RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 LINC00271P0C7V0 271 aa28.54■■■□□ 2.16
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PTPRF-216ENST00000617451 GJD3Q8N144 294 aa28.54■■■□□ 2.16
PTPRF-216ENST00000617451 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
PTPRF-216ENST00000617451 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
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PTPRF-216ENST00000617451 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa28.51■■■□□ 2.15
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PTPRF-216ENST00000617451 FUT2Q10981 343 aa28.49■■■□□ 2.15
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PTPRF-216ENST00000617451 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa28.48■■■□□ 2.15
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PTPRF-216ENST00000617451 V9GY48 417 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
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PTPRF-216ENST00000617451 ATG7O95352 703 aa28.45■■■□□ 2.14
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PTPRF-216ENST00000617451 PLVAPQ9BX97 442 aa28.45■■■□□ 2.14
PTPRF-216ENST00000617451 ANO3Q9BYT9 981 aa28.45■■■□□ 2.14
PTPRF-216ENST00000617451 PADI3Q9ULW8 664 aa28.45■■■□□ 2.14
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