RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579743.2

GGA3-208, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-208ENST00000579743 BMP1P13497 986 aa15.62■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 SCG2P13521 617 aa15.62■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 INSRRP14616 1297 aa15.62■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 SREBF1P36956 1147 aa15.62■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 ACTR2P61160 394 aa15.62■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 TFF2Q03403 129 aa15.62■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 ADCK5Q3MIX3 580 aa15.62■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 KRT40Q6A162 431 aa15.62■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 RASEFQ8IZ41 740 aa15.62■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 FIBCD1Q8N539 461 aa15.62■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 BICD2Q8TD16 824 aa15.62■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 DNAJB3Q8WWF6 145 aa15.62■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 FTHL17Q9BXU8 183 aa15.62■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 SQORQ9Y6N5 450 aa15.62■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 UNC80Q8N2C7 3258 aa15.61■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 POTEB3A0JP26 581 aa15.61■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 MEIS1O00470 390 aa15.61■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 LPXNO60711 386 aa15.61■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 CHRNA1P02708 482 aa15.61■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 FUT2Q10981 343 aa15.61■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 TIGD5Q53EQ6 642 aa15.61■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 ODR4Q5SWX8 454 aa15.61■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 POTEBQ6S5H4 581 aa15.61■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 RUFY4Q6ZNE9 571 aa15.61■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa15.61■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 Q6ZUG5 572 aa15.61■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 PLA2G4DQ86XP0 818 aa15.61■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 NME8Q8N427 588 aa15.61■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 CDY2AQ9Y6F7 541 aa15.61■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 MICAL3Q7RTP6 2002 aa15.6■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 ESYT2A0FGR8 921 aa15.6■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 KCNQ1P51787 676 aa15.6■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 SETQ01105 290 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 APOBRQ0VD83 1088 aa15.6■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 GPM6BQ13491 265 aa15.6■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 EPC2Q52LR7 807 aa15.6■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa15.6■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 TMEM192Q8IY95 271 aa15.6■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 CCDC148Q8NFR7 591 aa15.6■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 BRF1Q92994 677 aa15.6■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 PGBD1Q96JS3 809 aa15.6■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 C17orf80Q9BSJ5 609 aa15.6■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 TBC1D22BQ9NU19 505 aa15.6■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 TELO2Q9Y4R8 837 aa15.6■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa15.6■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 PTPRSQ13332 1948 aa15.6■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 TTC28Q96AY4 2481 aa15.59■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 H3BNC9 293 aa15.59■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 HBP1O60381 514 aa15.59■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 RB1P06400 928 aa15.59■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 STAG3L1P0CL83 205 aa15.59■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 ARP10275 920 aa15.59■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 CDC27P30260 824 aa15.59■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 HSPA4P34932 840 aa15.59■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 ADD1P35611 737 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 LPIN1Q14693 890 aa15.59■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 PLCB4Q15147 1175 aa15.59■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 FBXO47Q5MNV8 452 aa15.59■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 MARCH8Q5T0T0 291 aa15.59■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa15.59■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 SPRED2Q7Z698 418 aa15.59■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 CKAP2LQ8IYA6 745 aa15.59■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 CYP2W1Q8TAV3 490 aa15.59■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa15.59■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 TMEM260Q9NX78 707 aa15.59■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 TRPV2Q9Y5S1 764 aa15.59■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 SIP14410 1827 aa15.59■□□□□ 0.09
GGA3-208ENST00000579743 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa15.58■□□□□ 0.08
GGA3-208ENST00000579743 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
GGA3-208ENST00000579743 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
GGA3-208ENST00000579743 NCK2O43639 380 aa15.58■□□□□ 0.08
GGA3-208ENST00000579743 ATG7O95352 703 aa15.58■□□□□ 0.08
GGA3-208ENST00000579743 CYP3A4P08684 503 aa15.58■□□□□ 0.08
GGA3-208ENST00000579743 CLK2P49760 499 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
GGA3-208ENST00000579743 MGAT3Q09327 533 aa15.58■□□□□ 0.08
GGA3-208ENST00000579743 PAK2Q13177 524 aa15.58■□□□□ 0.08
GGA3-208ENST00000579743 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
GGA3-208ENST00000579743 TYW1BQ6NUM6 668 aa15.58■□□□□ 0.08
GGA3-208ENST00000579743 PDXDC2PQ6P474 469 aa15.58■□□□□ 0.08
GGA3-208ENST00000579743 SKAP1Q86WV1 359 aa15.58■□□□□ 0.08
GGA3-208ENST00000579743 TRIM22Q8IYM9 498 aa15.58■□□□□ 0.08
GGA3-208ENST00000579743 FBXL16Q8N461 479 aa15.58■□□□□ 0.08
GGA3-208ENST00000579743 KCNB2Q92953 911 aa15.58■□□□□ 0.08
GGA3-208ENST00000579743 ZNF577Q9BSK1 485 aa15.58■□□□□ 0.08
GGA3-208ENST00000579743 ZMYND12Q9H0C1 365 aa15.58■□□□□ 0.08
GGA3-208ENST00000579743 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms