RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637887.1

ARID1B-231, Transcript of AT-rich interaction domain 1B, human

TSL 5

Gene ARID1B, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARID1B-231	ENST00000637887	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	NUDT11	Q96G61	164 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	DLL4	Q9NR61	685 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	SAMD9	Q5K651	1589 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	FAM47E-STBD1	D6RA91	191 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887		E9PSI1	815 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	NFATC3	Q12968	1075 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	PTPN18	Q99952	460 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	CD244	Q9BZW8	370 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	PDPK1	O15530	556 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	ADCY3	O60266	1144 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	B4GALT4	O60513	344 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	ZNF20	P17024	532 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	SURF1	Q15526	300 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	CPZ	Q66K79	652 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	CHST13	Q8NET6	341 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	7.34	□□□□□ -1.23	2e-8	■■■■■ 27
ARID1B-231	ENST00000637887	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ARID1B-231	ENST00000637887	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	ACOT7	O00154	380 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	KLHL18	O94889	574 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	PFKP	Q01813	784 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	CD276	Q5ZPR3	534 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	KCTD1	Q719H9	257 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	ALG1	Q9BT22	464 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	IFT140	Q96RY7	1462 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	GRIN2B	Q13224	1484 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	EPHA5	P54756	1037 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	PPP2CB	P62714	309 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	PPP2CA	P67775	309 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	MTERF2	Q49AM1	385 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	FAM209A	Q5JX71	171 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	STPG3	Q8N7X2	389 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	CDC6	Q99741	560 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	JADE2	Q9NQC1	790 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	WDR62	O43379	1518 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	GPR42	O15529	346 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	FBXO21	O94952	628 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	KNG1	P01042	644 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	ENO2	P09104	434 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	EPHB4	P54760	987 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	RASGRF1	Q13972	1273 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	ICAM4	Q14773	271 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	DPH6	Q7L8W6	267 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	ADAM29	Q9UKF5	820 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	ADAMTS12	P58397	1594 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	ZNF839	A8K0R7	811 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	KCND1	Q9NSA2	647 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	IQGAP2	Q13576	1575 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	HECW1	Q76N89	1606 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	IL18BP	O95998	194 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	PAK1	Q13153	545 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887		Q6ZUG5	572 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	PTPRN2	Q92932	1015 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ARID1B-231	ENST00000637887	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		7.3	□□□□□ -1.24

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