RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558300.1

TMOD3-202, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 2

Gene TMOD3, Length 430 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-202ENST00000558300 APBA2Q99767 749 aa5.18□□□□□ -1.58
TMOD3-202ENST00000558300 CSRNP2Q9H175 543 aa5.18□□□□□ -1.58
TMOD3-202ENST00000558300 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
TMOD3-202ENST00000558300 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
TMOD3-202ENST00000558300 KCND1Q9NSA2 647 aa5.18□□□□□ -1.58
TMOD3-202ENST00000558300 SNTG2Q9NY99 539 aa5.18□□□□□ -1.58
TMOD3-202ENST00000558300 MYOTQ9UBF9 498 aa5.18□□□□□ -1.58
TMOD3-202ENST00000558300 PRKAB1Q9Y478 270 aa5.18□□□□□ -1.58
TMOD3-202ENST00000558300 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa5.17□□□□□ -1.58
TMOD3-202ENST00000558300 MYO1BO43795 1136 aa5.17□□□□□ -1.58
TMOD3-202ENST00000558300 KIAA1211LQ6NV74 962 aa5.17□□□□□ -1.58
TMOD3-202ENST00000558300 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
TMOD3-202ENST00000558300 VOPP1Q96AW1 172 aa5.17□□□□□ -1.58
TMOD3-202ENST00000558300 LRRC37BQ96QE4 947 aa5.17□□□□□ -1.58
TMOD3-202ENST00000558300 RBPJLQ9UBG7 517 aa5.17□□□□□ -1.58
TMOD3-202ENST00000558300 ASH2LQ9UBL3 628 aa5.17□□□□□ -1.58
TMOD3-202ENST00000558300 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
TMOD3-202ENST00000558300 MRVI1Q9Y6F6 885 aa5.17□□□□□ -1.58
TMOD3-202ENST00000558300 C1SP09871 688 aa5.16□□□□□ -1.58
TMOD3-202ENST00000558300 ACO1P21399 889 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
TMOD3-202ENST00000558300 ACRV1P26436 265 aa5.16□□□□□ -1.58
TMOD3-202ENST00000558300 HOXC12P31275 282 aa5.16□□□□□ -1.58
TMOD3-202ENST00000558300 LSAMPQ13449 338 aa5.16□□□□□ -1.58
TMOD3-202ENST00000558300 POLNQ7Z5Q5 900 aa5.16□□□□□ -1.58
TMOD3-202ENST00000558300 IFNL2Q8IZJ0 200 aa5.16□□□□□ -1.58
TMOD3-202ENST00000558300 AGAP2Q99490 1192 aa5.16□□□□□ -1.58
TMOD3-202ENST00000558300 EPB41L1Q9H4G0 881 aa5.16□□□□□ -1.58
TMOD3-202ENST00000558300 FAM221BA6H8Z2 402 aa5.15□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 NOP56O00567 594 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 RAB11FIP3O75154 756 aa5.15□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 DGKIO75912 1065 aa5.15□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 NAT2P11245 290 aa5.15□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 ANAPC15P60006 121 aa5.15□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 VASNQ6EMK4 673 aa5.15□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 VHLLQ6RSH7 139 aa5.15□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 C1orf210Q8IVY1 113 aa5.15□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 TRIM48Q8IWZ4 208 aa5.15□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 ANAPC16Q96DE5 110 aa5.15□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 SPC25Q9HBM1 224 aa5.15□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 MSL2Q9HCI7 577 aa5.15□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 IFT57Q9NWB7 429 aa5.15□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa5.15□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 MAFKO60675 156 aa5.14□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 DNAJC6O75061 913 aa5.14□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 CAPNS1P04632 268 aa5.14□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 FBLP22087 321 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 LTBRP36941 435 aa5.14□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 RASGRF1Q13972 1273 aa5.14□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 USP10Q14694 798 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 SCUBE1Q8IWY4 988 aa5.14□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 JMYQ8N9B5 988 aa5.14□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 FAM89AQ96GI7 184 aa5.14□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 CCDC140Q96MF4 163 aa5.14□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 OAZ3Q9UMX2 235 aa5.14□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa5.14□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 DMRT1Q9Y5R6 373 aa5.14□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 PPFIA2O75334 1257 aa5.13□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 CPP00450 1065 aa5.13□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 RAC3P60763 192 aa5.13□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 COL10A1Q03692 680 aa5.13□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 Q6ZPA2 131 aa5.13□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 GPR155Q7Z3F1 870 aa5.13□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 MRGPRGQ86SM5 289 aa5.13□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 LILRB2Q8N423 598 aa5.13□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 CLEC4DQ8WXI8 215 aa5.13□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 APPBP2Q92624 585 aa5.13□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 ZG16BQ96DA0 208 aa5.13□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 CRAMP1Q96RY5 1269 aa5.13□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 PRRX2Q99811 253 aa5.13□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 SLC6A20Q9NP91 592 aa5.13□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 PCDH12Q9NPG4 1184 aa5.13□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 MATN2O00339 956 aa5.12□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 PDPK1O15530 556 aa5.12□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 MARCH6O60337 910 aa5.12□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 CDC45O75419 566 aa5.12□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 CKMP06732 381 aa5.12□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 LCP1P13796 627 aa5.12□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 CR2P20023 1033 aa5.12□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 TUBA3CQ13748 450 aa5.12□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 DDR2Q16832 855 aa5.12□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 SKIDA1Q1XH10 827 aa5.12□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 DENND5AQ6IQ26 1287 aa5.12□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 TUBA3EQ6PEY2 450 aa5.12□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa5.12□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 HOMER1Q86YM7 354 aa5.12□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 ULK2Q8IYT8 1036 aa5.12□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 FAM169BQ8N8A8 192 aa5.12□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa5.12□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 SH3TC2Q8TF17 1288 aa5.12□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 C1orf159Q96HA4 380 aa5.12□□□□□ -1.59
TMOD3-202ENST00000558300 DNAJC7Q99615 494 aa5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms