RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289865.12

USP21-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 21, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP21, Length 2,195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21-201ENST00000289865 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 BUB1O43683 1085 aa21.14■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 AKAP3O75969 853 aa21.14■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 SLITRK3O94933 977 aa21.14■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 AFPP02771 609 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 NR3C1P04150 777 aa21.14■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 KCNA1Q09470 495 aa21.14■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 PPP2R5CQ13362 524 aa21.14■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 RTKN2Q8IZC4 609 aa21.14■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 SLC5A5Q92911 643 aa21.14■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 NOX5Q96PH1 765 aa21.14■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 OSBPL9Q96SU4 736 aa21.14■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 HYOU1Q9Y4L1 999 aa21.14■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 NCK2O43639 380 aa21.13■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 GAS7O60861 476 aa21.13■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 GAP43P17677 238 aa21.13■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 SLC9A1P19634 815 aa21.13■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 MCM3P25205 808 aa21.13■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 POLD1P28340 1107 aa21.13■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 KLHL30Q0D2K2 578 aa21.13■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 GPS2Q13227 327 aa21.13■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 TEX2Q8IWB9 1127 aa21.13■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 PSMB7Q99436 277 aa21.13■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 PSMD1Q99460 953 aa21.13■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP21.13■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 EHMT1Q9H9B1 1298 aa21.13■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 FBXO28Q9NVF7 368 aa21.13■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 AIPL1Q9NZN9 384 aa21.13■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 ZBTB39O15060 712 aa21.13■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 CLIC2O15247 247 aa21.13■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 FAM13AO94988 1023 aa21.13■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 PRLRP16471 622 aa21.13■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 PRELPP51888 382 aa21.13■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 KCTD17Q8N5Z5 321 aa21.13■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 EPB41P11171 864 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 RPL13P26373 211 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 CXCR5P32302 372 aa21.12■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 CASP4P49662 377 aa21.12■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 SLC18A3Q16572 532 aa21.12■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 CEP55Q53EZ4 464 aa21.12■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 C1orf186Q6ZWK4 172 aa21.12■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 FAM160B2Q86V87 743 aa21.12■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 MYCT1Q8N699 235 aa21.12■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 OLFML3Q9NRN5 406 aa21.12■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 ZMYND10O75800 440 aa21.12■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 TCP1P17987 556 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 NMT1P30419 496 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 GRIPAP1Q4V328 841 aa21.12■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 TCERG1LQ5VWI1 586 aa21.12■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa21.12■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 A0A087X0T9 212 aa21.11■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 FAM228BP0C875 321 aa21.11■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 CAP2P40123 477 aa21.11■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 EXOC3L4Q17RC7 722 aa21.11■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa21.11■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 LDHDQ86WU2 507 aa21.11■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 ZNF577Q9BSK1 485 aa21.11■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 PLCB1Q9NQ66 1216 aa21.11■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa21.11■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 FEM1BQ9UK73 627 aa21.11■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 TBC1D12O60347 775 aa21.1■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 ARP10275 920 aa21.1■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 PON1P27169 355 aa21.1■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 MAP9Q49MG5 647 aa21.1■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 CAMKK2Q96RR4 588 aa21.1■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 TLR10Q9BXR5 811 aa21.1■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 IKZF4Q9H2S9 585 aa21.1■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 UNC45AQ9H3U1 944 aa21.1■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 TGFB1I1O43294 461 aa21.1■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 PLA2G6O60733 806 aa21.1■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 UCHL3P15374 230 aa21.1■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 CYP2C19P33261 490 aa21.1■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 GYS2P54840 703 aa21.1■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 SPAG5Q96R06 1193 aa21.1■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa21.1■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 EHD2Q9NZN4 543 aa21.1■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa21.1■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa21.1■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP21.09■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 EPHA7Q15375 998 aa21.09■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 CCDC181Q5TID7 509 aa21.09■□□□□ 0.97
USP21-201ENST00000289865 FKBP1CQ5VVH2 108 aa21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms