RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616768.4

MLH1-223, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2

Gene MLH1, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-223	ENST00000616768	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		6.62	□□□□□ -1.35
MLH1-223	ENST00000616768	SCN9A	Q15858	1988 aa		6.62	□□□□□ -1.35
MLH1-223	ENST00000616768	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		6.61	□□□□□ -1.35
MLH1-223	ENST00000616768	HPX	P02790	462 aa		6.61	□□□□□ -1.35
MLH1-223	ENST00000616768	C8A	P07357	584 aa		6.61	□□□□□ -1.35
MLH1-223	ENST00000616768	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
MLH1-223	ENST00000616768	RAG1	P15918	1043 aa		6.61	□□□□□ -1.35
MLH1-223	ENST00000616768	CTGF	P29279	349 aa		6.61	□□□□□ -1.35
MLH1-223	ENST00000616768	UBXN2A	P68543	259 aa		6.61	□□□□□ -1.35
MLH1-223	ENST00000616768	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
MLH1-223	ENST00000616768	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
MLH1-223	ENST00000616768	KIF22	Q14807	665 aa		6.61	□□□□□ -1.35
MLH1-223	ENST00000616768	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		6.61	□□□□□ -1.35
MLH1-223	ENST00000616768	CREG2	Q8IUH2	290 aa		6.61	□□□□□ -1.35
MLH1-223	ENST00000616768	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		6.61	□□□□□ -1.35
MLH1-223	ENST00000616768	ATG4C	Q96DT6	458 aa		6.61	□□□□□ -1.35
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
MLH1-223	ENST00000616768	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		6.61	□□□□□ -1.35
MLH1-223	ENST00000616768	UBP1	Q9NZI7	540 aa		6.61	□□□□□ -1.35
MLH1-223	ENST00000616768	DUSP13	Q9UII6	198 aa		6.61	□□□□□ -1.35
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		6.61	□□□□□ -1.35
MLH1-223	ENST00000616768	USP34	Q70CQ2	3546 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MLH1-223	ENST00000616768	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
MLH1-223	ENST00000616768	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
MLH1-223	ENST00000616768	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
MLH1-223	ENST00000616768	IQCJ-SCHIP1	C9J366	451 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
MLH1-223	ENST00000616768	TNFRSF10C	O14798	259 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MLH1-223	ENST00000616768	ECE2	O60344	883 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MLH1-223	ENST00000616768	LRRN2	O75325	713 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MLH1-223	ENST00000616768	IMPDH2	P12268	514 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MLH1-223	ENST00000616768	MESP2	Q0VG99	397 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MLH1-223	ENST00000616768	KCTD2	Q14681	263 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MLH1-223	ENST00000616768	NR0B2	Q15466	257 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MLH1-223	ENST00000616768	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MLH1-223	ENST00000616768	SEZ6	Q53EL9	994 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MLH1-223	ENST00000616768	ARSH	Q5FYA8	562 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MLH1-223	ENST00000616768	FYB2	Q5VWT5	728 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MLH1-223	ENST00000616768	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MLH1-223	ENST00000616768	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
MLH1-223	ENST00000616768	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
MLH1-223	ENST00000616768	SPON2	Q9BUD6	331 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MLH1-223	ENST00000616768	SLAMF8	Q9P0V8	285 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MLH1-223	ENST00000616768	SRRD	Q9UH36	339 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MLH1-223	ENST00000616768	ABCC4	O15439	1325 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MLH1-223	ENST00000616768	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MLH1-223	ENST00000616768	MYPN	Q86TC9	1320 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MLH1-223	ENST00000616768	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MLH1-223	ENST00000616768	SMIM22	K7EJ46	135 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MLH1-223	ENST00000616768	RAC2	P15153	192 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MLH1-223	ENST00000616768	CLC	Q05315	142 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MLH1-223	ENST00000616768	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MLH1-223	ENST00000616768	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MLH1-223	ENST00000616768	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
MLH1-223	ENST00000616768	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MLH1-223	ENST00000616768	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MLH1-223	ENST00000616768	TTC6	Q86TZ1	520 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MLH1-223	ENST00000616768	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MLH1-223	ENST00000616768	TAB3	Q8N5C8	712 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
MLH1-223	ENST00000616768	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MLH1-223	ENST00000616768	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MLH1-223	ENST00000616768	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
MLH1-223	ENST00000616768	NKD1	Q969G9	470 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MLH1-223	ENST00000616768	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MLH1-223	ENST00000616768	FAM120A	Q9NZB2	1118 aa	Known RBP eCLIP	6.59	□□□□□ -1.35
MLH1-223	ENST00000616768	C5orf42	Q9H799	3197 aa		6.59	□□□□□ -1.36
MLH1-223	ENST00000616768	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MLH1-223	ENST00000616768	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MLH1-223	ENST00000616768	WASH4P	A8MWX3	477 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MLH1-223	ENST00000616768	SCAMP3	O14828	347 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
MLH1-223	ENST00000616768	NME1	P15531	152 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
MLH1-223	ENST00000616768	PRMT2	P55345	433 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MLH1-223	ENST00000616768	EGR3	Q06889	387 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MLH1-223	ENST00000616768	HLF	Q16534	295 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MLH1-223	ENST00000616768	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MLH1-223	ENST00000616768	LILRA2	Q8N149	483 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MLH1-223	ENST00000616768	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF655	Q8N720	491 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
MLH1-223	ENST00000616768	RNF34	Q969K3	372 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MLH1-223	ENST00000616768	FAM84A	Q96KN4	292 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MLH1-223	ENST00000616768	UIMC1	Q96RL1	719 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MLH1-223	ENST00000616768	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MLH1-223	ENST00000616768	SP110	Q9HB58	689 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MLH1-223	ENST00000616768	PRR13	Q9NZ81	148 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MLH1-223	ENST00000616768	LAMB2	P55268	1798 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MLH1-223	ENST00000616768	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MLH1-223	ENST00000616768	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
MLH1-223	ENST00000616768	ZGLP1	P0C6A0	271 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MLH1-223	ENST00000616768	PSMC4	P43686	418 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MLH1-223	ENST00000616768	CHMP4BP1	P59074	171 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
MLH1-223	ENST00000616768	PRKCZ	Q05513	592 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MLH1-223	ENST00000616768	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
MLH1-223	ENST00000616768	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
MLH1-223	ENST00000616768	RNF111	Q6ZNA4	994 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MLH1-223	ENST00000616768	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
MLH1-223	ENST00000616768	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
MLH1-223	ENST00000616768	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MLH1-223	ENST00000616768	SPATA32	Q96LK8	384 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MLH1-223	ENST00000616768	HDAC8	Q9BY41	377 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MLH1-223	ENST00000616768	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36

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