RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299084.8

SPRED1-201, Transcript of sprouty related EVH1 domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPRED1, Length 7,780 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRED1-201ENST00000299084 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 ANKRD44Q8N8A2 993 aa15.38■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 ARHGAP45Q92619 1136 aa15.38■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 CAPS2Q9BXY5 557 aa15.38■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 KCNJ18B7U540 433 aa15.38■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 GOLGA8KD6RF30 607 aa15.38■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 ZBED1O96006 694 aa15.38■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP15.38■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 KCNJ12Q14500 433 aa15.38■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 ANGPT1Q15389 498 aa15.38■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 NLRP9Q7RTR0 991 aa15.38■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa15.38■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 KLRF2D3W0D1 207 aa15.38■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 OR52Z1P0C646 297 aa15.38■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 TRPC1P48995 793 aa15.38■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 CTSWP56202 376 aa15.38■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 MYL10Q9BUA6 226 aa15.38■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 SPATA16Q9BXB7 569 aa15.38■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 DCTN3O75935 186 aa15.38■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 UBXN2AP68543 259 aa15.38■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa15.38■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 AMNQ9BXJ7 453 aa15.38■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 KCNJ14Q9UNX9 436 aa15.38■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 RALAP11233 206 aa15.37■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 CPB1P15086 417 aa15.37■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 MORC3Q14149 939 aa15.37■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 GCKRQ14397 625 aa15.37■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 SGO2Q562F6 1265 aa15.37■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 GAP43P17677 238 aa15.37■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa15.37■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 ABCC1P33527 1531 aa15.37■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 CCDC78A2IDD5 438 aa15.37■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 TMEM206Q9H813 350 aa15.37■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 KDM1AO60341 852 aa15.37■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 HUS1O60921 280 aa15.37■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 GJA10Q969M2 543 aa15.37■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 PEG3Q9GZU2 1588 aa15.37■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 TTLL1O95922 423 aa15.37■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 A0A1B0GW55 424 aa15.36■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 DUX4L2P0CJ85 424 aa15.36■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 DUX4L3P0CJ86 424 aa15.36■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 DUX4L4P0CJ87 422 aa15.36■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 DUX4L5P0CJ88 424 aa15.36■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 DUX4L6P0CJ89 424 aa15.36■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 DUX4L7P0CJ90 424 aa15.36■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 CD58P19256 250 aa15.36■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 DUX4Q9UBX2 424 aa15.36■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa15.36■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 SATB2Q9UPW6 733 aa15.36■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 C5orf58C9J3I9 102 aa15.36■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 IFNAR2P48551 515 aa15.36■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 TAS2R42Q7RTR8 314 aa15.36■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 EXD1Q8NHP7 514 aa15.36■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 ANKRD49Q8WVL7 239 aa15.36■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 MT-ND3P03897 115 aa15.36■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 KIAA1024Q9UPX6 916 aa15.36■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa15.36■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 AATKQ6ZMQ8 1374 aa15.36■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa15.36■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 MAP3K13O43283 966 aa15.36■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 DDHD2O94830 711 aa15.36■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 DDIT3P35638 169 aa15.36■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 WDR11Q9BZH6 1224 aa15.36■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 CCDC90BQ9GZT6 254 aa15.36■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 TMEM161AQ9NX61 479 aa15.36■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 RALGAPBQ86X10 1494 aa15.36■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 ZMYND10O75800 440 aa15.36■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 AP1B1Q10567 949 aa15.36■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 TJP2Q9UDY2 1190 aa15.36■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 SNX5Q9Y5X3 404 aa15.36■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 TADA1Q96BN2 335 aa15.36■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 HES6Q96HZ4 224 aa15.36■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 MTX1Q13505 466 aa15.35■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 KRT77Q7Z794 578 aa15.35■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 BCAS4Q8TDM0 211 aa15.35■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 CCDC17Q96LX7 622 aa15.35■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 RUBCNLQ9H714 662 aa15.35■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 SCUBE2Q9NQ36 999 aa15.35■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa15.35■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 ARHGEF10O15013 1369 aa15.35■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 SLC27A2O14975 620 aa15.35■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 TMED2Q15363 201 aa15.35■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 FAM196AQ6ZSG2 479 aa15.35■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 STAMQ92783 540 aa15.35■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
SPRED1-201ENST00000299084 TUBB6Q9BUF5 446 aa15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms