RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 CPT1AP50416 773 aa9.57□□□□□ -0.88
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SGMS1-211ENST00000626236 SPECC1Q5M775 1068 aa9.57□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 B3GNT9Q6UX72 402 aa9.57□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 CLEC17AQ6ZS10 378 aa9.57□□□□□ -0.88
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SGMS1-211ENST00000626236 ERMNQ8TAM6 284 aa9.57□□□□□ -0.88
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SGMS1-211ENST00000626236 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa9.54□□□□□ -0.88
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SGMS1-211ENST00000626236 POTEB3A0JP26 581 aa9.54□□□□□ -0.88
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SGMS1-211ENST00000626236 PPFIA4O75335 1185 aa9.54□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 LGR5O75473 907 aa9.54□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 LGALS2P05162 132 aa9.54□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 P4HBP07237 508 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 CMA1P23946 247 aa9.54□□□□□ -0.88
SGMS1-211ENST00000626236 RPA1P27694 616 aa9.54□□□□□ -0.88
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