RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550724.2

HECTD4-212, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 3

Gene HECTD4, Length 587 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4-212ENST00000550724 SH3GLB2Q9NR46 395 aa16.44■□□□□ 0.22
HECTD4-212ENST00000550724 TUBE1Q9UJT0 475 aa16.44■□□□□ 0.22
HECTD4-212ENST00000550724 TPCN1Q9ULQ1 816 aa16.44■□□□□ 0.22
HECTD4-212ENST00000550724 SCN5AQ14524 2016 aa16.43■□□□□ 0.22
HECTD4-212ENST00000550724 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa16.43■□□□□ 0.22
HECTD4-212ENST00000550724 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa16.43■□□□□ 0.22
HECTD4-212ENST00000550724 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
HECTD4-212ENST00000550724 CCNE2O96020 404 aa16.43■□□□□ 0.22
HECTD4-212ENST00000550724 AK2P54819 239 aa16.43■□□□□ 0.22
HECTD4-212ENST00000550724 ANAPC15P60006 121 aa16.43■□□□□ 0.22
HECTD4-212ENST00000550724 SCRN1Q12765 414 aa16.43■□□□□ 0.22
HECTD4-212ENST00000550724 PLCB4Q15147 1175 aa16.43■□□□□ 0.22
HECTD4-212ENST00000550724 FAM160B1Q5W0V3 765 aa16.43■□□□□ 0.22
HECTD4-212ENST00000550724 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
HECTD4-212ENST00000550724 RSPH3Q86UC2 560 aa16.43■□□□□ 0.22
HECTD4-212ENST00000550724 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa16.43■□□□□ 0.22
HECTD4-212ENST00000550724 DNAJB3Q8WWF6 145 aa16.43■□□□□ 0.22
HECTD4-212ENST00000550724 SEPT8Q92599 483 aa16.43■□□□□ 0.22
HECTD4-212ENST00000550724 OSBPL7Q9BZF2 842 aa16.43■□□□□ 0.22
HECTD4-212ENST00000550724 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
HECTD4-212ENST00000550724 PCDHA4Q9UN74 947 aa16.43■□□□□ 0.22
HECTD4-212ENST00000550724 CAND2O75155 1236 aa16.42■□□□□ 0.22
HECTD4-212ENST00000550724 CDKL5O76039 1030 aa16.42■□□□□ 0.22
HECTD4-212ENST00000550724 ADAM17P78536 824 aa16.42■□□□□ 0.22
HECTD4-212ENST00000550724 SETQ01105 290 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
HECTD4-212ENST00000550724 ANKRD1Q15327 319 aa16.42■□□□□ 0.22
HECTD4-212ENST00000550724 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
HECTD4-212ENST00000550724 SWSAP1Q6NVH7 229 aa16.42■□□□□ 0.22
HECTD4-212ENST00000550724 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa16.42■□□□□ 0.22
HECTD4-212ENST00000550724 TAF2Q6P1X5 1199 aa16.42■□□□□ 0.22
HECTD4-212ENST00000550724 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP16.42■□□□□ 0.223e-6■□□□□ 11.3
HECTD4-212ENST00000550724 MICALL1Q8N3F8 863 aa16.42■□□□□ 0.22
HECTD4-212ENST00000550724 CRYGNQ8WXF5 182 aa16.42■□□□□ 0.22
HECTD4-212ENST00000550724 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
HECTD4-212ENST00000550724 ZNF302Q9NR11 478 aa16.42■□□□□ 0.22
HECTD4-212ENST00000550724 KCNJ14Q9UNX9 436 aa16.42■□□□□ 0.22
HECTD4-212ENST00000550724 DOCK5Q9H7D0 1870 aa16.42■□□□□ 0.22
HECTD4-212ENST00000550724 POTEB3A0JP26 581 aa16.41■□□□□ 0.22
HECTD4-212ENST00000550724 RRN3P2A6NIE6 340 aa16.41■□□□□ 0.22
HECTD4-212ENST00000550724 RFXAPO00287 272 aa16.41■□□□□ 0.22
HECTD4-212ENST00000550724 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
HECTD4-212ENST00000550724 EFCAB14O75071 495 aa16.41■□□□□ 0.22
HECTD4-212ENST00000550724 SEC24BO95487 1268 aa16.41■□□□□ 0.22
HECTD4-212ENST00000550724 AMHP03971 560 aa16.41■□□□□ 0.22
HECTD4-212ENST00000550724 GHRP10912 638 aa16.41■□□□□ 0.22
HECTD4-212ENST00000550724 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa16.41■□□□□ 0.22
HECTD4-212ENST00000550724 MARCH8Q5T0T0 291 aa16.41■□□□□ 0.22
HECTD4-212ENST00000550724 PDXDC2PQ6P474 469 aa16.41■□□□□ 0.22
HECTD4-212ENST00000550724 POTEBQ6S5H4 581 aa16.41■□□□□ 0.22
HECTD4-212ENST00000550724 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa16.41■□□□□ 0.22
HECTD4-212ENST00000550724 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP16.41■□□□□ 0.22
HECTD4-212ENST00000550724 CKAP2LQ8IYA6 745 aa16.41■□□□□ 0.22
HECTD4-212ENST00000550724 MYOCDQ8IZQ8 938 aa16.41■□□□□ 0.22
HECTD4-212ENST00000550724 BLIDQ8IZY5 108 aa16.41■□□□□ 0.22
HECTD4-212ENST00000550724 NECAB1Q8N987 351 aa16.41■□□□□ 0.22
HECTD4-212ENST00000550724 TBCKQ8TEA7 893 aa16.41■□□□□ 0.22
HECTD4-212ENST00000550724 ARNTL2Q8WYA1 636 aa16.41■□□□□ 0.22
HECTD4-212ENST00000550724 TBC1D22BQ9NU19 505 aa16.41■□□□□ 0.22
HECTD4-212ENST00000550724 SAMM50Q9Y512 469 aa16.41■□□□□ 0.22
HECTD4-212ENST00000550724 TANC1Q9C0D5 1861 aa16.41■□□□□ 0.22
HECTD4-212ENST00000550724 DHX15O43143 795 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
HECTD4-212ENST00000550724 CHMP2AO43633 222 aa16.4■□□□□ 0.22
HECTD4-212ENST00000550724 PFKFB2O60825 505 aa16.4■□□□□ 0.22
HECTD4-212ENST00000550724 ARHGEF15O94989 841 aa16.4■□□□□ 0.22
HECTD4-212ENST00000550724 CHRNA1P02708 482 aa16.4■□□□□ 0.22
HECTD4-212ENST00000550724 NEK4P51957 841 aa16.4■□□□□ 0.22
HECTD4-212ENST00000550724 TMEM62Q0P6H9 643 aa16.4■□□□□ 0.22
HECTD4-212ENST00000550724 ADGRE1Q14246 886 aa16.4■□□□□ 0.22
HECTD4-212ENST00000550724 ABHD15Q6UXT9 468 aa16.4■□□□□ 0.22
HECTD4-212ENST00000550724 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
HECTD4-212ENST00000550724 LCHNA4D1U4 455 aa16.39■□□□□ 0.21
HECTD4-212ENST00000550724 UPP2O95045 317 aa16.39■□□□□ 0.21
HECTD4-212ENST00000550724 ATG7O95352 703 aa16.39■□□□□ 0.21
HECTD4-212ENST00000550724 CIITAP33076 1130 aa16.39■□□□□ 0.21
HECTD4-212ENST00000550724 TAP1Q03518 808 aa16.39■□□□□ 0.21
HECTD4-212ENST00000550724 FAM26DQ5JW98 314 aa16.39■□□□□ 0.21
HECTD4-212ENST00000550724 GJA10Q969M2 543 aa16.39■□□□□ 0.21
HECTD4-212ENST00000550724 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
HECTD4-212ENST00000550724 C22orf23Q9BZE7 217 aa16.39■□□□□ 0.21
HECTD4-212ENST00000550724 MTUS1Q9ULD2 1270 aa16.39■□□□□ 0.21
HECTD4-212ENST00000550724 CDY2AQ9Y6F7 541 aa16.39■□□□□ 0.21
HECTD4-212ENST00000550724 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
HECTD4-212ENST00000550724 M0QZ92 97 aa16.38■□□□□ 0.21
HECTD4-212ENST00000550724 MSH4O15457 936 aa16.38■□□□□ 0.21
HECTD4-212ENST00000550724 GAS7O60861 476 aa16.38■□□□□ 0.21
HECTD4-212ENST00000550724 GJB5O95377 273 aa16.38■□□□□ 0.21
HECTD4-212ENST00000550724 TDP2O95551 362 aa16.38■□□□□ 0.21
HECTD4-212ENST00000550724 PSAPP07602 524 aa16.38■□□□□ 0.21
HECTD4-212ENST00000550724 XBP1P17861 261 aa16.38■□□□□ 0.21
HECTD4-212ENST00000550724 SLC26A2P50443 739 aa16.38■□□□□ 0.21
HECTD4-212ENST00000550724 USP11P51784 963 aa16.38■□□□□ 0.21
HECTD4-212ENST00000550724 FOSBP53539 338 aa16.38■□□□□ 0.21
HECTD4-212ENST00000550724 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
HECTD4-212ENST00000550724 KRT76Q01546 638 aa16.38■□□□□ 0.21
HECTD4-212ENST00000550724 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
HECTD4-212ENST00000550724 MTHFD1LQ6UB35 978 aa16.38■□□□□ 0.21
HECTD4-212ENST00000550724 SPRED2Q7Z698 418 aa16.38■□□□□ 0.21
HECTD4-212ENST00000550724 USP38Q8NB14 1042 aa16.38■□□□□ 0.21
HECTD4-212ENST00000550724 ATP8B4Q8TF62 1192 aa16.38■□□□□ 0.21
HECTD4-212ENST00000550724 RAD9AQ99638 391 aa16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms