RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566452.1

BBS2-215, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 2, human

TSL 2

Gene BBS2, Length 299 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS2-215	ENST00000566452	CLEC1B	Q9P126	229 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	PIM2	Q9P1W9	311 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	KLHL33	A6NCF5	533 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	APAF1	O14727	1248 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	NPHP1	O15259	732 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	OFD1	O75665	1012 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	TCEA3	O75764	348 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	FGA	P02671	866 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	PRNP	P04156	253 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	AKAP5	P24588	427 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	LSP1	P33241	339 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	HSPA1L	P34931	641 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	PDE6B	P35913	854 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	PREP	P48147	710 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	TERF2	Q15554	542 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	ZNF174	Q15697	407 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	CRY1	Q16526	586 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	RASSF3	Q86WH2	238 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	GJA10	Q969M2	543 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	FCRL3	Q96P31	734 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	MMP19	Q99542	508 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	HDAC8	Q9BY41	377 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	IPPK	Q9H8X2	491 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	PTPRT	O14522	1441 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	AKNA	Q7Z591	1439 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	NEO1	Q92859	1461 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	PMM2	O15305	246 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	TGM5	O43548	720 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	EOMES	O95936	686 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	LCP1	P13796	627 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	PAM	P19021	973 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	ENDOU	P21128	410 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	TPP2	P29144	1249 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	SCAND1	P57086	179 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	ADCY1	Q08828	1119 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	ODF1	Q14990	250 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	CLUL1	Q15846	466 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	MSMP	Q1L6U9	139 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	ERAP2	Q6P179	960 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	PIWIL2	Q8TC59	973 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	TNIP3	Q96KP6	325 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	TEKT5	Q96M29	485 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452		Q96M66	194 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	SLC38A3	Q99624	504 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	SLC12A9	Q9BXP2	914 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	CSRNP2	Q9H175	543 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	PPCS	Q9HAB8	311 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	FAM50B	Q9Y247	325 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	HECW1	Q76N89	1606 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	SLC12A8	A0AV02	714 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	ARNTL	O00327	626 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BBS2-215	ENST00000566452	TBX3	O15119	743 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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