RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281171.8

PTPRO-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,301 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-201ENST00000281171 MARK3P27448 753 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRO-201ENST00000281171 PGM1P36871 562 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRO-201ENST00000281171 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
PTPRO-201ENST00000281171 BAG5Q9UL15 447 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRO-201ENST00000281171 CCPG1Q9ULG6 757 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRO-201ENST00000281171 CAPN1P07384 714 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRO-201ENST00000281171 ADARP55265 1226 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
PTPRO-201ENST00000281171 CNGA3Q16281 694 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRO-201ENST00000281171 TMEM259Q4ZIN3 620 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRO-201ENST00000281171 DTX3LQ8TDB6 740 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRO-201ENST00000281171 PPP1R14BQ96C90 147 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRO-201ENST00000281171 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
PTPRO-201ENST00000281171 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
PTPRO-201ENST00000281171 ERVV-1B6SEH8 477 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRO-201ENST00000281171 NOP56O00567 594 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
PTPRO-201ENST00000281171 TFAP4Q01664 338 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRO-201ENST00000281171 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
PTPRO-201ENST00000281171 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
PTPRO-201ENST00000281171 AGBL2Q5U5Z8 902 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRO-201ENST00000281171 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRO-201ENST00000281171 IL17REQ8NFR9 667 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRO-201ENST00000281171 SLC26A7Q8TE54 656 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRO-201ENST00000281171 TEKT2Q9UIF3 430 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRO-201ENST00000281171 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRO-201ENST00000281171 FTCDO95954 541 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRO-201ENST00000281171 MT-ND3P03897 115 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRO-201ENST00000281171 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
PTPRO-201ENST00000281171 TRIM15Q9C019 465 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRO-201ENST00000281171 SEPT10Q9P0V9 454 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRO-201ENST00000281171 STRIP2Q9ULQ0 834 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRO-201ENST00000281171 KIF1BO60333 1816 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRO-201ENST00000281171 PHF20L1A8MW92 1017 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRO-201ENST00000281171 LSM1O15116 133 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
PTPRO-201ENST00000281171 ABCB4P21439 1286 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRO-201ENST00000281171 KDM7AQ6ZMT4 941 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRO-201ENST00000281171 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
PTPRO-201ENST00000281171 ANAPC5Q9UJX4 755 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRO-201ENST00000281171 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
PTPRO-201ENST00000281171 POTEB3A0JP26 581 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRO-201ENST00000281171 GRID2IPA4D2P6 1211 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRO-201ENST00000281171 CCDC22O60826 627 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRO-201ENST00000281171 TXKP42681 527 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRO-201ENST00000281171 COPS2P61201 443 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRO-201ENST00000281171 STX3Q13277 289 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRO-201ENST00000281171 SLC39A14Q15043 492 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRO-201ENST00000281171 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRO-201ENST00000281171 POTEBQ6S5H4 581 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRO-201ENST00000281171 RSPH3Q86UC2 560 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRO-201ENST00000281171 SIX5Q8N196 739 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRO-201ENST00000281171 STAMQ92783 540 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRO-201ENST00000281171 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRO-201ENST00000281171 KDM4CQ9H3R0 1056 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRO-201ENST00000281171 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
PTPRO-201ENST00000281171 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
PTPRO-201ENST00000281171 CLIC4Q9Y696 253 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRO-201ENST00000281171 GPC4O75487 556 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRO-201ENST00000281171 PDE6AP16499 860 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRO-201ENST00000281171 PTPROQ16827 1216 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRO-201ENST00000281171 C10orf76Q5T2E6 689 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRO-201ENST00000281171 ING2Q9H160 280 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRO-201ENST00000281171 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
PTPRO-201ENST00000281171 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
PTPRO-201ENST00000281171 A0A087WWV3 80 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRO-201ENST00000281171 WBP4O75554 376 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
PTPRO-201ENST00000281171 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
PTPRO-201ENST00000281171 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
PTPRO-201ENST00000281171 CYTH1Q15438 398 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRO-201ENST00000281171 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
PTPRO-201ENST00000281171 MTRQ99707 1265 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRO-201ENST00000281171 FAM96AQ9H5X1 160 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRO-201ENST00000281171 SMYD3Q9H7B4 428 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRO-201ENST00000281171 PTPN22Q9Y2R2 807 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRO-201ENST00000281171 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
PTPRO-201ENST00000281171 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRO-201ENST00000281171 ATP4AP20648 1035 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRO-201ENST00000281171 SEC24CP53992 1094 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRO-201ENST00000281171 TAF12Q16514 161 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRO-201ENST00000281171 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
PTPRO-201ENST00000281171 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRO-201ENST00000281171 RSAD2Q8WXG1 361 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRO-201ENST00000281171 FAM81BQ96LP2 452 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRO-201ENST00000281171 SYBUQ9NX95 663 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRO-201ENST00000281171 TET3O43151 1660 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRO-201ENST00000281171 MYL1P05976 194 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRO-201ENST00000281171 ARFIP2P53365 341 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRO-201ENST00000281171 NOSTRINQ8IVI9 506 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRO-201ENST00000281171 IFNL3Q8IZI9 196 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRO-201ENST00000281171 KRT82Q9NSB4 513 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRO-201ENST00000281171 CDHR2Q9BYE9 1310 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRO-201ENST00000281171 A0A1B0GW55 424 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRO-201ENST00000281171 IFNB1P01574 187 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRO-201ENST00000281171 DUX4L2P0CJ85 424 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRO-201ENST00000281171 DUX4L3P0CJ86 424 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRO-201ENST00000281171 DUX4L4P0CJ87 422 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRO-201ENST00000281171 DUX4L5P0CJ88 424 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRO-201ENST00000281171 DUX4L6P0CJ89 424 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRO-201ENST00000281171 DUX4L7P0CJ90 424 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRO-201ENST00000281171 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
PTPRO-201ENST00000281171 RABGAP1LQ5R372 815 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRO-201ENST00000281171 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.9 ms