RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318121.7

CLSPN-202, Transcript of claspin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLSPN, Length 4,169 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPN-202ENST00000318121 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa6.46□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 EXOC1Q9NV70 894 aa6.46□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 TSKSQ9UJT2 592 aa6.46□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 TRPC6Q9Y210 931 aa6.46□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 POTEFA5A3E0 1075 aa6.46□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 SORBS3O60504 671 aa6.46□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 MED24O75448 989 aa6.46□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 SLITRK3O94933 977 aa6.46□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 GNAT1P11488 350 aa6.46□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 CAPN2P17655 700 aa6.46□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 GAP43P17677 238 aa6.46□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 TPM4P67936 248 aa6.46□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 MCM6Q14566 821 aa6.46□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 POTEGQ6S5H5 508 aa6.46□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 B3GNT9Q6UX72 402 aa6.46□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 SLC7A3Q8WY07 619 aa6.46□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 CEP170P1Q96L14 293 aa6.46□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 BHMT2Q9H2M3 363 aa6.46□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa6.46□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 EMSYQ7Z589 1322 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 RRN3P2A6NIE6 340 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 H0YCG3 227 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 GAS2O43903 313 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 CABYRO75952 493 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 ATG7O95352 703 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 CCNE2O96020 404 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 ELNP15502 786 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 TMOD1P28289 359 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 ABCD1P33897 745 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 ARHGAP1Q07960 439 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 GNASQ5JWF2 1037 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 CNNM4Q6P4Q7 775 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 RETREG2Q8NC44 543 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 VTI1AQ96AJ9 217 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 PAGE5Q96GU1 130 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 IFT74Q96LB3 600 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 GPR20Q99678 358 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 KIAA1468Q9P260 1216 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 E9PMD0 336 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 MAGEB2O15479 319 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 DGAT1O75907 488 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 OATP04181 439 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 INHAP05111 366 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 MYL3P08590 195 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 CYBAP13498 195 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 SMPD1P17405 629 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 YWHABP31946 246 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 RFC5P40937 340 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 PRKCEQ02156 737 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 PPP2R5AQ15172 486 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 ZNF484Q5JVG2 852 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 AFAP1L1Q8TED9 768 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 ATP8B4Q8TF62 1192 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 TCP11Q8WWU5 503 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 DRC1Q96MC2 740 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 PNMA5Q96PV4 448 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 PTPN22Q9Y2R2 807 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 MCM3APO60318 1980 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 CCDC85CA6NKD9 419 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 SMTNP53814 917 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 STX1AQ16623 288 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 PADI6Q6TGC4 694 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 COPS5Q92905 334 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 C7orf25Q9BPX7 421 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 KBTBD4Q9NVX7 518 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 SEL1LQ9UBV2 794 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 LGR5O75473 907 aa6.44□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 ARIH2O95376 493 aa6.44□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 LGALS2P05162 132 aa6.44□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa6.44□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 SP2Q02086 613 aa6.44□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 PSMD2Q13200 908 aa6.44□□□□□ -1.38
CLSPN-202ENST00000318121 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa6.44□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms