RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550734.5

CS-221, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-221ENST00000550734 LINC00271P0C7V0 271 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-221ENST00000550734 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-221ENST00000550734 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-221ENST00000550734 NEDD9Q14511 834 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-221ENST00000550734 FAM26DQ5JW98 314 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-221ENST00000550734 PPP1R18Q6NYC8 613 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-221ENST00000550734 APBB2Q92870 758 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-221ENST00000550734 FBXL18Q96ME1 805 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-221ENST00000550734 TCEANC2Q96MN5 208 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-221ENST00000550734 UIMC1Q96RL1 719 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-221ENST00000550734 NID2Q14112 1375 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 MAFGO15525 162 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 LGALS2P05162 132 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 PSMA5P28066 241 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 ADAM17P78536 824 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 SEMA3FQ13275 785 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 METTL7BQ6UX53 244 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 CCDC82Q8N4S0 544 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP13.2□□□□□ -0.37e-8■■■□□ 18
CS-221ENST00000550734 GPRASP2Q96D09 838 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 CDHR1Q96JP9 859 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 USP26Q9BXU7 913 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 GLT8D2Q9H1C3 349 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 BCAS3Q9H6U6 928 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 MLXIPQ9HAP2 919 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 GOLGA8AA7E2F4 631 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 GOLGA8BA8MQT2 603 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 SORBS3O60504 671 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 UPP2O95045 317 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 FOSP01100 380 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 GNAT1P11488 350 aa13.19□□□□□ -0.3
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CS-221ENST00000550734 CDC27P30260 824 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 IRS1P35568 1242 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 WWC2Q6AWC2 1192 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 Q6ZUG5 572 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 RPAINQ86UA6 219 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 NLRX1Q86UT6 975 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 IL17RAQ96F46 866 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 TM6SF1Q9BZW5 370 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 LMAN2LQ9H0V9 348 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 RIC8AQ9NPQ8 531 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 CLDND1Q9NY35 253 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 BARHL2Q9NY43 387 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 V9GY48 417 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 TECTAO75443 2155 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 SPDYE3A6NKU9 549 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 STXBP3O00186 592 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 CTSHP09668 335 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 CPA1P15085 419 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 ADD1P35611 737 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 BMPR1AP36894 532 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 FGD1P98174 961 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 TYW1BQ6NUM6 668 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 HFE2Q6ZVN8 426 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 FIBCD1Q8N539 461 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 BRF1Q92994 677 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 SETD4Q9NVD3 440 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 RTEL1Q9NZ71 1219 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 PCDHA6Q9UN73 950 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 RWDD3Q9Y3V2 267 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 DOCK5Q9H7D0 1870 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 KAT6AQ92794 2004 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 TTC3P53804 2025 aa13.17□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 ESYT2A0FGR8 921 aa13.17□□□□□ -0.3
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CS-221ENST00000550734 ITGB5P18084 799 aa13.17□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP13.17□□□□□ -0.36e-6■■■□□ 15.4
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CS-221ENST00000550734 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 APOBRQ0VD83 1088 aa13.17□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 HYAL1Q12794 435 aa13.17□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 EP400NLQ6ZTU2 488 aa13.17□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 RUFY3Q7L099 469 aa13.17□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 CYFIP1Q7L576 1253 aa13.17□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 MFSD14AQ96MC6 490 aa13.17□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 GPR20Q99678 358 aa13.17□□□□□ -0.3
CS-221ENST00000550734 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
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