q9H4Z3 704 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 UCKL1Q9NWZ5 548 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 GALNT8Q9NY28 637 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 TBX22Q9Y458 520 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 ASB1Q9Y576 335 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 H7C1D1 291 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 B4GALT3O60512 393 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 KPNA6O60684 536 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 NEK4P51957 841 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 IL13RA1P78552 427 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF174Q15697 407 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 WDR72Q3MJ13 1102 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 CNNM4Q6P4Q7 775 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 Q6ZUG5 572 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 REXO1L1PQ8IX06 675 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 WDR48Q8TAF3 677 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 MFSD3Q96ES6 412 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 B4GALT6Q9UBX8 382 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 ADAM29Q9UKF5 820 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 INVSQ9Y283 1065 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZDHHC9Q9Y397 364 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 CUTAO60888 179 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 MPIG6BO95866 241 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 ECE1P42892 770 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 FNTBP49356 437 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 SURF1Q15526 300 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 TAF7LQ5H9L4 462 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 GPR155Q7Z3F1 870 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 KBTBD2Q8IY47 623 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 PPM1KQ8N3J5 372 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 BTBD2Q9BX70 525 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 AMNQ9BXJ7 453 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR10A5Q9H207 317 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 ACSS2Q9NR19 701 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 FBXO10Q9UK96 956 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 TLDC2A0PJX2 215 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 DVL2O14641 736 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 LAMTOR5O43504 91 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 GAS7O60861 476 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 PLATP00750 562 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 POLD1P28340 1107 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 CSF2RBP32927 897 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 ADCY8P40145 1251 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 STILQ15468 1287 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 GIMAP6Q6P9H5 292 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 LRSAM1Q6UWE0 723 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 OTOP2Q7RTS6 562 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 KIF18BQ86Y91 864 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 IFNL2Q8IZJ0 200 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 KIAA1958Q8N8K9 716 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 CALML6Q8TD86 181 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 AJUBAQ96IF1 538 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 ORAI3Q9BRQ5 295 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 KATNBL1Q9H079 304 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF536O15090 1300 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM83GA6ND36 823 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 B8ZZF3 427 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 GOLGA6L22H0YM25 854 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 B4GALT4O60513 344 aa4.5□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms