RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551206.5

USP15-217, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 2

Gene USP15, Length 1,022 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-217ENST00000551206 AFAP1L1Q8TED9 768 aa14.79□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 HERVK_113Q902F9 699 aa14.79□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 GJA10Q969M2 543 aa14.79□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 LENG9Q96B70 501 aa14.79□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 TBC1D22BQ9NU19 505 aa14.79□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa14.79□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 NRCAMQ92823 1304 aa14.78□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 ZBBXA8MT70 800 aa14.78□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 GRXCR1A8MXD5 290 aa14.78□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 MSH4O15457 936 aa14.78□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 LGR5O75473 907 aa14.78□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 TDP2O95551 362 aa14.78□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 RFC2P35250 354 aa14.78□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 RABEP1Q15276 862 aa14.78□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 ZNF618Q5T7W0 954 aa14.78□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 SWSAP1Q6NVH7 229 aa14.78□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa14.78□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 DEFB123Q8N688 67 aa14.78□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 LMBR1Q8WVP7 490 aa14.78□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 TRPC6Q9Y210 931 aa14.78□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 SAMM50Q9Y512 469 aa14.78□□□□□ -0.04
USP15-217ENST00000551206 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 ATG7O95352 703 aa14.77□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 INSRRP14616 1297 aa14.77□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 HOXC8P31273 242 aa14.77□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 TRIM29Q14134 588 aa14.77□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 GPNMBQ14956 572 aa14.77□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 GRIK4Q16099 956 aa14.77□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 LETM2Q2VYF4 491 aa14.77□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa14.77□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 ABHD15Q6UXT9 468 aa14.77□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa14.77□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 ZBTB10Q96DT7 871 aa14.77□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 FAM161BQ96MY7 647 aa14.77□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa14.77□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 EMSYQ7Z589 1322 aa14.76□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa14.76□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 RSPH10B2B2RC85 870 aa14.76□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 GAS7O60861 476 aa14.76□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 NBNO60934 754 aa14.76□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 PFKMP08237 780 aa14.76□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 CTSHP09668 335 aa14.76□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 RSPH10BP0C881 870 aa14.76□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 ACTN1P12814 892 aa14.76□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 CYP3A7P24462 503 aa14.76□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 KRT2P35908 639 aa14.76□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 ADAM17P78536 824 aa14.76□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 GUCY1B3Q02153 619 aa14.76□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 NR5A1Q13285 461 aa14.76□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 PLCB4Q15147 1175 aa14.76□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 Q4G0T1 1027 aa14.76□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 RASIP1Q5U651 963 aa14.76□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 FAM160B1Q5W0V3 765 aa14.76□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 PDXDC2PQ6P474 469 aa14.76□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 CKAP2LQ8IYA6 745 aa14.76□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 BRMS1Q9HCU9 246 aa14.76□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 ZNF302Q9NR11 478 aa14.76□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa14.76□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 SZT2Q5T011 3432 aa14.76□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa14.75□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 POTEB3A0JP26 581 aa14.75□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 FAM205CA6NFA0 338 aa14.75□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 BTBD18B2RXH4 712 aa14.75□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 CHMP2AO43633 222 aa14.75□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 ST18O60284 1047 aa14.75□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 PSAPP07602 524 aa14.75□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 PBX2P40425 430 aa14.75□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 KRT76Q01546 638 aa14.75□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 RBL2Q08999 1139 aa14.75□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 MARCH8Q5T0T0 291 aa14.75□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 LRCH2Q5VUJ6 765 aa14.75□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 KRT40Q6A162 431 aa14.75□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 GPR153Q6NV75 609 aa14.75□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 TRAF7Q6Q0C0 670 aa14.75□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 POTEBQ6S5H4 581 aa14.75□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 RUFY4Q6ZNE9 571 aa14.75□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 NEK8Q86SG6 692 aa14.75□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa14.75□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 SLC5A5Q92911 643 aa14.75□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 METRNQ9UJH8 293 aa14.75□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 TUBE1Q9UJT0 475 aa14.75□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa14.75□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
USP15-217ENST00000551206 RRN3P2A6NIE6 340 aa14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms