RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 EFHBQ8N7U6 833 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 NLRP7Q8WX94 980 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 ST7Q9NRC1 585 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa9.73□□□□□ -0.85
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PTPRB-201ENST00000261266 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa9.73□□□□□ -0.85
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PTPRB-201ENST00000261266 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
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PTPRB-201ENST00000261266 GPR162Q16538 588 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 FOXP3Q9BZS1 431 aa9.73□□□□□ -0.85
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PTPRB-201ENST00000261266 ASB14A6NK59 587 aa9.72□□□□□ -0.85
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PTPRB-201ENST00000261266 ECE1P42892 770 aa9.72□□□□□ -0.85
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PTPRB-201ENST00000261266 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa9.72□□□□□ -0.85
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PTPRB-201ENST00000261266 KIF2CQ99661 725 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 GPC5P78333 572 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 MESDQ14696 234 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 TMEM35BQ8NCS4 154 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 MAGEB5Q9BZ81 275 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa9.71□□□□□ -0.85
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PTPRB-201ENST00000261266 USP17L8P0C7I0 530 aa9.71□□□□□ -0.85
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PTPRB-201ENST00000261266 ARL4CP56559 192 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRB-201ENST00000261266 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.85
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