RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360286.2

SUDS3-201, Transcript of SDS3 homolog, SIN3A corepressor complex component, humanhuman

TSL 5

Gene SUDS3, Length 510 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3-201ENST00000360286 PDIA5Q14554 519 aa7.21□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 SLC39A14Q15043 492 aa7.21□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 ECM1Q16610 540 aa7.21□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 PTGISQ16647 500 aa7.21□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 TMEM266Q2M3C6 531 aa7.21□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 SPECC1Q5M775 1068 aa7.21□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 POTEBQ6S5H4 581 aa7.21□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa7.21□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 SESTD1Q86VW0 696 aa7.21□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 CATSPER3Q86XQ3 398 aa7.21□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 TPH2Q8IWU9 490 aa7.21□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 FAM126BQ8IXS8 530 aa7.21□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 C7orf61Q8IZ16 206 aa7.21□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
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SUDS3-201ENST00000360286 RDM1Q8NG50 284 aa7.21□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa7.21□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 CLIC6Q96NY7 704 aa7.21□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 CTAGE1Q96RT6 745 aa7.21□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 HSD17B14Q9BPX1 270 aa7.21□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 SH2D3AQ9BRG2 576 aa7.21□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 HTATIP2Q9BUP3 242 aa7.21□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 NRBP2Q9NSY0 501 aa7.21□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 LRWD1Q9UFC0 647 aa7.21□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa7.21□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 CEP131Q9UPN4 1083 aa7.21□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 TRPC6Q9Y210 931 aa7.21□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 EVPLQ92817 2033 aa7.21□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 TRIM43BA6NCK2 446 aa7.2□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 DCDC2CA8MYV0 355 aa7.2□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 TLR3O15455 904 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 HBP1O60381 514 aa7.2□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 OATP04181 439 aa7.2□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 SYN1P17600 705 aa7.2□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 KLRC1P26715 233 aa7.2□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 NASPP49321 788 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 SLC26A2P50443 739 aa7.2□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 ADAM17P78536 824 aa7.2□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 PRKCEQ02156 737 aa7.2□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 PPFIA1Q13136 1202 aa7.2□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 STK38Q15208 465 aa7.2□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 GRIK4Q16099 956 aa7.2□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 MTERF2Q49AM1 385 aa7.2□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 MARCH8Q5T0T0 291 aa7.2□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
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SUDS3-201ENST00000360286 IGSF22Q8N9C0 903 aa7.2□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 ATP8B4Q8TF62 1192 aa7.2□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 ATP6V0A1Q93050 837 aa7.2□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 WNT8BQ93098 351 aa7.2□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 TOX2Q96NM4 488 aa7.2□□□□□ -1.26
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SUDS3-201ENST00000360286 PLIN2Q99541 437 aa7.2□□□□□ -1.26
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SUDS3-201ENST00000360286 CSRNP2Q9H175 543 aa7.2□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 TMEM39AQ9NV64 488 aa7.2□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 NRCAMQ92823 1304 aa7.2□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa7.2□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 RRN3P2A6NIE6 340 aa7.19□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 ZBTB42B2RXF5 422 aa7.19□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 SPTLC2O15270 562 aa7.19□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 BMP15O95972 392 aa7.19□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 CLTBP09497 229 aa7.19□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 NCLP19338 710 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 ITGB8P26012 769 aa7.19□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 RPA1P27694 616 aa7.19□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 HOXC8P31273 242 aa7.19□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 NPEPPSP55786 919 aa7.19□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 XKR3Q5GH77 459 aa7.19□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 ZNF484Q5JVG2 852 aa7.19□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 POTEGQ6S5H5 508 aa7.19□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 MTHFD1LQ6UB35 978 aa7.19□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 RUFY4Q6ZNE9 571 aa7.19□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 USP49Q70CQ1 688 aa7.19□□□□□ -1.26
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SUDS3-201ENST00000360286 C4orf19Q8IY42 314 aa7.19□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 ERMNQ8TAM6 284 aa7.19□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 SNX29Q8TEQ0 813 aa7.19□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 PIGOQ8TEQ8 1089 aa7.19□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 LMBR1Q8WVP7 490 aa7.19□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 EPSTI1Q96J88 318 aa7.19□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 PNMA5Q96PV4 448 aa7.19□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 CEP89Q96ST8 783 aa7.19□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SUDS3-201ENST00000360286 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa7.19□□□□□ -1.26
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