RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272133.3

CNIH3-201, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNIH3, Length 2,558 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3-201ENST00000272133 HAUS2Q9NVX0 235 aa20.41■□□□□ 0.86
CNIH3-201ENST00000272133 PCDHA12Q9UN75 941 aa20.41■□□□□ 0.86
CNIH3-201ENST00000272133 PHF20L1A8MW92 1017 aa20.4■□□□□ 0.86
CNIH3-201ENST00000272133 PLA2G4BP0C869 781 aa20.4■□□□□ 0.86
CNIH3-201ENST00000272133 BTDP43251 543 aa20.4■□□□□ 0.86
CNIH3-201ENST00000272133 CASP5P51878 434 aa20.4■□□□□ 0.86
CNIH3-201ENST00000272133 GSTO1P78417 241 aa20.4■□□□□ 0.86
CNIH3-201ENST00000272133 KRT71Q3SY84 523 aa20.4■□□□□ 0.86
CNIH3-201ENST00000272133 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
CNIH3-201ENST00000272133 MYH7BA7E2Y1 1941 aa20.4■□□□□ 0.86
CNIH3-201ENST00000272133 EIF6P56537 245 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
CNIH3-201ENST00000272133 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
CNIH3-201ENST00000272133 MTMR3Q13615 1198 aa20.4■□□□□ 0.86
CNIH3-201ENST00000272133 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
CNIH3-201ENST00000272133 FAM182BQ5T319 152 aa20.4■□□□□ 0.86
CNIH3-201ENST00000272133 AGBL2Q5U5Z8 902 aa20.4■□□□□ 0.86
CNIH3-201ENST00000272133 CYB5D1Q6P9G0 228 aa20.4■□□□□ 0.86
CNIH3-201ENST00000272133 FUKQ8N0W3 1084 aa20.4■□□□□ 0.86
CNIH3-201ENST00000272133 C3orf20Q8ND61 904 aa20.4■□□□□ 0.86
CNIH3-201ENST00000272133 CETN3O15182 167 aa20.39■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 CLEC10AQ8IUN9 316 aa20.39■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa20.39■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 TRIM31Q9BZY9 425 aa20.39■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa20.39■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 CCDC188H7C350 402 aa20.39■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 hCG_1984214I3L0E3 225 aa20.39■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 PAEPP09466 180 aa20.39■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 CYP11B2P19099 503 aa20.39■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 MDM1Q8TC05 714 aa20.39■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 TATDN2Q93075 761 aa20.39■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 GPCPD1Q9NPB8 672 aa20.39■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 C5orf60A6NFR6 353 aa20.38■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 F8VZ95 297 aa20.38■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 PON1P27169 355 aa20.38■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 DAAM2Q86T65 1068 aa20.38■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 PARP9Q8IXQ6 854 aa20.38■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 TEX11Q8IYF3 940 aa20.38■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 NT5C3AQ9H0P0 336 aa20.38■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 EXOC3L4Q17RC7 722 aa20.38■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 CHADLQ6NUI6 762 aa20.38■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 FAM228AQ86W67 206 aa20.38■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 RASGEF1CQ8N431 466 aa20.38■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 TRIM51Q9BSJ1 452 aa20.38■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa20.37■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 FLOT1O75955 427 aa20.37■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 KRT18P05783 430 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 SCTRP47872 440 aa20.37■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 SNCBQ16143 134 aa20.37■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 PSMD1Q99460 953 aa20.37■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa20.37■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa20.37■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa20.37■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 NR2E1Q9Y466 385 aa20.37■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa20.37■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 FAM170AA1A519 330 aa20.37■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 EDRF1Q3B7T1 1238 aa20.37■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 HYIQ5T013 277 aa20.37■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 CPLX4Q7Z7G2 160 aa20.37■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 SLFN11Q7Z7L1 901 aa20.37■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 AFPP02771 609 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 TM4SF1P30408 202 aa20.36■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 ARSHQ5FYA8 562 aa20.36■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 GJB7Q6PEY0 223 aa20.36■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 NT5DC3Q86UY8 548 aa20.36■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 CEP57Q86XR8 500 aa20.36■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 CCDC26Q8TAB7 109 aa20.36■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 SEC14L1Q92503 715 aa20.36■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 SGSM3Q96HU1 749 aa20.36■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 MCM8Q9UJA3 840 aa20.36■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 ZNF831Q5JPB2 1677 aa20.36■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 OPLAHO14841 1288 aa20.36■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 CLK2P49760 499 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 IFFO1Q0D2I5 559 aa20.36■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 NEDD9Q14511 834 aa20.36■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 GIMAP7Q8NHV1 300 aa20.36■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 NENFQ9UMX5 172 aa20.36■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 SBF2Q86WG5 1849 aa20.35■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 FGGP02679 453 aa20.35■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 LDHCP07864 332 aa20.35■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 H2AFZP0C0S5 128 aa20.35■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 DRD4P21917 467 aa20.35■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 STAT3P40763 770 aa20.35■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa20.35■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 H2AFVQ71UI9 128 aa20.35■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 SCLT1Q96NL6 688 aa20.35■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 SETDB2Q96T68 719 aa20.35■□□□□ 0.85
CNIH3-201ENST00000272133 JMJD4Q9H9V9 463 aa20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms