RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	4.02	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	OR14A2	Q96R54	314 aa		4.02	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		4.02	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		4.02	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		4.02	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		4.02	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		4.02	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		4.02	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957		B2RBV5	119 aa		4.01	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	CDC14B	O60729	498 aa		4.01	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	NAT2	P11245	290 aa		4.01	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	KCNAB2	Q13303	367 aa		4.01	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	RNF151	Q2KHN1	245 aa		4.01	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	PHF19	Q5T6S3	580 aa		4.01	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		4.01	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	MRM1	Q6IN84	353 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		4.01	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF227	Q86WZ6	799 aa		4.01	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		4.01	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	BTN2A2	Q8WVV5	523 aa		4.01	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	DIO2	Q92813	273 aa		4.01	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	DPYSL5	Q9BPU6	564 aa		4.01	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		4.01	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		4.01	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	ANKRD62	A6NC57	917 aa		4	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957		H0Y858	1186 aa		4	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		4	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	MATN2	O00339	956 aa		4	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	SUSD5	O60279	629 aa		4	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	MAFK	O60675	156 aa		4	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	DGKI	O75912	1065 aa		4	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	SCG5	P05408	212 aa		4	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	ITGAV	P06756	1048 aa		4	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	TESK1	Q15569	626 aa		4	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		4	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		4	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		4	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		4	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		4	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		4	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	ARMC5	Q96C12	935 aa		4	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		4	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	EPB41L1	Q9H4G0	881 aa		4	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	TLR9	Q9NR96	1032 aa		4	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		4	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		4	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	ASH2L	Q9UBL3	628 aa		4	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		3.99	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	CUTA	O60888	179 aa		3.99	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	ERBB2	P04626	1255 aa		3.99	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	CKM	P06732	381 aa		3.99	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	ETFB	P38117	255 aa		3.99	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	C21orf58	P58505	322 aa		3.99	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	FOXL1	Q12952	345 aa		3.99	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	NFYC	Q13952	458 aa		3.99	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	SF1	Q15637	639 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		3.99	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		3.99	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	STPG3	Q8N7X2	389 aa		3.99	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	C1orf159	Q96HA4	380 aa		3.99	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		3.99	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		3.99	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		3.99	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	FGR	P09769	529 aa		3.98	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	PROZ	P22891	400 aa		3.98	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	POLD1	P28340	1107 aa		3.98	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	HOXC12	P31275	282 aa		3.98	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	GFRA1	P56159	465 aa		3.98	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	LSAMP	Q13449	338 aa		3.98	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	PRSS53	Q2L4Q9	553 aa		3.98	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	TNNI3K	Q59H18	835 aa		3.98	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		3.98	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		3.98	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		3.98	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	CAPN10	Q9HC96	672 aa		3.98	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		3.98	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	MASP2	O00187	686 aa		3.97	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	LCP1	P13796	627 aa		3.97	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	GJA4	P35212	333 aa		3.97	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	GLRB	P48167	497 aa		3.97	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
AKAP13-223	ENST00000560957	SV2C	Q496J9	727 aa		3.97	□□□□□ -1.77

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms