RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273261.7

LRIG1-201, Transcript of leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRIG1, Length 5,273 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1-201ENST00000273261 USP17L15C9J2P7 530 aa22■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 USP17L13C9JLJ4 530 aa22■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 USP17L11C9JVI0 530 aa22■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 USP17L18D6R9N7 530 aa22■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 USP17L22D6RA61 530 aa22■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 USP17L17D6RBQ6 530 aa22■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 USP17L19D6RCP7 530 aa22■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 USP17L20D6RJB6 530 aa22■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 F5H6K3 240 aa22■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 PRCPP42785 496 aa22■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 KLRC3Q07444 240 aa22■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 USP17L24Q0WX57 530 aa22■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 USP17L6PQ6QN14 398 aa22■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 FAM149B1Q96BN6 582 aa22■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 ATP8B3O60423 1300 aa21.99■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 ARL4AP40617 200 aa21.99■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 SNAP25P60880 206 aa21.99■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 QRICH1Q2TAL8 776 aa21.99■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 PADI6Q6TGC4 694 aa21.99■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 TXNRD1Q16881 649 aa21.99■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 ALS2CLQ60I27 953 aa21.99■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 TRIM42Q8IWZ5 723 aa21.99■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 ABI1Q8IZP0 508 aa21.99■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa21.99■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 ANAPC5Q9UJX4 755 aa21.99■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 GOLGA8SH3BPF8 625 aa21.99■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 IRX4P78413 519 aa21.99■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 C2orf54Q08AI8 447 aa21.99■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 KIF2CQ99661 725 aa21.99■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa21.99■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 CUL1Q13616 776 aa21.99■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 ADGRF4Q8IZF3 695 aa21.99■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa21.98■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 PIK3C2BO00750 1634 aa21.98■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 CCDC68Q9H2F9 335 aa21.98■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 P4HBP07237 508 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 PLTPP55058 493 aa21.98■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 SLC10A4Q96EP9 437 aa21.98■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 NCAPGQ9BPX3 1015 aa21.98■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 NAA25Q14CX7 972 aa21.98■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 VPS72Q15906 364 aa21.98■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 CAPN12Q6ZSI9 719 aa21.98■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 ZBTB33Q86T24 672 aa21.98■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 PIGOQ8TEQ8 1089 aa21.98■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 PARD6BQ9BYG5 372 aa21.98■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 NRXN1Q9ULB1 1477 aa21.98■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa21.98■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 DNAJC12Q9UKB3 198 aa21.98■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 KCNQ2O43526 872 aa21.97■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 RWDD2BP57060 319 aa21.97■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 ITKQ08881 620 aa21.97■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 KCNB1Q14721 858 aa21.97■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 ARMCX2Q7L311 632 aa21.97■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 CAMTA2O94983 1202 aa21.97■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 NAALADL2Q58DX5 795 aa21.97■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 SUN1O94901 812 aa21.97■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 ABL1P00519 1130 aa21.97■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 EMBQ6PCB8 327 aa21.97■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 E9PMD0 336 aa21.96■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 CPVLQ9H3G5 476 aa21.96■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 RFX1P22670 979 aa21.96■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 TNFAIP2Q03169 654 aa21.96■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 PPP2R5CQ13362 524 aa21.96■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 RPS6KA2Q15349 733 aa21.96■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 SHC4Q6S5L8 630 aa21.96■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 LRRC4Q9HBW1 653 aa21.96■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 SLC26A4O43511 780 aa21.96■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 PPARDQ03181 441 aa21.96■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 PDIA5Q14554 519 aa21.96■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 EEPD1Q7L9B9 569 aa21.96■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 A0A1W2PQC6 194 aa21.95■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 PRPSAP2O60256 369 aa21.95■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 CXCR5P32302 372 aa21.95■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 QARSP47897 775 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 RNF146Q9NTX7 359 aa21.95■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa21.95■■□□□ 1.11
LRIG1-201ENST00000273261 GOLGA8IPA6NC78 632 aa21.95■■□□□ 1.1
LRIG1-201ENST00000273261 TRIM49BA6NDI0 452 aa21.95■■□□□ 1.1
LRIG1-201ENST00000273261 GOLGA8JA6NMD2 632 aa21.95■■□□□ 1.1
LRIG1-201ENST00000273261 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
LRIG1-201ENST00000273261 DR1Q01658 176 aa21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms