RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 SEPT1Q8WYJ6 367 aa23.07■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 BPIFA3Q9BQP9 254 aa23.07■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 CBX8Q9HC52 389 aa23.07■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF302Q9NR11 478 aa23.07■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 KCND2Q9NZV8 630 aa23.07■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa23.06■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 RINT1Q6NUQ1 792 aa23.06■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 COPS5Q92905 334 aa23.06■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 RUSC1Q9BVN2 902 aa23.06■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 PCNTO95613 3336 aa23.06■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa23.06■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa23.05■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 GH1P01241 217 aa23.05■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 LAMC2Q13753 1193 aa23.05■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 HSDL1Q3SXM5 330 aa23.05■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 IQSEC1Q6DN90 963 aa23.05■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 GPR20Q99678 358 aa23.05■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 ANKEF1Q9NU02 776 aa23.05■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF862O60290 1169 aa23.05■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 RARRES1P49788 294 aa23.05■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 DUSP28Q4G0W2 176 aa23.05■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM63BQ5T3F8 832 aa23.05■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM160B1Q5W0V3 765 aa23.05■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 OTUD6AQ7L8S5 288 aa23.05■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 LUZP1Q86V48 1076 aa23.05■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC65Q8IXS2 484 aa23.05■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 REEP2Q9BRK0 252 aa23.05■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 PANK4Q9NVE7 773 aa23.05■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa23.04■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP23.04■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 CYP2C19P33261 490 aa23.04■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 FLT3LGP49771 235 aa23.04■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 PRKCEQ02156 737 aa23.04■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 ARHGAP1Q07960 439 aa23.04■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa23.04■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 GIT2Q14161 759 aa23.04■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC144BQ3MJ40 725 aa23.04■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 C1orf186Q6ZWK4 172 aa23.04■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 AZI2Q9H6S1 392 aa23.04■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 BECN2A8MW95 431 aa23.03■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 PRKCZQ05513 592 aa23.03■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 IQCB1Q15051 598 aa23.03■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 PADI6Q6TGC4 694 aa23.03■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 ANO5Q75V66 913 aa23.03■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 AFAP1L1Q8TED9 768 aa23.03■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 SAGE1Q9NXZ1 904 aa23.03■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 GDAQ9Y2T3 454 aa23.03■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 ARID2Q68CP9 1835 aa23.03■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 FRMD3A2A2Y4 597 aa23.03■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 IGHA2P01877 340 aa23.03■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 SMPD1P17405 629 aa23.03■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 STAT5BP51692 787 aa23.03■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 COASYQ13057 564 aa23.03■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 XKR9Q5GH70 373 aa23.03■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 XKR3Q5GH77 459 aa23.03■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 GABRQQ9UN88 632 aa23.03■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 GPR25O00155 361 aa23.02■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 TBCAO75347 108 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 GUCY2CP25092 1073 aa23.02■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 EHHADHQ08426 723 aa23.02■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 PSMD2Q13200 908 aa23.02■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 UVSSAQ2YD98 709 aa23.02■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa23.02■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 PCYT2Q99447 389 aa23.02■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 EMSYQ7Z589 1322 aa23.02■■□□□ 1.28
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM150BA6NC51 233 aa23.01■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa23.01■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 LGR5O75473 907 aa23.01■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 TNFAIP2Q03169 654 aa23.01■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 PLA2G4FQ68DD2 849 aa23.01■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 AOPEPQ8N6M6 819 aa23.01■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 PPTC7Q8NI37 304 aa23.01■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 ODF2LQ9ULJ1 636 aa23.01■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa23.01■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 STBD1O95210 358 aa23.01■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 OATP04181 439 aa23.01■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 CD44P16070 742 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 HOXD10P28358 340 aa23.01■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 STK4Q13043 487 aa23.01■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 STIM1Q13586 685 aa23.01■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 GLG1Q92896 1179 aa23.01■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 ZHX3Q9H4I2 956 aa23.01■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 PTGS1P23219 599 aa23■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 NPEPPSP55786 919 aa23■■□□□ 1.27
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