RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563952.1

CMTM4-204, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM4, Length 1,023 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM4-204ENST00000563952 ATG7O95352 703 aa34.87■■■■□ 3.17
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CMTM4-204ENST00000563952 LENG9Q96B70 501 aa34.87■■■■□ 3.17
CMTM4-204ENST00000563952 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa34.87■■■■□ 3.17
CMTM4-204ENST00000563952 GBF1Q92538 1859 aa34.86■■■■□ 3.17
CMTM4-204ENST00000563952 CXCL10P02778 98 aa34.86■■■■□ 3.17
CMTM4-204ENST00000563952 CTSHP09668 335 aa34.86■■■■□ 3.17
CMTM4-204ENST00000563952 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP34.86■■■■□ 3.17
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CMTM4-204ENST00000563952 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP34.85■■■■□ 3.17
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CMTM4-204ENST00000563952 KRT25Q7Z3Z0 450 aa34.85■■■■□ 3.17
CMTM4-204ENST00000563952 TUBE1Q9UJT0 475 aa34.85■■■■□ 3.17
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CMTM4-204ENST00000563952 FAM160B1Q5W0V3 765 aa34.84■■■■□ 3.17
CMTM4-204ENST00000563952 CNKSR3Q6P9H4 555 aa34.84■■■■□ 3.17
CMTM4-204ENST00000563952 RUFY4Q6ZNE9 571 aa34.84■■■■□ 3.17
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CMTM4-204ENST00000563952 CAND2O75155 1236 aa34.83■■■■□ 3.17
CMTM4-204ENST00000563952 BAIAP3O94812 1187 aa34.83■■■■□ 3.17
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CMTM4-204ENST00000563952 ZNF302Q9NR11 478 aa34.83■■■■□ 3.17
CMTM4-204ENST00000563952 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa34.83■■■■□ 3.17
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CMTM4-204ENST00000563952 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa34.82■■■■□ 3.16
CMTM4-204ENST00000563952 TDP2O95551 362 aa34.82■■■■□ 3.16
CMTM4-204ENST00000563952 KRT76Q01546 638 aa34.82■■■■□ 3.16
CMTM4-204ENST00000563952 INF2Q27J81 1249 aa34.82■■■■□ 3.16
CMTM4-204ENST00000563952 TCTN1Q2MV58 587 aa34.82■■■■□ 3.16
CMTM4-204ENST00000563952 MARCH8Q5T0T0 291 aa34.82■■■■□ 3.16
CMTM4-204ENST00000563952 SWSAP1Q6NVH7 229 aa34.82■■■■□ 3.16
CMTM4-204ENST00000563952 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP34.82■■■■□ 3.16
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CMTM4-204ENST00000563952 JAK2O60674 1132 aa34.81■■■■□ 3.16
CMTM4-204ENST00000563952 KCNJ6P48051 423 aa34.81■■■■□ 3.16
CMTM4-204ENST00000563952 TAF2Q6P1X5 1199 aa34.81■■■■□ 3.16
CMTM4-204ENST00000563952 PDXDC2PQ6P474 469 aa34.81■■■■□ 3.16
CMTM4-204ENST00000563952 POTEBQ6S5H4 581 aa34.81■■■■□ 3.16
CMTM4-204ENST00000563952 OXER1Q8TDS5 423 aa34.81■■■■□ 3.16
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CMTM4-204ENST00000563952 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa34.81■■■■□ 3.16
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CMTM4-204ENST00000563952 ST3GAL1Q11201 340 aa34.8■■■■□ 3.16
CMTM4-204ENST00000563952 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP34.8■■■■□ 3.16
CMTM4-204ENST00000563952 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa34.8■■■■□ 3.16
CMTM4-204ENST00000563952 GJA10Q969M2 543 aa34.8■■■■□ 3.16
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CMTM4-204ENST00000563952 LRCH2Q5VUJ6 765 aa34.78■■■■□ 3.16
CMTM4-204ENST00000563952 RSPH3Q86UC2 560 aa34.78■■■■□ 3.16
CMTM4-204ENST00000563952 CKAP2LQ8IYA6 745 aa34.78■■■■□ 3.16
CMTM4-204ENST00000563952 DNAJB3Q8WWF6 145 aa34.78■■■■□ 3.16
CMTM4-204ENST00000563952 SLC5A5Q92911 643 aa34.78■■■■□ 3.16
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CMTM4-204ENST00000563952 DBF4BQ8NFT6 615 aa34.77■■■■□ 3.16
CMTM4-204ENST00000563952 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa34.77■■■■□ 3.16
CMTM4-204ENST00000563952 RIT2Q99578 217 aa34.77■■■■□ 3.16
CMTM4-204ENST00000563952 TEKT3Q9BXF9 490 aa34.77■■■■□ 3.16
CMTM4-204ENST00000563952 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP34.77■■■■□ 3.16
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CMTM4-204ENST00000563952 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa34.76■■■■□ 3.16
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CMTM4-204ENST00000563952 GRIN2CQ14957 1233 aa34.76■■■■□ 3.16
CMTM4-204ENST00000563952 FAM26DQ5JW98 314 aa34.76■■■■□ 3.16
CMTM4-204ENST00000563952 MOXD1Q6UVY6 613 aa34.76■■■■□ 3.16
CMTM4-204ENST00000563952 ATP8B4Q8TF62 1192 aa34.76■■■■□ 3.16
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