RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588555.1

SCAMP4-210, Transcript of secretory carrier membrane protein 4, humanhuman

Gene SCAMP4, Length 1,785 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4-210ENST00000588555 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa29.03■■■□□ 2.24
SCAMP4-210ENST00000588555 WDR81Q562E7 1941 aa29.03■■■□□ 2.24
SCAMP4-210ENST00000588555 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa29.02■■■□□ 2.24
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SCAMP4-210ENST00000588555 EHHADHQ08426 723 aa29.02■■■□□ 2.24
SCAMP4-210ENST00000588555 UGCGQ16739 394 aa29.02■■■□□ 2.24
SCAMP4-210ENST00000588555 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
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SCAMP4-210ENST00000588555 ABHD15Q6UXT9 468 aa29■■■□□ 2.23
SCAMP4-210ENST00000588555 DPP9Q86TI2 863 aa29■■■□□ 2.23
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SCAMP4-210ENST00000588555 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa28.99■■■□□ 2.23
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SCAMP4-210ENST00000588555 CCDC62Q6P9F0 684 aa28.99■■■□□ 2.23
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SCAMP4-210ENST00000588555 DOCK3Q8IZD9 2030 aa28.99■■■□□ 2.23
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SCAMP4-210ENST00000588555 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa28.95■■■□□ 2.22
SCAMP4-210ENST00000588555 KRT18P05783 430 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
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SCAMP4-210ENST00000588555 RARRES1P49788 294 aa28.94■■■□□ 2.22
SCAMP4-210ENST00000588555 PSMD2Q13200 908 aa28.94■■■□□ 2.22
SCAMP4-210ENST00000588555 CCDC65Q8IXS2 484 aa28.94■■■□□ 2.22
SCAMP4-210ENST00000588555 ATP6V0A1Q93050 837 aa28.94■■■□□ 2.22
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