RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557092.5

NEDD1-209, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 1, humanhuman

TSL 4

Gene NEDD1, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1-209ENST00000557092 DEFB103AP81534 67 aa20.92■□□□□ 0.94
NEDD1-209ENST00000557092 TAF2Q6P1X5 1199 aa20.92■□□□□ 0.94
NEDD1-209ENST00000557092 ZNF577Q9BSK1 485 aa20.92■□□□□ 0.94
NEDD1-209ENST00000557092 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
NEDD1-209ENST00000557092 BACH1O14867 736 aa20.91■□□□□ 0.94
NEDD1-209ENST00000557092 TLL1O43897 1013 aa20.91■□□□□ 0.94
NEDD1-209ENST00000557092 CDKL5O76039 1030 aa20.91■□□□□ 0.94
NEDD1-209ENST00000557092 STAT5BP51692 787 aa20.91■□□□□ 0.94
NEDD1-209ENST00000557092 SCRN1Q12765 414 aa20.91■□□□□ 0.94
NEDD1-209ENST00000557092 PTPRSQ13332 1948 aa20.91■□□□□ 0.94
NEDD1-209ENST00000557092 PRR16Q569H4 304 aa20.91■□□□□ 0.94
NEDD1-209ENST00000557092 RUFY4Q6ZNE9 571 aa20.91■□□□□ 0.94
NEDD1-209ENST00000557092 RSPH3Q86UC2 560 aa20.91■□□□□ 0.94
NEDD1-209ENST00000557092 DBF4BQ8NFT6 615 aa20.91■□□□□ 0.94
NEDD1-209ENST00000557092 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
NEDD1-209ENST00000557092 ZBED2Q9BTP6 218 aa20.91■□□□□ 0.94
NEDD1-209ENST00000557092 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa20.91■□□□□ 0.94
NEDD1-209ENST00000557092 PCDHA4Q9UN74 947 aa20.91■□□□□ 0.94
NEDD1-209ENST00000557092 CDH23Q9H251 3354 aa20.9■□□□□ 0.94
NEDD1-209ENST00000557092 RRN3P2A6NIE6 340 aa20.9■□□□□ 0.94
NEDD1-209ENST00000557092 CCNE2O96020 404 aa20.9■□□□□ 0.94
NEDD1-209ENST00000557092 INSRRP14616 1297 aa20.9■□□□□ 0.94
NEDD1-209ENST00000557092 PLCB4Q15147 1175 aa20.9■□□□□ 0.94
NEDD1-209ENST00000557092 ANKRD1Q15327 319 aa20.9■□□□□ 0.94
NEDD1-209ENST00000557092 FAM160B1Q5W0V3 765 aa20.9■□□□□ 0.94
NEDD1-209ENST00000557092 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa20.9■□□□□ 0.94
NEDD1-209ENST00000557092 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
NEDD1-209ENST00000557092 SEPT8Q92599 483 aa20.9■□□□□ 0.94
NEDD1-209ENST00000557092 TBC1D22BQ9NU19 505 aa20.9■□□□□ 0.94
NEDD1-209ENST00000557092 TPCN1Q9ULQ1 816 aa20.9■□□□□ 0.94
NEDD1-209ENST00000557092 ATG7O95352 703 aa20.89■□□□□ 0.93
NEDD1-209ENST00000557092 CIITAP33076 1130 aa20.89■□□□□ 0.93
NEDD1-209ENST00000557092 AK2P54819 239 aa20.89■□□□□ 0.93
NEDD1-209ENST00000557092 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa20.89■□□□□ 0.93
NEDD1-209ENST00000557092 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa20.89■□□□□ 0.93
NEDD1-209ENST00000557092 AIFM3Q96NN9 605 aa20.89■□□□□ 0.93
NEDD1-209ENST00000557092 C22orf23Q9BZE7 217 aa20.89■□□□□ 0.93
NEDD1-209ENST00000557092 POTEB3A0JP26 581 aa20.88■□□□□ 0.93
NEDD1-209ENST00000557092 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
NEDD1-209ENST00000557092 DHX15O43143 795 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
NEDD1-209ENST00000557092 PFKFB2O60825 505 aa20.88■□□□□ 0.93
NEDD1-209ENST00000557092 IGFBP4P22692 258 aa20.88■□□□□ 0.93
NEDD1-209ENST00000557092 FAM26DQ5JW98 314 aa20.88■□□□□ 0.93
NEDD1-209ENST00000557092 MARCH8Q5T0T0 291 aa20.88■□□□□ 0.93
NEDD1-209ENST00000557092 FAM117BQ6P1L5 589 aa20.88■□□□□ 0.93
NEDD1-209ENST00000557092 POTEBQ6S5H4 581 aa20.88■□□□□ 0.93
NEDD1-209ENST00000557092 ABHD15Q6UXT9 468 aa20.88■□□□□ 0.93
NEDD1-209ENST00000557092 BLIDQ8IZY5 108 aa20.88■□□□□ 0.93
NEDD1-209ENST00000557092 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa20.88■□□□□ 0.93
NEDD1-209ENST00000557092 DNAJB3Q8WWF6 145 aa20.88■□□□□ 0.93
NEDD1-209ENST00000557092 ZBTB10Q96DT7 871 aa20.88■□□□□ 0.93
NEDD1-209ENST00000557092 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
NEDD1-209ENST00000557092 CERS4Q9HA82 394 aa20.88■□□□□ 0.93
NEDD1-209ENST00000557092 ZNF302Q9NR11 478 aa20.88■□□□□ 0.93
NEDD1-209ENST00000557092 CHD9Q3L8U1 2897 aa20.87■□□□□ 0.93
NEDD1-209ENST00000557092 AMHP03971 560 aa20.87■□□□□ 0.93
NEDD1-209ENST00000557092 SLC26A2P50443 739 aa20.87■□□□□ 0.93
NEDD1-209ENST00000557092 PDXDC2PQ6P474 469 aa20.87■□□□□ 0.93
NEDD1-209ENST00000557092 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP20.87■□□□□ 0.93
NEDD1-209ENST00000557092 RPAINQ86UA6 219 aa20.87■□□□□ 0.93
NEDD1-209ENST00000557092 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
NEDD1-209ENST00000557092 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP20.87■□□□□ 0.93
NEDD1-209ENST00000557092 MYOCDQ8IZQ8 938 aa20.87■□□□□ 0.93
NEDD1-209ENST00000557092 TBCKQ8TEA7 893 aa20.87■□□□□ 0.93
NEDD1-209ENST00000557092 OSBPL7Q9BZF2 842 aa20.87■□□□□ 0.93
NEDD1-209ENST00000557092 STK36Q9NRP7 1315 aa20.86■□□□□ 0.93
NEDD1-209ENST00000557092 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa20.86■□□□□ 0.93
NEDD1-209ENST00000557092 GJB5O95377 273 aa20.86■□□□□ 0.93
NEDD1-209ENST00000557092 CHRNA1P02708 482 aa20.86■□□□□ 0.93
NEDD1-209ENST00000557092 GHRP10912 638 aa20.86■□□□□ 0.93
NEDD1-209ENST00000557092 USP11P51784 963 aa20.86■□□□□ 0.93
NEDD1-209ENST00000557092 KRT76Q01546 638 aa20.86■□□□□ 0.93
NEDD1-209ENST00000557092 ADGRE1Q14246 886 aa20.86■□□□□ 0.93
NEDD1-209ENST00000557092 GALNT17Q6IS24 598 aa20.86■□□□□ 0.93
NEDD1-209ENST00000557092 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
NEDD1-209ENST00000557092 SWSAP1Q6NVH7 229 aa20.86■□□□□ 0.93
NEDD1-209ENST00000557092 CKAP2LQ8IYA6 745 aa20.86■□□□□ 0.93
NEDD1-209ENST00000557092 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
NEDD1-209ENST00000557092 DAGLBQ8NCG7 672 aa20.86■□□□□ 0.93
NEDD1-209ENST00000557092 PPM1EQ8WY54 764 aa20.86■□□□□ 0.93
NEDD1-209ENST00000557092 APBB2Q92870 758 aa20.86■□□□□ 0.93
NEDD1-209ENST00000557092 LENG9Q96B70 501 aa20.86■□□□□ 0.93
NEDD1-209ENST00000557092 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
NEDD1-209ENST00000557092 KCNJ14Q9UNX9 436 aa20.86■□□□□ 0.93
NEDD1-209ENST00000557092 SAMM50Q9Y512 469 aa20.86■□□□□ 0.93
NEDD1-209ENST00000557092 MICAL3Q7RTP6 2002 aa20.86■□□□□ 0.93
NEDD1-209ENST00000557092 LCHNA4D1U4 455 aa20.85■□□□□ 0.93
NEDD1-209ENST00000557092 HBP1O60381 514 aa20.85■□□□□ 0.93
NEDD1-209ENST00000557092 DTNBO60941 627 aa20.85■□□□□ 0.93
NEDD1-209ENST00000557092 ARHGEF15O94989 841 aa20.85■□□□□ 0.93
NEDD1-209ENST00000557092 SEC24BO95487 1268 aa20.85■□□□□ 0.93
NEDD1-209ENST00000557092 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
NEDD1-209ENST00000557092 XBP1P17861 261 aa20.85■□□□□ 0.93
NEDD1-209ENST00000557092 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
NEDD1-209ENST00000557092 TAP1Q03518 808 aa20.85■□□□□ 0.93
NEDD1-209ENST00000557092 MGAT3Q09327 533 aa20.85■□□□□ 0.93
NEDD1-209ENST00000557092 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
NEDD1-209ENST00000557092 ATP8B4Q8TF62 1192 aa20.85■□□□□ 0.93
NEDD1-209ENST00000557092 ARNTL2Q8WYA1 636 aa20.85■□□□□ 0.93
NEDD1-209ENST00000557092 CDY2AQ9Y6F7 541 aa20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.2 ms