RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587167.1

SPHK1-204, Transcript of sphingosine kinase 1, humanhuman

TSL 4

Gene SPHK1, Length 456 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1-204ENST00000587167 PSMD10O75832 226 aa22.08■■□□□ 1.13
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SPHK1-204ENST00000587167 CSF2RAP15509 400 aa22.08■■□□□ 1.13
SPHK1-204ENST00000587167 ACTR2P61160 394 aa22.08■■□□□ 1.13
SPHK1-204ENST00000587167 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
SPHK1-204ENST00000587167 ITGA7Q13683 1181 aa22.08■■□□□ 1.13
SPHK1-204ENST00000587167 CALCRLQ16602 461 aa22.08■■□□□ 1.13
SPHK1-204ENST00000587167 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
SPHK1-204ENST00000587167 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
SPHK1-204ENST00000587167 HAS1Q92839 578 aa22.08■■□□□ 1.13
SPHK1-204ENST00000587167 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
SPHK1-204ENST00000587167 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa22.08■■□□□ 1.13
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SPHK1-204ENST00000587167 ZNF286BP0CG31 522 aa22.07■■□□□ 1.12
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SPHK1-204ENST00000587167 TMEM60Q9H2L4 133 aa22.07■■□□□ 1.12
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SPHK1-204ENST00000587167 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SPHK1-204ENST00000587167 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
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SPHK1-204ENST00000587167 MTMR9Q96QG7 549 aa22.05■■□□□ 1.12
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SPHK1-204ENST00000587167 CHMP4BP1P59074 171 aa22.04■■□□□ 1.12
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SPHK1-204ENST00000587167 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa22.03■■□□□ 1.12
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SPHK1-204ENST00000587167 TRPV6Q9H1D0 765 aa22.03■■□□□ 1.12
SPHK1-204ENST00000587167 HIPK3Q9H422 1215 aa22.03■■□□□ 1.12
SPHK1-204ENST00000587167 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
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SPHK1-204ENST00000587167 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa22.03■■□□□ 1.12
SPHK1-204ENST00000587167 EMSYQ7Z589 1322 aa22.03■■□□□ 1.12
SPHK1-204ENST00000587167 UNC80Q8N2C7 3258 aa22.02■■□□□ 1.12
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SPHK1-204ENST00000587167 SFNP31947 248 aa22.02■■□□□ 1.12
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SPHK1-204ENST00000587167 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
SPHK1-204ENST00000587167 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa22.02■■□□□ 1.12
SPHK1-204ENST00000587167 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
SPHK1-204ENST00000587167 AZI2Q9H6S1 392 aa22.02■■□□□ 1.12
SPHK1-204ENST00000587167 GBF1Q92538 1859 aa22.02■■□□□ 1.12
SPHK1-204ENST00000587167 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa22.01■■□□□ 1.11
SPHK1-204ENST00000587167 BACH1O14867 736 aa22.01■■□□□ 1.11
SPHK1-204ENST00000587167 BRD1O95696 1058 aa22.01■■□□□ 1.11
SPHK1-204ENST00000587167 FOSL2P15408 326 aa22.01■■□□□ 1.11
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