RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335790.7

LMO1-201, Transcript of LIM domain only 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO1, Length 1,279 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1-201ENST00000335790 FIZ1Q96SL8 496 aa14.93□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 NUP58Q9BVL2 599 aa14.93□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 TIPINQ9BVW5 301 aa14.93□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 TTYH3Q9C0H2 523 aa14.93□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 BTBD7Q9P203 1132 aa14.93□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 ARID2Q68CP9 1835 aa14.93□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 A0A1W2PQJ5 194 aa14.92□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 USP27XA6NNY8 438 aa14.92□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 WDR64B1ANS9 1081 aa14.92□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa14.92□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 ATP9AO75110 1047 aa14.92□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 TBCAO75347 108 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 MAPTP10636 758 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 KCNA2P16389 499 aa14.92□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 CASP14P31944 242 aa14.92□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 HOXD13P35453 343 aa14.92□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 QARSP47897 775 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP14.92□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 MAPK7Q13164 816 aa14.92□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 VWA3BQ502W6 1294 aa14.92□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 STRA6Q9BX79 667 aa14.92□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 ANKEF1Q9NU02 776 aa14.92□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 CAPN11Q9UMQ6 739 aa14.92□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 RSPH10B2B2RC85 870 aa14.91□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 B4DLN1 442 aa14.91□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 CNMDO75829 334 aa14.91□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 RGS20O76081 388 aa14.91□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 CCNE2O96020 404 aa14.91□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 RSPH10BP0C881 870 aa14.91□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 EDNRBP24530 442 aa14.91□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 CASP5P51878 434 aa14.91□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 GOLGA8FQ08AF8 430 aa14.91□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa14.91□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa14.91□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 BANK1Q8NDB2 785 aa14.91□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 TMEM174Q8WUU8 243 aa14.91□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 OTUD5Q96G74 571 aa14.91□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa14.91□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 DNAJC7Q99615 494 aa14.91□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 SPATC1LQ9H0A9 340 aa14.91□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 NDST4Q9H3R1 872 aa14.91□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 PARVGQ9HBI0 331 aa14.91□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 ARHGEF35A5YM69 484 aa14.9□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 RASSF10A6NK89 507 aa14.9□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 TRAF5O00463 557 aa14.9□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 ZBTB39O15060 712 aa14.9□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 PPP1R37O75864 691 aa14.9□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 FAM13AO94988 1023 aa14.9□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 SLC25A27O95847 323 aa14.9□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 RARRES1P49788 294 aa14.9□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 PSMC5P62195 406 aa14.9□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 HERVK_113P62684 666 aa14.9□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa14.9□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 GNPTABQ3T906 1256 aa14.9□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 FKBP15Q5T1M5 1219 aa14.9□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 GPAT2Q6NUI2 795 aa14.9□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 GADL1Q6ZQY3 521 aa14.9□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 TMTC1Q8IUR5 882 aa14.9□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 TRIM59Q8IWR1 403 aa14.9□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 REXO1L1PQ8IX06 675 aa14.9□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 DAW1Q8N136 415 aa14.9□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 EDEM3Q9BZQ6 932 aa14.9□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 CREBZFQ9NS37 354 aa14.9□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 ABHD10Q9NUJ1 306 aa14.9□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 TBC1D7Q9P0N9 293 aa14.9□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 SIK3Q9Y2K2 1263 aa14.9□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 DOCK5Q9H7D0 1870 aa14.9□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 ASTN1O14525 1302 aa14.9□□□□□ -0.02
LMO1-201ENST00000335790 TTC26A0AVF1 554 aa14.89□□□□□ -0.03
LMO1-201ENST00000335790 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
LMO1-201ENST00000335790 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa14.89□□□□□ -0.03
LMO1-201ENST00000335790 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
LMO1-201ENST00000335790 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
LMO1-201ENST00000335790 ZSCAN12O43309 604 aa14.89□□□□□ -0.03
LMO1-201ENST00000335790 CALUO43852 315 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
LMO1-201ENST00000335790 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP14.89□□□□□ -0.03
LMO1-201ENST00000335790 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
LMO1-201ENST00000335790 MYBP10242 640 aa14.89□□□□□ -0.03
LMO1-201ENST00000335790 TNNT1P13805 278 aa14.89□□□□□ -0.03
LMO1-201ENST00000335790 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
LMO1-201ENST00000335790 PPP2R3AQ06190 1150 aa14.89□□□□□ -0.03
LMO1-201ENST00000335790 ALCAMQ13740 583 aa14.89□□□□□ -0.03
LMO1-201ENST00000335790 PTPN14Q15678 1187 aa14.89□□□□□ -0.03
LMO1-201ENST00000335790 PADI6Q6TGC4 694 aa14.89□□□□□ -0.03
LMO1-201ENST00000335790 MOB2Q70IA6 237 aa14.89□□□□□ -0.03
LMO1-201ENST00000335790 ZNF720Q7Z2F6 126 aa14.89□□□□□ -0.03
LMO1-201ENST00000335790 FRMD5Q7Z6J6 570 aa14.89□□□□□ -0.03
LMO1-201ENST00000335790 FAM133AQ8N9E0 248 aa14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.1 ms