RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555436.1

CBLN3-202, Transcript of cerebellin 3 precursor, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CBLN3, Length 718 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLN3-202ENST00000555436 GBF1Q92538 1859 aa22.15■■□□□ 1.14
CBLN3-202ENST00000555436 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa22.14■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 ARHGEF15O94989 841 aa22.14■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 ATG7O95352 703 aa22.14■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 GJB5O95377 273 aa22.14■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 IGFBP4P22692 258 aa22.14■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 MARCH8Q5T0T0 291 aa22.14■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 RUFY4Q6ZNE9 571 aa22.14■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 TRIM22Q8IYM9 498 aa22.14■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 SEPT8Q92599 483 aa22.14■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 PDRG1Q9NUG6 133 aa22.14■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 VPS54Q9P1Q0 977 aa22.14■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 RRN3P2A6NIE6 340 aa22.13■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 CPLX1O14810 134 aa22.13■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 CCNE2O96020 404 aa22.13■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 INSRRP14616 1297 aa22.13■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 STAT5BP51692 787 aa22.13■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 OSBPL7Q9BZF2 842 aa22.13■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa22.13■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa22.12■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 DHX15O43143 795 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 CHRNA1P02708 482 aa22.12■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 SLC26A2P50443 739 aa22.12■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 SETQ01105 290 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 PLCB4Q15147 1175 aa22.12■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 RSPH3Q86UC2 560 aa22.12■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 RASGRP4Q8TDF6 673 aa22.12■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 RAD9AQ99638 391 aa22.12■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 TRPC6Q9Y210 931 aa22.12■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 MYO9BQ13459 2157 aa22.12■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 LCHNA4D1U4 455 aa22.11■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 AMHP03971 560 aa22.11■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 CIITAP33076 1130 aa22.11■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 IGBP1P78318 339 aa22.11■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 ABHD15Q6UXT9 468 aa22.11■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 CERS4Q9HA82 394 aa22.11■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 TBC1D22BQ9NU19 505 aa22.11■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 CUL9Q8IWT3 2517 aa22.11■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 DEXIO95424 95 aa22.1■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 NLRP5P59047 1200 aa22.1■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 ANAPC15P60006 121 aa22.1■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 MGAT3Q09327 533 aa22.1■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 STK3Q13188 491 aa22.1■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 DNAJB3Q8WWF6 145 aa22.1■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 PPM1EQ8WY54 764 aa22.1■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 ARNTL2Q8WYA1 636 aa22.1■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 APBB2Q92870 758 aa22.1■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 ZNF577Q9BSK1 485 aa22.1■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 POTEB3A0JP26 581 aa22.09■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 EPOPA6NHQ4 379 aa22.09■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 PRR16Q569H4 304 aa22.09■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 FAM160B1Q5W0V3 765 aa22.09■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 FAM117BQ6P1L5 589 aa22.09■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 POTEBQ6S5H4 581 aa22.09■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 MYOCDQ8IZQ8 938 aa22.09■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 RFXAPO00287 272 aa22.08■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 BACH1O14867 736 aa22.08■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa22.08■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 SPRED2Q7Z698 418 aa22.08■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 LENG9Q96B70 501 aa22.08■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 ZBTB10Q96DT7 871 aa22.08■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 UIMC1Q96RL1 719 aa22.08■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 PCDHA4Q9UN74 947 aa22.08■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 INSL6Q9Y581 213 aa22.08■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa22.08■■□□□ 1.13
CBLN3-202ENST00000555436 EDIL3O43854 480 aa22.07■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 GHRP10912 638 aa22.07■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 USP11P51784 963 aa22.07■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 LPIN1Q14693 890 aa22.07■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 ATP8B4Q8TF62 1192 aa22.07■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa22.07■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 ZNF302Q9NR11 478 aa22.07■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 PTPRSQ13332 1948 aa22.07■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 LINC01553A4QN01 128 aa22.06■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 HBP1O60381 514 aa22.06■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 KRT76Q01546 638 aa22.06■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 SCRN1Q12765 414 aa22.06■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 FBXO47Q5MNV8 452 aa22.06■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 SWSAP1Q6NVH7 229 aa22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.9 ms