RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291892.10

RDH13-201, Transcript of retinol dehydrogenase 13, humanhuman

TSL 2

Gene RDH13, Length 3,022 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH13-201ENST00000291892 LLGL1Q15334 1064 aa14.75□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 FIGNQ5HY92 759 aa14.75□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 FAM83BQ5T0W9 1011 aa14.75□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 PEX26Q7Z412 305 aa14.75□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 VSIG1Q86XK7 387 aa14.75□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 KIAA0895Q8NCT3 520 aa14.75□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 SCFD2Q8WU76 684 aa14.75□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 ARHGEF3Q9NR81 526 aa14.75□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 NMT2O60551 498 aa14.75□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 GH1P01241 217 aa14.75□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 KRT13P13646 458 aa14.75□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 PMS2P54278 862 aa14.75□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 CHRNA2Q15822 529 aa14.75□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 INF2Q27J81 1249 aa14.75□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 KIAA0825Q8IV33 1275 aa14.75□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 TEX9Q8N6V9 391 aa14.75□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 FBXO25Q8TCJ0 367 aa14.75□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 HAO1Q9UJM8 370 aa14.75□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 USH1CQ9Y6N9 552 aa14.75□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 FAM205AQ6ZU69 1335 aa14.75□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 MAN2A1Q16706 1144 aa14.74□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 CATIPQ7Z7H3 387 aa14.74□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 DNAJC9Q8WXX5 260 aa14.74□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 KIFAP3Q92845 792 aa14.74□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP14.74□□□□□ -0.053e-7■■■□□ 15
RDH13-201ENST00000291892 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 TMEM59LQ9UK28 342 aa14.74□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 PPFIA2O75334 1257 aa14.74□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 ETS2P15036 469 aa14.74□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 LONP1P36776 959 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 ZNF131P52739 623 aa14.74□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 CCDC6Q16204 474 aa14.74□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 LONRF1Q17RB8 773 aa14.74□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 TNFRSF25Q93038 417 aa14.74□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 TRIM9Q9C026 710 aa14.74□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa14.74□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 RHBDL2Q9NX52 303 aa14.74□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 TBC1D7Q9P0N9 293 aa14.74□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 RGPD2P0DJD1 1756 aa14.74□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 NBPF26B4DH59 902 aa14.74□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 PEX5P50542 639 aa14.74□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 KCNMA1Q12791 1236 aa14.74□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 UBE3CQ15386 1083 aa14.74□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 NBPF15Q8N660 670 aa14.74□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 MAIP1Q8WWC4 291 aa14.74□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa14.74□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 CCDC169A6NNP5 214 aa14.73□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 ATP6V1C1P21283 382 aa14.73□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 CALB2P22676 271 aa14.73□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 PLS1Q14651 629 aa14.73□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa14.73□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 FOXB2Q5VYV0 432 aa14.73□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 KCNH5Q8NCM2 988 aa14.73□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 CENPTQ96BT3 561 aa14.73□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 PEX11AO75192 247 aa14.73□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 CIAO1O76071 339 aa14.73□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 SERPING1P05155 500 aa14.73□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 CNGA2Q16280 664 aa14.73□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 SLC18A3Q16572 532 aa14.73□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 NACAP1Q9BZK3 213 aa14.73□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 TRIM7Q9C029 511 aa14.73□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa14.72□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 ZCCHC18P0CG32 403 aa14.72□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 TPBGLP0DKB5 382 aa14.72□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 EPHB2P29323 1055 aa14.72□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 USP11P51784 963 aa14.72□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 RASIP1Q5U651 963 aa14.72□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 BICDL1Q6ZP65 573 aa14.72□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 CABP7Q86V35 215 aa14.72□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 PIGOQ8TEQ8 1089 aa14.72□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 ERP27Q96DN0 273 aa14.72□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 EPB41L4BQ9H329 900 aa14.72□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa14.72□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa14.72□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 TBK1Q9UHD2 729 aa14.72□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 INTUQ9ULD6 942 aa14.72□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa14.72□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa14.72□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 TMEM120BA0PK00 339 aa14.72□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 NPTXRO95502 500 aa14.72□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 TXNRD1Q16881 649 aa14.72□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 GALNTL6Q49A17 601 aa14.72□□□□□ -0.05
RDH13-201ENST00000291892 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.8 ms