RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555690.5

PPP4R4-204, Transcript of protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, human

TSL 3

Gene PPP4R4, Length 680 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4R4-204	ENST00000555690		H3BNC9	293 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PPP4R4-204	ENST00000555690	INSRR	P14616	1297 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PPP4R4-204	ENST00000555690	GPM6B	Q13491	265 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PPP4R4-204	ENST00000555690	AZI2	Q9H6S1	392 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PPP4R4-204	ENST00000555690	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PPP4R4-204	ENST00000555690	STXBP3	O00186	592 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PPP4R4-204	ENST00000555690	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	27.92	■■■□□ 2.06
PPP4R4-204	ENST00000555690	AR	P10275	920 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PPP4R4-204	ENST00000555690	ADCY7	P51828	1080 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PPP4R4-204	ENST00000555690	PTPRO	Q16827	1216 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PPP4R4-204	ENST00000555690	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PPP4R4-204	ENST00000555690	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PPP4R4-204	ENST00000555690	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PPP4R4-204	ENST00000555690	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	27.92	■■■□□ 2.06
PPP4R4-204	ENST00000555690	IL17RA	Q96F46	866 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PPP4R4-204	ENST00000555690	SDF4	Q9BRK5	362 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PPP4R4-204	ENST00000555690	ANO3	Q9BYT9	981 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PPP4R4-204	ENST00000555690	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	27.92	■■■□□ 2.06
PPP4R4-204	ENST00000555690	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PPP4R4-204	ENST00000555690	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PPP4R4-204	ENST00000555690	SMCO2	A6NFE2	343 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PPP4R4-204	ENST00000555690	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PPP4R4-204	ENST00000555690	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PPP4R4-204	ENST00000555690	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PPP4R4-204	ENST00000555690	ENPP3	O14638	875 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PPP4R4-204	ENST00000555690	KCNA5	P22460	613 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PPP4R4-204	ENST00000555690	ACTR2	P61160	394 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PPP4R4-204	ENST00000555690	CEP55	Q53EZ4	464 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PPP4R4-204	ENST00000555690	TMEM260	Q9NX78	707 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PPP4R4-204	ENST00000555690	TRPC6	Q9Y210	931 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PPP4R4-204	ENST00000555690	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
PPP4R4-204	ENST00000555690	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	27.9	■■■□□ 2.06
PPP4R4-204	ENST00000555690	FIBCD1	Q8N539	461 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PPP4R4-204	ENST00000555690	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	27.9	■■■□□ 2.06
PPP4R4-204	ENST00000555690	BARHL2	Q9NY43	387 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PPP4R4-204	ENST00000555690	NFASC	O94856	1347 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PPP4R4-204	ENST00000555690	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		27.89	■■■□□ 2.06
PPP4R4-204	ENST00000555690	CDC27	P30260	824 aa		27.89	■■■□□ 2.06
PPP4R4-204	ENST00000555690	PLCB4	Q15147	1175 aa		27.89	■■■□□ 2.06
PPP4R4-204	ENST00000555690	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		27.89	■■■□□ 2.06
PPP4R4-204	ENST00000555690	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	27.89	■■■□□ 2.06
PPP4R4-204	ENST00000555690	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		27.89	■■■□□ 2.06
PPP4R4-204	ENST00000555690	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		27.89	■■■□□ 2.06
PPP4R4-204	ENST00000555690	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		27.89	■■■□□ 2.06
PPP4R4-204	ENST00000555690	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.06
PPP4R4-204	ENST00000555690	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	27.89	■■■□□ 2.06
PPP4R4-204	ENST00000555690	COL4A6	Q14031	1691 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP4R4-204	ENST00000555690	CDC45	O75419	566 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP4R4-204	ENST00000555690	STAT5B	P51692	787 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP4R4-204	ENST00000555690	KRT32	Q14532	448 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP4R4-204	ENST00000555690	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP4R4-204	ENST00000555690	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP4R4-204	ENST00000555690	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP4R4-204	ENST00000555690	BANK1	Q8NDB2	785 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP4R4-204	ENST00000555690	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
PPP4R4-204	ENST00000555690	MYO7A	Q13402	2215 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP4R4-204	ENST00000555690	MEIS1	O00470	390 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PPP4R4-204	ENST00000555690	CD52	P31358	61 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PPP4R4-204	ENST00000555690	CTNNB1	P35222	781 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PPP4R4-204	ENST00000555690	SREBF1	P36956	1147 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PPP4R4-204	ENST00000555690	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PPP4R4-204	ENST00000555690	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PPP4R4-204	ENST00000555690	IER5	Q5VY09	327 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PPP4R4-204	ENST00000555690	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05
PPP4R4-204	ENST00000555690	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	27.87	■■■□□ 2.05
PPP4R4-204	ENST00000555690	CPA1	P15085	419 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP4R4-204	ENST00000555690	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
PPP4R4-204	ENST00000555690	ZNF76	P36508	570 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP4R4-204	ENST00000555690	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
PPP4R4-204	ENST00000555690	FGD1	P98174	961 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP4R4-204	ENST00000555690	AP3B2	Q13367	1082 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP4R4-204	ENST00000555690	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP4R4-204	ENST00000555690	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP4R4-204	ENST00000555690	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
PPP4R4-204	ENST00000555690	CD320	Q9NPF0	282 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP4R4-204	ENST00000555690	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP4R4-204	ENST00000555690	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP4R4-204	ENST00000555690	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PPP4R4-204	ENST00000555690	POTEB3	A0JP26	581 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PPP4R4-204	ENST00000555690	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
PPP4R4-204	ENST00000555690	ATG7	O95352	703 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PPP4R4-204	ENST00000555690	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
PPP4R4-204	ENST00000555690	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
PPP4R4-204	ENST00000555690	LINC00271	P0C7V0	271 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PPP4R4-204	ENST00000555690	BMPR1A	P36894	532 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PPP4R4-204	ENST00000555690	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PPP4R4-204	ENST00000555690	POTEB	Q6S5H4	581 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PPP4R4-204	ENST00000555690	LINC01599	Q8WXQ3	324 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PPP4R4-204	ENST00000555690	TTC3	P53804	2025 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PPP4R4-204	ENST00000555690		M0QZ92	97 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PPP4R4-204	ENST00000555690	CCNE2	O96020	404 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PPP4R4-204	ENST00000555690	RCAN1	P53805	252 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PPP4R4-204	ENST00000555690	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	27.84	■■■□□ 2.05
PPP4R4-204	ENST00000555690	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	27.84	■■■□□ 2.05
PPP4R4-204	ENST00000555690	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
PPP4R4-204	ENST00000555690	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PPP4R4-204	ENST00000555690	FAM86B1	E9PN63	330 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PPP4R4-204	ENST00000555690	C5orf67	F2Z3F1	127 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PPP4R4-204	ENST00000555690	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PPP4R4-204	ENST00000555690	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	27.83	■■■□□ 2.05

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