RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560557.1

FAM227B-211, Transcript of family with sequence similarity 227 member B, humanhuman

TSL 3

Gene FAM227B, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227B-211ENST00000560557 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
FAM227B-211ENST00000560557 LAIR1Q6GTX8 287 aa4.62□□□□□ -1.67
FAM227B-211ENST00000560557 GPR150Q8NGU9 434 aa4.62□□□□□ -1.67
FAM227B-211ENST00000560557 CHAMP1Q96JM3 812 aa4.62□□□□□ -1.67
FAM227B-211ENST00000560557 CCDC140Q96MF4 163 aa4.62□□□□□ -1.67
FAM227B-211ENST00000560557 ZNF408Q9H9D4 720 aa4.62□□□□□ -1.67
FAM227B-211ENST00000560557 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
FAM227B-211ENST00000560557 TMEM191CA6NGB0 347 aa4.61□□□□□ -1.67
FAM227B-211ENST00000560557 GJB6O95452 261 aa4.61□□□□□ -1.67
FAM227B-211ENST00000560557 ONECUT2O95948 504 aa4.61□□□□□ -1.67
FAM227B-211ENST00000560557 FGRP09769 529 aa4.61□□□□□ -1.67
FAM227B-211ENST00000560557 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
FAM227B-211ENST00000560557 GJA4P35212 333 aa4.61□□□□□ -1.67
FAM227B-211ENST00000560557 LTBRP36941 435 aa4.61□□□□□ -1.67
FAM227B-211ENST00000560557 GRIA2P42262 883 aa4.61□□□□□ -1.67
FAM227B-211ENST00000560557 LSAMPQ13449 338 aa4.61□□□□□ -1.67
FAM227B-211ENST00000560557 TESK1Q15569 626 aa4.61□□□□□ -1.67
FAM227B-211ENST00000560557 SLC10A6Q3KNW5 377 aa4.61□□□□□ -1.67
FAM227B-211ENST00000560557 SYCE2Q6PIF2 218 aa4.61□□□□□ -1.67
FAM227B-211ENST00000560557 ARRDC4Q8NCT1 418 aa4.61□□□□□ -1.67
FAM227B-211ENST00000560557 C1orf159Q96HA4 380 aa4.61□□□□□ -1.67
FAM227B-211ENST00000560557 ZNF652Q9Y2D9 606 aa4.61□□□□□ -1.67
FAM227B-211ENST00000560557 H7BY64 318 aa4.6□□□□□ -1.67
FAM227B-211ENST00000560557 HGSO14964 777 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
FAM227B-211ENST00000560557 LRG1P02750 347 aa4.6□□□□□ -1.67
FAM227B-211ENST00000560557 CAPNS1P04632 268 aa4.6□□□□□ -1.67
FAM227B-211ENST00000560557 TCF3P15923 654 aa4.6□□□□□ -1.67
FAM227B-211ENST00000560557 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
FAM227B-211ENST00000560557 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa4.6□□□□□ -1.67
FAM227B-211ENST00000560557 TMC5Q6UXY8 1006 aa4.6□□□□□ -1.67
FAM227B-211ENST00000560557 EEPD1Q7L9B9 569 aa4.6□□□□□ -1.67
FAM227B-211ENST00000560557 TINF2Q9BSI4 451 aa4.6□□□□□ -1.67
FAM227B-211ENST00000560557 CLDND1Q9NY35 253 aa4.6□□□□□ -1.67
FAM227B-211ENST00000560557 TCRBV5S2A0A599 114 aa4.59□□□□□ -1.67
FAM227B-211ENST00000560557 TADA3O75528 432 aa4.59□□□□□ -1.67
FAM227B-211ENST00000560557 LMNAP02545 664 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
FAM227B-211ENST00000560557 RAC3P60763 192 aa4.59□□□□□ -1.67
FAM227B-211ENST00000560557 PPP2R2AP63151 447 aa4.59□□□□□ -1.67
FAM227B-211ENST00000560557 ARID5AQ03989 594 aa4.59□□□□□ -1.67
FAM227B-211ENST00000560557 DUSP8Q13202 625 aa4.59□□□□□ -1.67
FAM227B-211ENST00000560557 STEAP3Q658P3 488 aa4.59□□□□□ -1.67
FAM227B-211ENST00000560557 MCF2L2Q86YR7 1114 aa4.59□□□□□ -1.67
FAM227B-211ENST00000560557 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa4.59□□□□□ -1.67
FAM227B-211ENST00000560557 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP4.59□□□□□ -1.67
FAM227B-211ENST00000560557 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
FAM227B-211ENST00000560557 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
FAM227B-211ENST00000560557 ST7Q9NRC1 585 aa4.59□□□□□ -1.67
FAM227B-211ENST00000560557 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
FAM227B-211ENST00000560557 OAZ3Q9UMX2 235 aa4.59□□□□□ -1.67
FAM227B-211ENST00000560557 PTPN22Q9Y2R2 807 aa4.59□□□□□ -1.67
FAM227B-211ENST00000560557 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa4.59□□□□□ -1.67
FAM227B-211ENST00000560557 A0A1W2PQU0 124 aa4.58□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 MSCO60682 206 aa4.58□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 CR2P20023 1033 aa4.58□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 CHRNA2Q15822 529 aa4.58□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 EMC4Q5J8M3 183 aa4.58□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 GAREM2Q75VX8 874 aa4.58□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 OR14A2Q96R54 314 aa4.58□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 IER2Q9BTL4 223 aa4.58□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 KATNBL1Q9H079 304 aa4.58□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 EPN3Q9H201 632 aa4.58□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 CDIP1Q9H305 208 aa4.58□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 RBPJLQ9UBG7 517 aa4.58□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa4.58□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 H0Y858 1186 aa4.57□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 AGRPO00253 132 aa4.57□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 DLX3O60479 287 aa4.57□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 DGKIO75912 1065 aa4.57□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 KNG1P01042 644 aa4.57□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 CDK4P11802 303 aa4.57□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 MAP4K2Q12851 820 aa4.57□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 PHF19Q5T6S3 580 aa4.57□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 KCTD13Q8WZ19 329 aa4.57□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 ZNF428Q96B54 188 aa4.57□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 DPYSL5Q9BPU6 564 aa4.57□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 JAM3Q9BX67 310 aa4.57□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 EPB41L1Q9H4G0 881 aa4.57□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 TLR9Q9NR96 1032 aa4.57□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 MYOTQ9UBF9 498 aa4.57□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 GCP02774 474 aa4.56□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 ANKS3Q6ZW76 656 aa4.56□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 USP53Q70EK8 1073 aa4.56□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 REXO1L1PQ8IX06 675 aa4.56□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 PHF20Q9BVI0 1012 aa4.56□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 SMOC1Q9H4F8 434 aa4.56□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 RIOX1Q9H6W3 641 aa4.56□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 GPR27Q9NS67 375 aa4.56□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 SLC27A2O14975 620 aa4.55□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 PEX11BO96011 259 aa4.55□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 CHGBP05060 677 aa4.55□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 USP10Q14694 798 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 DDR2Q16832 855 aa4.55□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 RNF151Q2KHN1 245 aa4.55□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 ZNF568Q3ZCX4 644 aa4.55□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 TMPRSS6Q8IU80 811 aa4.55□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms