RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559064.1

SEMA6D-211, Transcript of semaphorin 6D, humanhuman

TSL 3

Gene SEMA6D, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6D-211ENST00000559064 SH3RF2Q8TEC5 729 aa7.4□□□□□ -1.22
SEMA6D-211ENST00000559064 JADE2Q9NQC1 790 aa7.4□□□□□ -1.22
SEMA6D-211ENST00000559064 CBLCQ9ULV8 474 aa7.4□□□□□ -1.22
SEMA6D-211ENST00000559064 ZDHHC9Q9Y397 364 aa7.4□□□□□ -1.22
SEMA6D-211ENST00000559064 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa7.4□□□□□ -1.22
SEMA6D-211ENST00000559064 MAN2B1O00754 1011 aa7.39□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 LAMTOR5O43504 91 aa7.39□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 NPTXRO95502 500 aa7.39□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 ITGB3P05106 788 aa7.39□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 ZNF568Q3ZCX4 644 aa7.39□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa7.39□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 KBTBD2Q8IY47 623 aa7.39□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 STPG3Q8N7X2 389 aa7.39□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa7.39□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 WASF3Q9UPY6 502 aa7.39□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa7.38□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 B4E1Z4 1266 aa7.38□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa7.38□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 ACOT7O00154 380 aa7.38□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 HIP1RO75146 1068 aa7.38□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 JAM2P57087 298 aa7.38□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 PHF19Q5T6S3 580 aa7.38□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 REXO1L1PQ8IX06 675 aa7.38□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 PLD2O14939 933 aa7.37□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 B4GALT3O60512 393 aa7.37□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 RASGRP1O95267 797 aa7.37□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 KNG1P01042 644 aa7.37□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 AMY2AP04746 511 aa7.37□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 ADRB1P08588 477 aa7.37□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 AMY2BP19961 511 aa7.37□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 HERVK_113P62684 666 aa7.37□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 EFEMP1Q12805 493 aa7.37□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 PKN3Q6P5Z2 889 aa7.37□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 HHIPL2Q6UWX4 724 aa7.37□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 Q6ZUG5 572 aa7.37□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 BRAPQ7Z569 592 aa7.37□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 SLC39A2Q9NP94 309 aa7.37□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 KCND1Q9NSA2 647 aa7.37□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 ADAM29Q9UKF5 820 aa7.37□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa7.36□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 FAM90A27PA6NNH2 459 aa7.36□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 KCNQ2O43526 872 aa7.36□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 CUTAO60888 179 aa7.36□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 CHST13Q8NET6 341 aa7.36□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 NUDT10Q8NFP7 164 aa7.36□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 SLC7A14Q8TBB6 771 aa7.36□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 NUDT11Q96G61 164 aa7.36□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 LOXL4Q96JB6 756 aa7.36□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 SMURF1Q9HCE7 757 aa7.36□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 SMPD4Q9NXE4 827 aa7.36□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 COQ6Q9Y2Z9 468 aa7.36□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 B4GALT4O60513 344 aa7.35□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 KLHL18O94889 574 aa7.35□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 COL6A1P12109 1028 aa7.35□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 PTGS1P23219 599 aa7.35□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 PPP2CBP62714 309 aa7.35□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 PPP2CAP67775 309 aa7.35□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 WDR72Q3MJ13 1102 aa7.35□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 DBX2Q6ZNG2 339 aa7.35□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 LILRB2Q8N423 598 aa7.35□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 C2orf69Q8N8R5 385 aa7.35□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 MBD6Q96DN6 1003 aa7.35□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 SAMD11Q96NU1 681 aa7.35□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 INCENPQ9NQS7 918 aa7.35□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 FBXO10Q9UK96 956 aa7.35□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa7.34□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 SLC12A8A0AV02 714 aa7.34□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 SCDO00767 359 aa7.34□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 AOAHP28039 575 aa7.34□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 FLT3P36888 993 aa7.34□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 TTC9BQ8N6N2 239 aa7.34□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 AJUBAQ96IF1 538 aa7.34□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 GPR20Q99678 358 aa7.34□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 KCNH7Q9NS40 1196 aa7.34□□□□□ -1.23
SEMA6D-211ENST00000559064 KCNK3O14649 394 aa7.33□□□□□ -1.24
SEMA6D-211ENST00000559064 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SEMA6D-211ENST00000559064 POLD1P28340 1107 aa7.33□□□□□ -1.24
SEMA6D-211ENST00000559064 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SEMA6D-211ENST00000559064 USP10Q14694 798 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SEMA6D-211ENST00000559064 ARHGAP44Q17R89 818 aa7.33□□□□□ -1.24
SEMA6D-211ENST00000559064 SLFN13Q68D06 897 aa7.33□□□□□ -1.24
SEMA6D-211ENST00000559064 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SEMA6D-211ENST00000559064 IGSF22Q8N9C0 903 aa7.33□□□□□ -1.24
SEMA6D-211ENST00000559064 SCLYQ96I15 445 aa7.33□□□□□ -1.24
SEMA6D-211ENST00000559064 CARD11Q9BXL7 1154 aa7.33□□□□□ -1.24
SEMA6D-211ENST00000559064 GALNT8Q9NY28 637 aa7.33□□□□□ -1.24
SEMA6D-211ENST00000559064 ESYT3A0FGR9 886 aa7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.7 ms