RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	DMTF1	Q9Y222	760 aa		6.05	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	PTPRT	O14522	1441 aa		6.04	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	NPAT	Q14207	1427 aa		6.04	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	TET3	O43151	1660 aa		6.04	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	PZP	P20742	1482 aa		6.04	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		6.04	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	CBFA2T2	O43439	604 aa		6.04	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	LRRN2	O75325	713 aa		6.04	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	TP53	P04637	393 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	FLT3	P36888	993 aa		6.04	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	RNF4	P78317	190 aa		6.04	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	BBS9	Q3SYG4	887 aa		6.04	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	UBE2R2	Q712K3	238 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	SRL	Q86TD4	932 aa		6.04	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	NXPE1	Q8N323	547 aa		6.04	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		6.04	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616		Q96M66	194 aa		6.04	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		6.04	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	KLHL25	Q9H0H3	589 aa		6.04	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		6.04	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		6.04	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		6.04	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		6.04	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616		C9IYK1	514 aa		6.03	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	DLX3	O60479	287 aa		6.03	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	RNASEH2A	O75792	299 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	CEACAM5	P06731	702 aa		6.03	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	ITIH2	P19823	946 aa		6.03	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	GRIK1	P39086	918 aa		6.03	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	CASP2	P42575	452 aa		6.03	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	RENBP	P51606	427 aa		6.03	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	USP14	P54578	494 aa		6.03	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	NTRK3	Q16288	839 aa		6.03	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		6.03	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	ZCCHC8	Q6NZY4	707 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		6.03	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		6.03	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	PLD6	Q8N2A8	252 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	MFSD4A	Q8N468	514 aa		6.03	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	NETO1	Q8TDF5	533 aa		6.03	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	FGD4	Q96M96	766 aa		6.03	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	FNIP2	Q9P278	1114 aa		6.03	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		6.03	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	NOS1	P29475	1434 aa		6.03	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	DYTN	A2CJ06	578 aa		6.03	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	FKBP9	O95302	570 aa		6.03	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	SETSIP	P0DME0	302 aa		6.03	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	6.03	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	GTF2A2	P52657	109 aa		6.03	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	DSG1	Q02413	1049 aa		6.03	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	TNK2	Q07912	1038 aa		6.03	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	ADCY1	Q08828	1119 aa		6.03	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	6.03	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	MSMP	Q1L6U9	139 aa		6.03	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	ABHD17C	Q6PCB6	329 aa		6.03	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		6.03	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		6.03	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		6.03	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		6.03	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	NKAP	Q8N5F7	415 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		6.03	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	6.03	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	PTPRN2	Q92932	1015 aa		6.03	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	HSPBAP1	Q96EW2	488 aa		6.03	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	WNK4	Q96J92	1243 aa		6.03	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	MAGEB10	Q96LZ2	347 aa	Predicted RBP	6.03	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		6.03	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		6.03	□□□□□ -1.44
EFHC1-223	ENST00000636616	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		6.02	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616		A6NNZ2	444 aa		6.02	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	PRSS47	A8MTI9	375 aa		6.02	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	6.02	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	MED26	O95402	600 aa		6.02	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC5A1	P13866	664 aa		6.02	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	KCNA6	P17658	529 aa		6.02	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	IL2	P60568	153 aa		6.02	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	6.02	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	6.02	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	CCDC184	Q52MB2	194 aa		6.02	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	6.02	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	SPACA3	Q8IXA5	215 aa		6.02	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		6.02	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	6.02	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	PIWIL2	Q8TC59	973 aa	Known RBP	6.02	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	6.02	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		6.02	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	MPP4	Q96JB8	637 aa		6.02	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	TNIP3	Q96KP6	325 aa		6.02	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		6.02	□□□□□ -1.45

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