RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 HSD17B4P51659 736 aa11.08□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 NHLH1Q02575 133 aa11.08□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 TNFAIP2Q03169 654 aa11.08□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 FUT2Q10981 343 aa11.08□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 GNASQ5JWF2 1037 aa11.08□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 ARHGEF16Q5VV41 709 aa11.08□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 TAPT1Q6NXT6 567 aa11.08□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa11.08□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 PARP9Q8IXQ6 854 aa11.08□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 DNERQ8NFT8 737 aa11.08□□□□□ -0.64
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CS-217ENST00000550044 B4DLN1 442 aa11.07□□□□□ -0.64
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CS-217ENST00000550044 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 SMPD1P17405 629 aa11.07□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
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CS-217ENST00000550044 USP17L6PQ6QN14 398 aa11.07□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP11.07□□□□□ -0.643e-10■■■■□ 21.5
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CS-217ENST00000550044 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa11.07□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 NR3C2P08235 984 aa11.06□□□□□ -0.64
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CS-217ENST00000550044 RCAN1P53805 252 aa11.06□□□□□ -0.64
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CS-217ENST00000550044 GJA9P57773 515 aa11.06□□□□□ -0.64
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CS-217ENST00000550044 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 SEPT14Q6ZU15 432 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 SAMD3Q8N6K7 520 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 PHKBQ93100 1093 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 SCLYQ96I15 445 aa11.06□□□□□ -0.64
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CS-217ENST00000550044 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 PSTPIP2Q9H939 334 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 VTA1Q9NP79 307 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 PXMP2Q9NR77 195 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 SCN5AQ14524 2016 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 MYH6P13533 1939 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 MEIS2O14770 477 aa11.05□□□□□ -0.64
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CS-217ENST00000550044 GHRHRQ02643 423 aa11.05□□□□□ -0.64
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CS-217ENST00000550044 STXBP2Q15833 593 aa11.05□□□□□ -0.64
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CS-217ENST00000550044 WWC2Q6AWC2 1192 aa11.05□□□□□ -0.64
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CS-217ENST00000550044 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 CUL5Q93034 780 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 FBXL18Q96ME1 805 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 IWS1Q96ST2 819 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 PDCD2LQ9BRP1 358 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 AP5M1Q9H0R1 490 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 TRPV6Q9H1D0 765 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 LCTP09848 1927 aa11.05□□□□□ -0.64
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CS-217ENST00000550044 SMCO2A6NFE2 343 aa11.04□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 CTAGE5O15320 804 aa11.04□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 B4GALT4O60513 344 aa11.04□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 TXNP10599 105 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
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CS-217ENST00000550044 AK2P54819 239 aa11.04□□□□□ -0.64
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CS-217ENST00000550044 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 TAP1Q03518 808 aa11.04□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 GRB10Q13322 594 aa11.04□□□□□ -0.64
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CS-217ENST00000550044 COPS5Q92905 334 aa11.04□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 VWCEQ96DN2 955 aa11.04□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 TRAIPQ9BWF2 469 aa11.04□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 SLC26A6Q9BXS9 759 aa11.04□□□□□ -0.64
CS-217ENST00000550044 RTEL1Q9NZ71 1219 aa11.04□□□□□ -0.64
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