RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328839.3

PPP4R4-202, Transcript of protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP4R4, Length 876 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4-202ENST00000328839 RASEFQ8IZ41 740 aa28.55■■■□□ 2.16
PPP4R4-202ENST00000328839 LINC01599Q8WXQ3 324 aa28.55■■■□□ 2.16
PPP4R4-202ENST00000328839 BARHL2Q9NY43 387 aa28.55■■■□□ 2.16
PPP4R4-202ENST00000328839 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa28.55■■■□□ 2.16
PPP4R4-202ENST00000328839 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa28.55■■■□□ 2.16
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PPP4R4-202ENST00000328839 DGKIO75912 1065 aa28.54■■■□□ 2.16
PPP4R4-202ENST00000328839 LINC00271P0C7V0 271 aa28.54■■■□□ 2.16
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PPP4R4-202ENST00000328839 GLT8D2Q9H1C3 349 aa28.54■■■□□ 2.16
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PPP4R4-202ENST00000328839 PI4K2BG5E9Z4 385 aa28.53■■■□□ 2.16
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PPP4R4-202ENST00000328839 C11orf16Q9NQ32 467 aa28.52■■■□□ 2.16
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PPP4R4-202ENST00000328839 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa28.51■■■□□ 2.15
PPP4R4-202ENST00000328839 GPR37L1O60883 481 aa28.51■■■□□ 2.15
PPP4R4-202ENST00000328839 CDC45O75419 566 aa28.51■■■□□ 2.15
PPP4R4-202ENST00000328839 CLK2P49760 499 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
PPP4R4-202ENST00000328839 SLC26A2P50443 739 aa28.51■■■□□ 2.15
PPP4R4-202ENST00000328839 KRT76Q01546 638 aa28.51■■■□□ 2.15
PPP4R4-202ENST00000328839 TSGA10IPQ3SY00 556 aa28.51■■■□□ 2.15
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PPP4R4-202ENST00000328839 NPAS4Q8IUM7 802 aa28.51■■■□□ 2.15
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PPP4R4-202ENST00000328839 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
PPP4R4-202ENST00000328839 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
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PPP4R4-202ENST00000328839 ATG7O95352 703 aa28.5■■■□□ 2.15
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PPP4R4-202ENST00000328839 STAG3L1P0CL83 205 aa28.5■■■□□ 2.15
PPP4R4-202ENST00000328839 SCG2P13521 617 aa28.5■■■□□ 2.15
PPP4R4-202ENST00000328839 KLRC1P26715 233 aa28.5■■■□□ 2.15
PPP4R4-202ENST00000328839 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP28.5■■■□□ 2.15
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PPP4R4-202ENST00000328839 TMEM266Q2M3C6 531 aa28.5■■■□□ 2.15
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PPP4R4-202ENST00000328839 HYAL1Q12794 435 aa28.49■■■□□ 2.15
PPP4R4-202ENST00000328839 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
PPP4R4-202ENST00000328839 COL19A1Q14993 1142 aa28.49■■■□□ 2.15
PPP4R4-202ENST00000328839 NIPA1Q7RTP0 329 aa28.49■■■□□ 2.15
PPP4R4-202ENST00000328839 NME8Q8N427 588 aa28.49■■■□□ 2.15
PPP4R4-202ENST00000328839 ZNF302Q9NR11 478 aa28.49■■■□□ 2.15
PPP4R4-202ENST00000328839 FAM86B1E9PN63 330 aa28.48■■■□□ 2.15
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PPP4R4-202ENST00000328839 MMP1P03956 469 aa28.48■■■□□ 2.15
PPP4R4-202ENST00000328839 FAM86B2P0C5J1 330 aa28.48■■■□□ 2.15
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PPP4R4-202ENST00000328839 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa28.47■■■□□ 2.15
PPP4R4-202ENST00000328839 LTBRP36941 435 aa28.47■■■□□ 2.15
PPP4R4-202ENST00000328839 RCAN1P53805 252 aa28.47■■■□□ 2.15
PPP4R4-202ENST00000328839 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa28.47■■■□□ 2.15
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PPP4R4-202ENST00000328839 PLAGL2Q9UPG8 496 aa28.47■■■□□ 2.15
PPP4R4-202ENST00000328839 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa28.46■■■□□ 2.15
PPP4R4-202ENST00000328839 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
PPP4R4-202ENST00000328839 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP28.46■■■□□ 2.159e-7■■□□□ 13.9
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PPP4R4-202ENST00000328839 SWSAP1Q6NVH7 229 aa28.46■■■□□ 2.15
PPP4R4-202ENST00000328839 Q6ZUG5 572 aa28.46■■■□□ 2.15
PPP4R4-202ENST00000328839 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
PPP4R4-202ENST00000328839 P2RX5Q93086 422 aa28.46■■■□□ 2.15
PPP4R4-202ENST00000328839 PPP1R16BQ96T49 567 aa28.46■■■□□ 2.15
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PPP4R4-202ENST00000328839 TMX1Q9H3N1 280 aa28.46■■■□□ 2.15
PPP4R4-202ENST00000328839 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa28.46■■■□□ 2.15
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