RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000240159.8

RNF170-201, Transcript of ring finger protein 170, humanhuman

TSL 2

Gene RNF170, Length 2,023 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF170-201ENST00000240159 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa25.1■■□□□ 1.61
RNF170-201ENST00000240159 LGALS16A8MUM7 142 aa25.09■■□□□ 1.61
RNF170-201ENST00000240159 ERVK-9P63128 1117 aa25.09■■□□□ 1.61
RNF170-201ENST00000240159 ERVK-24P63145 666 aa25.09■■□□□ 1.61
RNF170-201ENST00000240159 GOLGA8FQ08AF8 430 aa25.09■■□□□ 1.61
RNF170-201ENST00000240159 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa25.09■■□□□ 1.61
RNF170-201ENST00000240159 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
RNF170-201ENST00000240159 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
RNF170-201ENST00000240159 NMRK2Q9NPI5 230 aa25.09■■□□□ 1.61
RNF170-201ENST00000240159 SPTLC3Q9NUV7 552 aa25.09■■□□□ 1.61
RNF170-201ENST00000240159 ITIH6Q6UXX5 1313 aa25.09■■□□□ 1.61
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RNF170-201ENST00000240159 MYBP10242 640 aa25.08■■□□□ 1.61
RNF170-201ENST00000240159 YWHABP31946 246 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
RNF170-201ENST00000240159 RARRES1P49788 294 aa25.08■■□□□ 1.61
RNF170-201ENST00000240159 ZNF131P52739 623 aa25.08■■□□□ 1.61
RNF170-201ENST00000240159 CCL15Q16663 113 aa25.08■■□□□ 1.61
RNF170-201ENST00000240159 PADI6Q6TGC4 694 aa25.08■■□□□ 1.61
RNF170-201ENST00000240159 MROH8Q9H579 483 aa25.08■■□□□ 1.61
RNF170-201ENST00000240159 PARVGQ9HBI0 331 aa25.08■■□□□ 1.61
RNF170-201ENST00000240159 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa25.08■■□□□ 1.61
RNF170-201ENST00000240159 PDHXO00330 501 aa25.08■■□□□ 1.61
RNF170-201ENST00000240159 SP2Q02086 613 aa25.08■■□□□ 1.61
RNF170-201ENST00000240159 UBXN1Q04323 297 aa25.08■■□□□ 1.61
RNF170-201ENST00000240159 MYCT1Q8N699 235 aa25.08■■□□□ 1.61
RNF170-201ENST00000240159 ZNF507Q8TCN5 953 aa25.08■■□□□ 1.61
RNF170-201ENST00000240159 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
RNF170-201ENST00000240159 SLC9A2Q9UBY0 812 aa25.08■■□□□ 1.61
RNF170-201ENST00000240159 BTBD19C9JJ37 291 aa25.07■■□□□ 1.6
RNF170-201ENST00000240159 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
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RNF170-201ENST00000240159 TELO2Q9Y4R8 837 aa25.07■■□□□ 1.6
RNF170-201ENST00000240159 PGK2P07205 417 aa25.07■■□□□ 1.6
RNF170-201ENST00000240159 HOXD13P35453 343 aa25.07■■□□□ 1.6
RNF170-201ENST00000240159 KCTD2Q14681 263 aa25.07■■□□□ 1.6
RNF170-201ENST00000240159 BMT2Q1RMZ1 405 aa25.07■■□□□ 1.6
RNF170-201ENST00000240159 SEPT14Q6ZU15 432 aa25.07■■□□□ 1.6
RNF170-201ENST00000240159 TC2NQ8N9U0 490 aa25.07■■□□□ 1.6
RNF170-201ENST00000240159 SEL1LQ9UBV2 794 aa25.07■■□□□ 1.6
RNF170-201ENST00000240159 DOCK5Q9H7D0 1870 aa25.06■■□□□ 1.6
RNF170-201ENST00000240159 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP25.06■■□□□ 1.6
RNF170-201ENST00000240159 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
RNF170-201ENST00000240159 CEP135Q66GS9 1140 aa25.06■■□□□ 1.6
RNF170-201ENST00000240159 SHCBP1Q8NEM2 672 aa25.06■■□□□ 1.6
RNF170-201ENST00000240159 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
RNF170-201ENST00000240159 FGD4Q96M96 766 aa25.06■■□□□ 1.6
RNF170-201ENST00000240159 TMX1Q9H3N1 280 aa25.06■■□□□ 1.6
RNF170-201ENST00000240159 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa25.05■■□□□ 1.6
RNF170-201ENST00000240159 B4DLN1 442 aa25.05■■□□□ 1.6
RNF170-201ENST00000240159 HIP1RO75146 1068 aa25.05■■□□□ 1.6
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RNF170-201ENST00000240159 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa25.05■■□□□ 1.6
RNF170-201ENST00000240159 CCDC112Q8NEF3 446 aa25.05■■□□□ 1.6
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RNF170-201ENST00000240159 DNM2P50570 870 aa25.05■■□□□ 1.6
RNF170-201ENST00000240159 SP4Q02446 784 aa25.05■■□□□ 1.6
RNF170-201ENST00000240159 ANKRD23Q86SG2 305 aa25.05■■□□□ 1.6
RNF170-201ENST00000240159 PPFIBP1Q86W92 1011 aa25.05■■□□□ 1.6
RNF170-201ENST00000240159 DAW1Q8N136 415 aa25.05■■□□□ 1.6
RNF170-201ENST00000240159 CEP63Q96MT8 703 aa25.05■■□□□ 1.6
RNF170-201ENST00000240159 FIZ1Q96SL8 496 aa25.05■■□□□ 1.6
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RNF170-201ENST00000240159 ANKEF1Q9NU02 776 aa25.05■■□□□ 1.6
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RNF170-201ENST00000240159 NRDCO43847 1150 aa25.04■■□□□ 1.6
RNF170-201ENST00000240159 SORBS3O60504 671 aa25.04■■□□□ 1.6
RNF170-201ENST00000240159 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
RNF170-201ENST00000240159 NMT1P30419 496 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
RNF170-201ENST00000240159 EDRF1Q3B7T1 1238 aa25.04■■□□□ 1.6
RNF170-201ENST00000240159 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
RNF170-201ENST00000240159 WDR78Q5VTH9 848 aa25.04■■□□□ 1.6
RNF170-201ENST00000240159 CST9Q5W186 159 aa25.04■■□□□ 1.6
RNF170-201ENST00000240159 ABHD15Q6UXT9 468 aa25.04■■□□□ 1.6
RNF170-201ENST00000240159 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
RNF170-201ENST00000240159 PORCNQ9H237 461 aa25.04■■□□□ 1.6
RNF170-201ENST00000240159 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa25.04■■□□□ 1.6
RNF170-201ENST00000240159 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP25.04■■□□□ 1.6
RNF170-201ENST00000240159 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
RNF170-201ENST00000240159 BACH1O14867 736 aa25.03■■□□□ 1.6
RNF170-201ENST00000240159 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP25.03■■□□□ 1.6
RNF170-201ENST00000240159 CYFIP1Q7L576 1253 aa25.03■■□□□ 1.6
RNF170-201ENST00000240159 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa25.03■■□□□ 1.6
RNF170-201ENST00000240159 ATP6V0A1Q93050 837 aa25.03■■□□□ 1.6
RNF170-201ENST00000240159 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
RNF170-201ENST00000240159 SH2D3AQ9BRG2 576 aa25.03■■□□□ 1.6
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