RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263202.14

UFD1-201, Transcript of ubiquitin recognition factor in ER associated degradation 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UFD1, Length 1,814 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFD1-201ENST00000263202 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 GPR20Q99678 358 aa25.26■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 RUSC1Q9BVN2 902 aa25.26■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 BACH1O14867 736 aa25.25■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 MRE11P49959 708 aa25.25■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 ARHGAP1Q07960 439 aa25.25■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 IRF5Q13568 498 aa25.25■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 KIF22Q14807 665 aa25.25■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 BPIFA3Q9BQP9 254 aa25.25■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 ZNF302Q9NR11 478 aa25.25■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 EXOC1Q9NV70 894 aa25.25■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 STBD1O95210 358 aa25.24■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 PTGS1P23219 599 aa25.24■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 CYP2C19P33261 490 aa25.24■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 RARRES1P49788 294 aa25.24■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 GIT2Q14161 759 aa25.24■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 IQCB1Q15051 598 aa25.24■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa25.24■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 IQSEC1Q6DN90 963 aa25.24■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 C1orf186Q6ZWK4 172 aa25.24■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 SPATA33Q96N06 139 aa25.24■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 PCYT2Q99447 389 aa25.24■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 ANKEF1Q9NU02 776 aa25.24■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 ARHGEF35A5YM69 484 aa25.23■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 GH1P01241 217 aa25.23■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 KRT18P05783 430 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 IDEP14735 1019 aa25.23■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa25.23■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 CCDC144BQ3MJ40 725 aa25.23■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 LUZP1Q86V48 1076 aa25.23■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 DACH1Q9UI36 760 aa25.23■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 NOP56O00567 594 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 SMPD1P17405 629 aa25.23■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 FLT3LGP49771 235 aa25.23■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 EHHADHQ08426 723 aa25.23■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 LAMC2Q13753 1193 aa25.23■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 DUSP28Q4G0W2 176 aa25.23■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 ANO5Q75V66 913 aa25.23■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 REEP2Q9BRK0 252 aa25.23■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 PANK4Q9NVE7 773 aa25.23■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 KCND2Q9NZV8 630 aa25.23■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 GDAQ9Y2T3 454 aa25.23■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 MYH11P35749 1972 aa25.23■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 FRMD3A2A2Y4 597 aa25.22■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 TMEM150BA6NC51 233 aa25.22■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 CD44P16070 742 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 PRKCEQ02156 737 aa25.22■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 PRKCZQ05513 592 aa25.22■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 AFAP1L1Q8TED9 768 aa25.22■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa25.21■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 GPR25O00155 361 aa25.21■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 ATP4AP20648 1035 aa25.21■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 COASYQ13057 564 aa25.21■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 CCDC65Q8IXS2 484 aa25.21■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP25.21■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 LGR5O75473 907 aa25.21■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 FAM160B1Q5W0V3 765 aa25.21■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 PLA2G4FQ68DD2 849 aa25.21■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 PADI6Q6TGC4 694 aa25.21■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 OTUD6AQ7L8S5 288 aa25.21■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 CD99L2Q8TCZ2 262 aa25.21■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 HPS3Q969F9 1004 aa25.21■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 SAGE1Q9NXZ1 904 aa25.21■■□□□ 1.63
UFD1-201ENST00000263202 ADCY6O43306 1168 aa25.2■■□□□ 1.62
UFD1-201ENST00000263202 STAT5BP51692 787 aa25.2■■□□□ 1.62
UFD1-201ENST00000263202 STK4Q13043 487 aa25.2■■□□□ 1.62
UFD1-201ENST00000263202 XKR9Q5GH70 373 aa25.2■■□□□ 1.62
UFD1-201ENST00000263202 XKR3Q5GH77 459 aa25.2■■□□□ 1.62
UFD1-201ENST00000263202 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
UFD1-201ENST00000263202 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
UFD1-201ENST00000263202 AOPEPQ8N6M6 819 aa25.2■■□□□ 1.62
UFD1-201ENST00000263202 SH2D3AQ9BRG2 576 aa25.2■■□□□ 1.62
UFD1-201ENST00000263202 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
UFD1-201ENST00000263202 GUCY2CP25092 1073 aa25.19■■□□□ 1.62
UFD1-201ENST00000263202 PRCPP42785 496 aa25.19■■□□□ 1.62
UFD1-201ENST00000263202 NPEPPSP55786 919 aa25.19■■□□□ 1.62
UFD1-201ENST00000263202 TNFAIP2Q03169 654 aa25.19■■□□□ 1.62
UFD1-201ENST00000263202 PSMD2Q13200 908 aa25.19■■□□□ 1.62
UFD1-201ENST00000263202 UVSSAQ2YD98 709 aa25.19■■□□□ 1.62
UFD1-201ENST00000263202 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
UFD1-201ENST00000263202 EMSYQ7Z589 1322 aa25.19■■□□□ 1.62
UFD1-201ENST00000263202 RSPH10B2B2RC85 870 aa25.19■■□□□ 1.62
UFD1-201ENST00000263202 OATP04181 439 aa25.19■■□□□ 1.62
UFD1-201ENST00000263202 RSPH10BP0C881 870 aa25.19■■□□□ 1.62
UFD1-201ENST00000263202 KIAA0895Q8NCT3 520 aa25.19■■□□□ 1.62
UFD1-201ENST00000263202 PPTC7Q8NI37 304 aa25.19■■□□□ 1.62
UFD1-201ENST00000263202 TRIB2Q92519 343 aa25.19■■□□□ 1.62
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