RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293826.4

TNFSF12-TNFSF13-201, Transcript of TNFSF12-TNFSF13 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFSF12-TNFSF13, Length 1,816 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NEK9Q8TD19 979 aa26.6■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SPATA33Q96N06 139 aa26.6■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PCYT2Q99447 389 aa26.6■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TRIM9Q9C026 710 aa26.6■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa26.6■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SAGE1Q9NXZ1 904 aa26.6■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SMTNL1A8MU46 457 aa26.59■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa26.59■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MORC3Q14149 939 aa26.59■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa26.59■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RDM1Q8NG50 284 aa26.59■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GPR20Q99678 358 aa26.59■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MAGEF1Q9HAY2 307 aa26.59■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 BACH1O14867 736 aa26.58■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ELNP15502 786 aa26.58■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 BMP6P22004 513 aa26.58■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PSMC5P62195 406 aa26.58■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SARM1Q6SZW1 724 aa26.58■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TRPV1Q8NER1 839 aa26.58■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 POLD4Q9HCU8 107 aa26.58■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ESPNB1AK53 854 aa26.58■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FKTNO75072 461 aa26.58■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 EYA4O95677 639 aa26.58■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ARSHQ5FYA8 562 aa26.58■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TRIM50Q86XT4 487 aa26.58■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MLKLQ8NB16 471 aa26.58■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SRRDQ9UH36 339 aa26.58■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 IKBKBO14920 756 aa26.57■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KLRC4O43908 158 aa26.57■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CYP11B2P19099 503 aa26.57■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CLCN1P35523 988 aa26.57■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PLA2G4FQ68DD2 849 aa26.57■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GPBP1Q86WP2 473 aa26.57■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DDX12PQ92771 950 aa26.57■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GSDMAQ96QA5 445 aa26.57■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NACC1Q96RE7 527 aa26.57■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 C7orf25Q9BPX7 421 aa26.57■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RUSC1Q9BVN2 902 aa26.57■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TRIM5Q9C035 493 aa26.57■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 STBD1O95210 358 aa26.56■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RPN1P04843 607 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PTMAP06454 111 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ATP4AP20648 1035 aa26.56■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DUSP28Q4G0W2 176 aa26.56■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SEPT1Q8WYJ6 367 aa26.56■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa26.56■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa26.55■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NOP56O00567 594 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GH1P01241 217 aa26.55■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MUTP22033 750 aa26.55■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 YWHABP31946 246 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF75DP51815 510 aa26.55■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TPM4P67936 248 aa26.55■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ASIC1P78348 528 aa26.55■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TNFAIP2Q03169 654 aa26.55■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 IQSEC1Q6DN90 963 aa26.55■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 C4orf19Q8IY42 314 aa26.55■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa26.55■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF302Q9NR11 478 aa26.55■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DACH1Q9UI36 760 aa26.55■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa26.55■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NPEPPSP55786 919 aa26.55■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ANO5Q75V66 913 aa26.55■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 AFG1LQ8WV93 481 aa26.55■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DNAJC19Q96DA6 116 aa26.55■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LYPLA2O95372 231 aa26.54■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PRKCEQ02156 737 aa26.54■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NCAPHQ15003 741 aa26.54■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KMT5BQ4FZB7 885 aa26.54■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HPS3Q969F9 1004 aa26.54■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 AMPD3Q01432 767 aa26.53■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ATP6V0A1Q93050 837 aa26.53■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ERO1AQ96HE7 468 aa26.53■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RARRES1P49788 294 aa26.53■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LAMC2Q13753 1193 aa26.53■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RINT1Q6NUQ1 792 aa26.53■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR6J1Q8NGC5 347 aa26.53■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 BEGAINQ9BUH8 593 aa26.53■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 WBP1LQ9NX94 342 aa26.53■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CYBAP13498 195 aa26.52■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MARK3P27448 753 aa26.52■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MYL5Q02045 173 aa26.52■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RSPH10B2B2RC85 870 aa26.51■■□□□ 1.83
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RSPH10BP0C881 870 aa26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.7 ms