RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331559.9

MEIS3-201, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene MEIS3, Length 2,104 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-201ENST00000331559 KCND2Q9NZV8 630 aa25.55■■□□□ 1.68
MEIS3-201ENST00000331559 RPTORQ8N122 1335 aa25.55■■□□□ 1.68
MEIS3-201ENST00000331559 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
MEIS3-201ENST00000331559 CHMP2AO43633 222 aa25.55■■□□□ 1.68
MEIS3-201ENST00000331559 CYP27A1Q02318 531 aa25.55■■□□□ 1.68
MEIS3-201ENST00000331559 NIPA1Q7RTP0 329 aa25.55■■□□□ 1.68
MEIS3-201ENST00000331559 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
MEIS3-201ENST00000331559 HOOK2Q96ED9 719 aa25.55■■□□□ 1.68
MEIS3-201ENST00000331559 NACC1Q96RE7 527 aa25.55■■□□□ 1.68
MEIS3-201ENST00000331559 MMS19Q96T76 1030 aa25.55■■□□□ 1.68
MEIS3-201ENST00000331559 MTFR1LQ9H019 292 aa25.55■■□□□ 1.68
MEIS3-201ENST00000331559 DUSP10Q9Y6W6 482 aa25.55■■□□□ 1.68
MEIS3-201ENST00000331559 LTBP3Q9NS15 1303 aa25.54■■□□□ 1.68
MEIS3-201ENST00000331559 LRRC53A6NM62 1247 aa25.54■■□□□ 1.68
MEIS3-201ENST00000331559 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP25.54■■□□□ 1.68
MEIS3-201ENST00000331559 FAM13AO94988 1023 aa25.54■■□□□ 1.68
MEIS3-201ENST00000331559 GYS2P54840 703 aa25.54■■□□□ 1.68
MEIS3-201ENST00000331559 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
MEIS3-201ENST00000331559 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa25.54■■□□□ 1.68
MEIS3-201ENST00000331559 LCA5LO95447 670 aa25.54■■□□□ 1.68
MEIS3-201ENST00000331559 RPL13P26373 211 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
MEIS3-201ENST00000331559 EPS15P42566 896 aa25.54■■□□□ 1.68
MEIS3-201ENST00000331559 B3GNT9Q6UX72 402 aa25.54■■□□□ 1.68
MEIS3-201ENST00000331559 UNC45AQ9H3U1 944 aa25.54■■□□□ 1.68
MEIS3-201ENST00000331559 DEF6Q9H4E7 631 aa25.54■■□□□ 1.68
MEIS3-201ENST00000331559 SEL1LQ9UBV2 794 aa25.54■■□□□ 1.68
MEIS3-201ENST00000331559 FRMPD4Q14CM0 1322 aa25.53■■□□□ 1.68
MEIS3-201ENST00000331559 RSPH10B2B2RC85 870 aa25.53■■□□□ 1.68
MEIS3-201ENST00000331559 USO1O60763 962 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
MEIS3-201ENST00000331559 TUBBP07437 444 aa25.53■■□□□ 1.68
MEIS3-201ENST00000331559 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
MEIS3-201ENST00000331559 RSPH10BP0C881 870 aa25.53■■□□□ 1.68
MEIS3-201ENST00000331559 MYBP10242 640 aa25.53■■□□□ 1.68
MEIS3-201ENST00000331559 ARP10275 920 aa25.53■■□□□ 1.68
MEIS3-201ENST00000331559 KIF5AQ12840 1032 aa25.53■■□□□ 1.68
MEIS3-201ENST00000331559 TAF3Q5VWG9 929 aa25.53■■□□□ 1.68
MEIS3-201ENST00000331559 WDR93Q6P2C0 686 aa25.53■■□□□ 1.68
MEIS3-201ENST00000331559 C1orf186Q6ZWK4 172 aa25.53■■□□□ 1.68
MEIS3-201ENST00000331559 TXLNBQ8N3L3 684 aa25.53■■□□□ 1.68
MEIS3-201ENST00000331559 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa25.52■■□□□ 1.68
MEIS3-201ENST00000331559 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
MEIS3-201ENST00000331559 ZNF263O14978 683 aa25.52■■□□□ 1.68
MEIS3-201ENST00000331559 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
MEIS3-201ENST00000331559 GCNT3O95395 438 aa25.52■■□□□ 1.68
MEIS3-201ENST00000331559 ERCC3P19447 782 aa25.52■■□□□ 1.68
MEIS3-201ENST00000331559 PIGOQ8TEQ8 1089 aa25.52■■□□□ 1.68
MEIS3-201ENST00000331559 CLEC4DQ8WXI8 215 aa25.52■■□□□ 1.68
MEIS3-201ENST00000331559 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
MEIS3-201ENST00000331559 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
MEIS3-201ENST00000331559 GBP3Q9H0R5 595 aa25.52■■□□□ 1.68
MEIS3-201ENST00000331559 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
MEIS3-201ENST00000331559 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
MEIS3-201ENST00000331559 UBE4BO95155 1302 aa25.52■■□□□ 1.68
MEIS3-201ENST00000331559 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
MEIS3-201ENST00000331559 KIF11P52732 1056 aa25.52■■□□□ 1.68
MEIS3-201ENST00000331559 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
MEIS3-201ENST00000331559 MICALL2Q8IY33 904 aa25.52■■□□□ 1.68
MEIS3-201ENST00000331559 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
MEIS3-201ENST00000331559 ZBTB9Q96C00 473 aa25.52■■□□□ 1.68
MEIS3-201ENST00000331559 CAPZA3Q96KX2 299 aa25.52■■□□□ 1.68
MEIS3-201ENST00000331559 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa25.52■■□□□ 1.68
MEIS3-201ENST00000331559 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
MEIS3-201ENST00000331559 HOXD13P35453 343 aa25.51■■□□□ 1.67
MEIS3-201ENST00000331559 USP14P54578 494 aa25.51■■□□□ 1.67
MEIS3-201ENST00000331559 CCDC155Q8N6L0 562 aa25.51■■□□□ 1.67
MEIS3-201ENST00000331559 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
MEIS3-201ENST00000331559 ODF2LQ9ULJ1 636 aa25.51■■□□□ 1.67
MEIS3-201ENST00000331559 MACROD2A1Z1Q3 448 aa25.51■■□□□ 1.67
MEIS3-201ENST00000331559 EGFRP00533 1210 aa25.51■■□□□ 1.67
MEIS3-201ENST00000331559 FDX1P10109 184 aa25.51■■□□□ 1.67
MEIS3-201ENST00000331559 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
MEIS3-201ENST00000331559 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
MEIS3-201ENST00000331559 CASP8Q14790 479 aa25.51■■□□□ 1.67
MEIS3-201ENST00000331559 DCAF15Q66K64 600 aa25.51■■□□□ 1.67
MEIS3-201ENST00000331559 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa25.51■■□□□ 1.67
MEIS3-201ENST00000331559 PARVGQ9HBI0 331 aa25.51■■□□□ 1.67
MEIS3-201ENST00000331559 NFIBO00712 420 aa25.5■■□□□ 1.67
MEIS3-201ENST00000331559 AKR1B10O60218 316 aa25.5■■□□□ 1.67
MEIS3-201ENST00000331559 KCNH2Q12809 1159 aa25.5■■□□□ 1.67
MEIS3-201ENST00000331559 NFIL3Q16649 462 aa25.5■■□□□ 1.67
MEIS3-201ENST00000331559 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
MEIS3-201ENST00000331559 ANO9A1A5B4 782 aa25.49■■□□□ 1.67
MEIS3-201ENST00000331559 NOL4O94818 638 aa25.49■■□□□ 1.67
MEIS3-201ENST00000331559 GPS2Q13227 327 aa25.49■■□□□ 1.67
MEIS3-201ENST00000331559 SFMBT2Q5VUG0 894 aa25.49■■□□□ 1.67
MEIS3-201ENST00000331559 MYCT1Q8N699 235 aa25.49■■□□□ 1.67
MEIS3-201ENST00000331559 ADAM21Q9UKJ8 722 aa25.49■■□□□ 1.67
MEIS3-201ENST00000331559 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa25.49■■□□□ 1.67
MEIS3-201ENST00000331559 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
MEIS3-201ENST00000331559 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
MEIS3-201ENST00000331559 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa25.49■■□□□ 1.67
MEIS3-201ENST00000331559 ASTN1O14525 1302 aa25.49■■□□□ 1.67
MEIS3-201ENST00000331559 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
MEIS3-201ENST00000331559 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
MEIS3-201ENST00000331559 NR3C1P04150 777 aa25.49■■□□□ 1.67
MEIS3-201ENST00000331559 EPB41P11171 864 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
MEIS3-201ENST00000331559 ALAS1P13196 640 aa25.49■■□□□ 1.67
MEIS3-201ENST00000331559 ITGB5P18084 799 aa25.49■■□□□ 1.67
MEIS3-201ENST00000331559 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa25.49■■□□□ 1.67
MEIS3-201ENST00000331559 PCNX4Q63HM2 1172 aa25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms